Mersin'de avlanan Mullus spp.'de Mycobacterium spp. varlığı ve mikrobiyal yükün araştırılması
Investigation of presence of Mycobacterium spp. and microbial load in Mullus spp. fished in Mersin/Turkey
- Tez No: 317886
- Danışmanlar: PROF. DR. FERİT RAD
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Su Ürünleri, Microbiology, Aquatic Products
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Su Ürünleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 117
Özet
Ülkemizde gıda güvenliği bağlamında balıklarla ilgili mikrobiyolojik çalışmalar daha çok yetiştiriciliği yapılan türler üzerinde yoğunlaşmakta olup, avcılık yolu ile elde edilen türlerde yapılan araştırmalar sınırlıdır. Bu çalışmada, ihtyozoonotik etkiye sahip Mycobacterium spp. varlığı, ülkemizde özellikle Akdeniz ve Ege denizinde yaygın olarak avlanan Mullus cinsi balıklarda araştırılmıştır. Ayrıca, genel mikrobiyal yüklerinin belirlenmesi amacıyla balıkların deri, kas ve iç organlarında toplam mezofilik ve psikrofilik aerobik bakteri ve koliform bakteri sayımları yapılmıştır.Çalışma kapsamında Mersin İlinde Merkez-Karaduvar, Anamur ve Taşucu'nda faaliyet gösteren balıkçılardan temin edilen toplam 208 adet balık örneği kullanılmıştır. Mycobacterium spp. izolasyonu klasik yöntemlerle gerçekleştirilmiş, izolatlar PZR (polimeraz zincir reaksiyonu) ile cins düzeyinde ve PZR-RLFP (restriction fragment length polymorphism) ile de tür düzeyinde identifiye edilmiştir. Toplam mezofilik ve psikrofilik aerobik bakteri ve toplam koliform bakteri sayımları klasik yöntemlerle yapılmıştır.Toplam 13 adet balık örneğinde (% 6,25) 6 farklı türden 13 adet mikobakteri tanımlanmıştır. Bu mikobakterilerin 4'ü M. genavense, 3'ü M. fortuitum, 3'ü M. scrofulaceum, biri M. marinum, biri M. vaccae, biri M. aurum olarak belirlenmiştir. İzolatların 12'si balık örneklerinin derisinden, biri de iç organlarından izole edilmiştir. Mikobakterilerin tespit edildiği balık örneklerinde hastalık bulgusuna rastlanmamıştır.Toplam 208 adet balıkta toplam mikrobiyal yükün ortalama değerleri, mezofilik aerobik bakteri sayısı için deri örneklerinde 1,62x107 kob/g, kas örneklerinde 4,83x105 kob/g ve iç organlarda 2,60x106 kob/g; psikrofilik aerobik bakteri sayıları sırasıyla 9,10x106, 4,44x105 ve 4,49x105 kob/g ve toplam koliform bakteri sayıları ise sırasıyla 3,95x105, 1,83x 104 ve 1,86x105 kob/g olarak belirlenmiştir.Mikrobiyal yükün standartların üzerinde olması ve 13 örnekte Mycobacterium spp. tespit edilmesi daha ayrıntılı araştırmaların yapılması için zemin oluşturmaktadır.
Özet (Çeviri)
Microbial studies associated with food safety issues are mainly focused on farmed fish and thereby scarce for wild fish in Turkey. Presence of ichtiyozoonotic Mycrobacterium spp. in Mullus spp., a widely caught species in Mediterranean and Aegean Sea, was investigated in this study. Total mesophilic and psychrophilic aerobic bacteria and coliform bacteria were further counted in skin, muscle and internal organs to determine the general bacterial loads in fish.To this end 208 fish samples, collected from fishermen in Centrum-Karaduvar, Anamur and Taşucu in Mersin province (Turkey), were studied. Mycobacterium spp. were isolated using conventional methods and identified at genus level with PCR (polymerase chain reaction) and at species level with PCR-RFLP (restriction fragment length polymorphism). Conventional methods were used for total mesophilic and psychrophilic aerobic bacteria and total coliform bacteria counts.A total of 13 mycobacteria (6.25 %) of six different species were detected in 13 fish samples. Of these, four were identified as M. genavense, 3 as M. fortuitum, 3 as M. scrofulaceum, one as M. marinum, one as M. vaccae and one was found to be as M. aurum. These mycobacteria were isolated from the skin (12) and internal organs (1) of sampled fish. No diseases symptoms were observed in fish samples infected by Mycobacterium spp.Mean values of total microbial loads of total 208 fish were determined as following; for mesophilic aerobic bacteria in skin as 1.62x107 cfu/g, in muscle as 4.83x105 cfu/g and in internal organs as 2.60x106 cfu/g; for psychrophilic aerobic bacteria as 9.10x106, 4.44x105 and 4.49x105 cfu/g, respectively and finally for coliform bacteria as 3.95x105cfu/g in skin, as 1.83x 104 cfu/g in muscle and as 1.86x105 cfu/g in internal organs.Microbial loads exceeding standards and detection of Mycobacterium spp. in 13 samples are provided a foundation for further research.
Benzer Tezler
- Babadıllimanı koyunda (Silifke-Mersin) dip trolü ile avlanan ekonomik öneme sahip bazı demersal balık türleri için ağ göz genişliğinin belirlenmesi
The Determination of mesh size for some commercially important demersal fish species captured by deep trawl net at Babadıllimanı bright (Silifke-Mersin)
CANER ENVER ÖZYURT
- Mersin Körfezi'nden avlanan Callinectes sapidus, Portunus pelagicus ve Sepia officinalis türlerinin besin kompozisyonu ve ısıl işlem uygulanmış yengeç etinin 4 oC'de depolanması sırasındaki duyusal ve kimyasal değişimler
The chemical composition of Callinectes sapidus, Portunus pelagicus and Sepia officinalis caught in Mersin Bay and sensory and chemical changes of thermally processed crab meat during the storage at 4 oC
DENİZ AYAS
Doktora
Türkçe
2010
Gıda MühendisliğiMersin ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA KALAY
- Mersin Körfezi'nde trol ağlarıyla avlanan ıskarta deniz ürünlerinin besin değerlerinin karşılaştırılması
Comparison of nutrition values of discarded fish caught by trawl nets in Mersin Bay
BÜKET BUŞRA GÖZÜ
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
Su ÜrünleriMersin ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ÖZDEN BAŞTÜRK
- Mersin Körfezi'nden avlanan bazı lessepsiyen balık türlerinin yağ ve yağ asitleri profilindeki mevsimsel değişimlerin belirlenmesi
Determination of seasonal changes in the fat and fatty acid profile of some lessepsian fish species from Mersin Bay
MISRA BAKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Balıkçılık TeknolojisiMersin ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DENİZ AYAS
- Mersin körfezinden yakalanan balon balığı'nın (Lagocephalus sceleratus) mevsime ve cinsiyete bağlı olarak besin kompozisyonu ve tetrodotoksin (TTX) düzeylerindeki değişimlerin incelenme
The investigation of changes in sexual and seasonal variation in proximate composition and tetrodotoxin (TTX) levels in puffer fish (Lagocephalus sceleratus) caught from Mersin gulf
ALİ RIZA KÖŞKER
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Su ÜrünleriÇukurova ÜniversitesiSu Ürünleri Avlama ve İşleme Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH ÖZOĞUL