Ailesel hiperkolesterolemili hastalarda LDL reseptör geninin 3 numaralı ekzonundaki mutasyonların SSCP yöntemiyle taranması
Screening of patients with familial hypercholesterolemia for mutations in exon 3 of the low density lipoprotein receptor gene by single strand
- Tez No: 107601
- Danışmanlar: PROF.DR. GÜVEN LÜLECİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Ailesel hiperkolesterolemi, moleküler genetik, SSCP, Familial hypercholesterolemia, molecular genetics, SSCP
- Yıl: 2000
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 1277
Özet
ÖZET Ailesel hiperkolesterolemi (Familial Hypercholesterolemia, FH), otozomal dominant kalıtım gösteren, heterozigot bireylerde 1/500, homozigot bireylerde 1/1000000 sıklıkla görülen yaygın genetik hastalıklardan biridir. Düşük yoğunluklu lipoprotein (LDL) tarafından taşınan plazma kolesterolünün yükselmesiyle karakterizedir. Plazma LDL- kolesterol seviyesinin artması sonucu kolesterolün aşın depolanmasından kaynaklanan ciltte ve tendonlarda ksantoma oluşumu ve prematüre aterosklerozis gerçekleşmektedir. Genel hastalık belirtilerinin şiddetinde, mutant allelin heterozigot ya da homozigot durumda oluşuna bağlı olarak farklılık görülür. Kolesterol metabolizmasında hayati rol oynayan LDLR (low density lipoprotein receptor) geninde meydana gelen mutasyonlar ailesel hiperkolesterolemiye neden olmaktadır. LDLR geni 19 numaralı kromozomun pl3. 1-13.3 bölgesinde lokalizedir.18 ekzon 17 intron içeren 45kb.lik bu gen 839 aminoasitten oluşan olgun bir protein kodlar. Moleküler tarama yöntemlerinden SSCP, HA, DGGE, RFLP ve DNA dizi analizi teknikleri kullanılarak bugüne kadar bu gen üzerinde 500'den fazla insersiyon, delesyon, anlamsız ve yanlış anlamlı mutasyon saptanmıştır. Çalışmamızda, laboratuvar ve klinik bulguları ailesel hiperkolesterolemi ile uyum gösteren 32 hastanın DNA'sı izole edildikten sonra LDLR geninin 3 numaralı ekzonuna özgü primerler kullanılarak PCR ve nonradyoaktif SSCP teknikleriyle mutasyon taraması yapılmıştır. Sonuçta 10 ve 15 numaralı olgularda hafif, 18 ve 19 numaralı olgularda ise bariz band kayması gözlenmiş kesin sonuç için dizi analizi yapılması kararlaştırılmış, diğer olgular ise normal bulunmuştur. Çalışmamızda, SSCP tekniğinin bu hastalık için standardizasyonu yapıldığından aynı hastalarda diğer ekzonlarda mutasyon taramasına devam edilecektir.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT Familial hypercholesterolemia (FH) is a common autosomal dominant disease, heterozygous form of which affects 1 in 500 people in population, while the incidence of its homozygous form is given as 1/1.000.000. It is characterized by elevated levels of plasma cholesterol carried by low density lipoprotein(LDL). As a result of excess storage of cholesterol due to the elevation of plasma LDL-cholesterol level, xanthoma appears on skin and tendons and premature atherosclerosis is observed. The severity of the disease in general differs depending on the mutant allele being homozygous or heterozygous. Mutations in the LDLR (low density lipoprotein receptor) gene, which plays a crucial role in cholesterol metabolism, lead to familial hypercholesterolemia. LDLR gene is localized on chromosome 19pl3.1- 13.3 and consists of 18 exons and 17 introns spanning 45 kb., coding for a mature protein consisting of 839 amino acids. More than 500 insertions, deletions, nonsense and missense mutations have been detected on this gene by SSCP, HA, DGGE, RFLP and DNA sequence analysis to date. In our investigation, DNA isolation was performed from patients whose laboratory and clinical findings were in accordance with FH and mutation screening by PCR and nonradioactive SSCP analysis was done using primers specific for exon 3 of LDLR gene. As a result, mild band shift in patients 10 and 15 and prominent band shift in patients 18 and 19 was observed and sequence analysis was decided to be performed. Other patients were detected to be normal. As we have performed the standardization of SSCP technique in our study, extensive mutation screening in other exons in the some patients will follow.
Benzer Tezler
- Ailesel hiperkolesterolemili hastalarda LDL reseptör (LDRL), apolipoprotein-B100 (APO-b100) ve proprotein convertase subtilin kexin 9 (PCSK9) gen mutasyonlarının tespiti
Başlık çevirisi yok
FATİH KARDAŞ
Tıpta Yan Dal Uzmanlık
Türkçe
2013
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıErciyes ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA KENDİRCİ
- Ailesel hiperkolesterolemili çocuk hastaların kardiyovasküler değerlendirilmesi
Cardiovascular assessment of pediatric patients with familial hypercholesterolemia
GÖRKEM ABDİKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıHacettepe ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TEVFİK KARAGÖZ
- Ailesel hiperkolesterolemi hastalarında tiyol disülfit dengesi
Thiol disulfide balance in patients with familial hypercholesterolemia
ÖZGÜR ŞİMŞEK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE ÇARLIOĞLU
- Ailesel hiperlipidemili olgularda fenotip genotip ilişkisi
The relationship between phenotype and genotype in familial hyperlipidemia cases
YUSUF DURANAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıGaziantep ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET KESKİN
- LDLR geni mutasyonu bulunan Türk ailesel hiperkolesterolemi hastalarında, PCSK9 ve APOB gen mutasyonu varlığı
Presence of PCSK9 ve APOB gene mutation of LDLR gene mutation positive Turkish familial hypercholesterolemia patients
MÜGE BİLGİN