Geri Dön

Türkiye'de yetişen Carlina L. (Asteraceae,Cardueae) türlerinin morfolojik ve moleküler filogenetik analizi

Morphology and moleculer phylogenetic analysis of the taxa belonging to the genus Carlina L. (Asteraceae,Cardueae ) in Turkey

PDF İndir

  1. Tez No: 299326
  2. Yazar: BERNA SANÖN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. BAYRAM YILDIZ, YRD. DOÇ. DR. FATİH COŞKUN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Balıkesir Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 197

Özet

Asteraceae bir bitki grubu olarak; doğal kimyası, çiçeklenme morfolojisi, habitata adaptasyonu ile kozmopolit bir familyadır. Birçok taksonomik ve yeni moleküler filogenetik çalışmalar olmasına rağmen, Asteraceae familyasının kökeni tamamen tanımlanamamıştır. Çalışma materyali olan Carlina L. cinsi Asteraceae familyasının Carduoideae subfamilyasının Cardueae tribusune dahildir. Cardueae tribusu tartışmalı bir gruptur ve geleneksel sınıflamada 4 alttribus'a (Echinopsidinae, Carlininae, Carduinae ve Centaurenae) ayrılır. Carlina cinsi Türkiye Florasında C. lanata, C.vulgaris, C.tragacanthifolia, C. biebersteinii, C. intermedia, C. oligocephala, C. involucrata subsp. libanotica, C. corymbosa, C.graeca türleriyle temsil edilmektedir.Bu çalışmada Fenol-Kloroform-İzoamilalkol metodu kullanılarak, Türkiye'deki Carlina taksonları iç grup olarak ve Atractylis, Cardopatium ve Carthamus taksonları dış grup olarak seçilerek DNA izolasyonu yapıldı. Literatürde sıklıkla kullanılan güvenilirliği kanıtlanmış ITS (Internal Transcribed Spacer) nükleer ribozomal DNA (nrDNA)) bölgesinin dizileri ve trnL-F (Transfer Kloroplast'ın tRNA'larını kodlayan L-F bölgesi) bölgesinin dizilerinin moleküler işaretleyici olarak kullanımıyla Carlina cinsine ait Türkiye de yetişen taksonlarının morfolojik ve moleküler filogenetik analizi yapıldı. Yapılan filogenetik analiz için elde edilen dizilerin işlenmesinde Sequencher 4.10.1 programı, dizilerin hizalanmasında ClustalW programı ve filogenetik analiz için PAUP 4.0b10 programı kullanılmıştır. Karakter temelli yöntemlerden Maksimum Parsimoni kriteri kullanılarak Heuristic araştırma yapılmıştır ve ortak karar uyumluluk (konsensus) ağaçları oluşturulmuştur. Yine parsimoni kriteri kullanılarak Bootstrap analizi yapılmıştır. Mesafe temelli yöntemlerden ise UPGMA (Unweighted Pair-Group Metod of Arithmetic Avarage) ve NJ (Neighbour Joining) analizleri yapılmıştır.Daha önce yapılan çalışmalarda; Carlina, Cardopatium ve Atractylis cinsleri Carlininae alt tribusuna da yer almıştır. Elde edilen veriler bu çalışmaları desteklemektedir.ANAHTAR SÖZCÜKLER: Asteraceae:Cardueae/ ITS/ trnL-F/ morfoloji/ filogenetik analiz

Özet (Çeviri)

Asteraceae, as a plant group, is a cosmopolitan family in terms of natural chemistry, flowering morphology, and adaptation to habitat. Even if there are numerous taxonomic and new molecular phylogenetic studies, the ancestors of the Asteraceae family are not well defined. Study material under consideration, Carlina L., is a member of the tribe Cardueae which belong to Carduoideae subfamily of the Asteraceae. The tribe Cardueae is a group still debated and according to traditional classification it can be divided into 4 subtribes (Echinopsidinae, Carlininae, Carduinae and Centaurenae ). The genus Carlina is represented by the species in The Flora of Turkey and The East Aegean Island as C. lanata, C. vulgaris, C. tragacanthifolia, C. biebersteinii, C. intermedia, C. oligocephala, C. involucrata subsp. libanotica, C. corymbosa, C.graeca.DNA Isolation was performed using phenol- chloroform- isoamylalcohol, slecting Carlina as ingroup taxa and Cardopatium, Atractylis and Carthamus as outgroup taxa ITS (Internal Transcribed Region) of the nuclear ribosomal DNA(nrDNA) and the trnL-F (Transfer RNA coding) region of the chloroplast DNA sequences which were used as molecular markers, taxa belonging to the genus Carlina distrubuted in Turkey were analyzed morphologically and molecular phylogenetically. Before the phylogenetic analysis, DNA sequences were aligmend using the sequences 4.10.1 the sequences were aligmend using the ClustalW and the phylogenetic analysis was performed using the PAUP 4.0b10 sofware. The character based method parsimony was used as the critesion with a heuristic search option and the Maximum Parsimony criterion was based on the character and the public by using Heuristic methods to research decision (consensus) trees was created. Again using the Bootstrap analysis have been made to the criterion of parsimony. Distance-based methods, the UPGMA (Unweighted Pair Group Method of Arithmetic Average) and NJ (Neighbour Joining) analyses were made. In studies done before Carlina, Cardopatium ve Atractylis has taken Carlininae subtribus. The work of resulting data support it.KEYWORDS:Asteraceae: Cardueae/ITS/trnL-F/morphology/phylogenetic analysis

Benzer Tezler

  1. Tez No

    373226

    Türkiye'de yetişen Inula L. (Asteraceae) türlerinin moleküler sistematik analizi ve ekolojisi

    Molecular systematic analysis and ecology Inula L. (Asteraceae) taxa distributed in Turkey

    EMRE SEVİNDİK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    BiyolojiBalıkesir Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. FATİH COŞKUN

  2. Tez No

    353491

    Türkiye'deki Rosa L. cinsine ait bazı eski bahçe güllerinin polen morfolojisi

    The polen morphology of some old garden roses belongi̇ng to Rosa L. (Rosaceae) genus i̇n Turkey

    ZEHRA KESKİNOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BotanikSüleyman Demirel Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ALİ İNCE

  3. Tez No

    414282

    Türkiye'de yetişen Oxytropis DC. (Fabaceae) cinsinin, altcins Oxytropis ve Euoxytropis boiss. türlerinin gövde ve yaprak anatomik özelliklerinin incelenmesi ve bunların taksonomik önemi

    Stem and leaf anatomical properties of the genus Oxytropis DC. (Fabaceae), subgenus Oxytropis and Euoxytropis boiss. and their taxonomic implications

    TOLGA PELİT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    AnatomiNevşehir Hacı Bektaş Veli Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FERHAT CELEP

  4. Tez No

    414287

    Türkiye'de yetişen Oxytropis DC. (Fabaceae) cinsinin, altcins Phacoxytropis bunge. türlerinin gövde ve yaprak anatomik özelliklerinin incelenmesi ve bunların taksonomik önemi

    Stem and leaf anatomical properties of the genus Oxytropis DC. (Fabaceae), subgenus Phacoxytropis bunge and their taxonomic implications

    ASİYE ÖZDEMİR ŞAŞKIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    AnatomiNevşehir Hacı Bektaş Veli Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FERHAT CELEP

  5. Tez No

    417233

    Türkiye'de yetişen bazı lathyrus taksonları üzerinde farmakognozik araştırmalar

    Başlık çevirisi yok

    HAJAR HEYDARİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Farmakognozi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAYRİYE GÜLÇİN SALTAN

Geri Dön