Geri Dön

Türkiye'de yayılış gösteren paronychıa mıll. cinsine ait bazı taksonların nrDNA ıts bölgeleri bakımından karşılaştırılması

Comparation of some paronychia mill. (caryophyllaceae) taxa distributed in Turkey based on nrDNA data

PDF İndir

  1. Tez No: 360897
  2. Yazar: ZEYNEP TÜRKER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KAMİL COŞKUNÇELEBİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 67

Özet

Bu çalışmada Paronychia Mill. (Caryophyllaceae) cinsine ait 34 takson (51 popülasyon) nrDNA ITS bölgesi üzerinden incelenmiştir. İncelenen taksonlardan 20'si ülkemizin önemli gen kaynaklarından biri olarak kabul edilen endemik türlerdir. DNA izolasyonunda kullanılan sağlıklı yaprak örnekleri TÜBİTAK tarafından desteklenen proje kapsamında 2012-2013 yıllarında toplanmıştır. İncelenen her bir popülasyona ait ITS bölgeleri evrensel ITS primerleri kullanılarak çoğaltılmış ve baz dizin analizleri hizmet alımı yolu ile gerçekleştirilmiştir. Yapılan analizler sonucunda incelenen örneklerin nrDNA ITS bölge uzunluklarının 635-671 bç, % GC içeriğinin 59,2-62,3 ve Pürin/Pirimidin oranı 1,027-1.088 arasında değiştiği bulunmuştur. Çalışılan taksonların nrDNA ITS dizinleri 142 (% 20)'sı parsimonik (bilgi verici), 230 (% 32)'si değişken ve 431 (% 59)'unun korunmuş (değişmeyen) bölge içerdiği bulunmuştur. İncelenen taksonlardan P.argentea var. argentea ve P. kayseriana' nın % 75,7' lik benzerlik düzeyiyle birbirine en uzak, P. davisii, P. adalia, P. lycica'nın' nin % 100' lük benzerlik düzeyiyle birbirine en yakın taksonlar olduğu tespit edilmiştir. İncelenen taksonların nrDNA-ITS bölgesinin % GC içeriklerin de birbirine en uzak taksonlar P. argentea var. scariarissima ve P. carica var. stipulata iken, en yakın taksonlar ise P. davisii, P. adalia, P. lycica, P. carica olduğu tespit edilmiştir. Baz dizilerin filogenetik programlar ile değerlendirilmesi sonucu çalışılan taksonlar arası akrabalık ilişkileri belirlenmiş ve Paronychia cinsinin polifiletik bir yapıya sahip olduğunu destekleyen bir filogenetik yapıya sahip olduğu bulunmuştur.

Özet (Çeviri)

In this study, 51 populations belong to 34 Paronychia Mill. (Caryophyllaceae) taxa, including endemic 20 taxa for Turkey, were investigated in terms of nrDNA ITS data. Healthy leaf samples used in DNA isolation was collected during the field work of a project supported by TUBITAK (111T820) in 2012-2013. ITS regions of the examined populations were amplified using universal primers and sequencing by Macrogen Inc. It was determined that length of ITS region varies from 635 to 671 bp, GC % content is between 59.2-62.3, the ratio of Purine / Pyrimidine varies from 1.027 to 1088. The aligned sequence data of nrDNA ITS region belong to examined taxa contain 142 parsimonik (20 %), 230 variable (32 %) and 431 conservative (invariant) site (59 %). It was also found that P.argentea var. argentea and P. kayseriana are the farthest taxa with 75.7 % similarity level, P. davisii, P. adalia and P. lycica are the closely related taxa with 100% similarity level. Additionaly, according to GC % content, P. argentea var. scariarissima and P. carica var. stipulata are the farthest taxa, P. davisii, P. adalia, P. lycica, P. carica are the closely related taxa. As a result of phylogenetic analysis based on the nrDNA ITS data, Paronychia appears to be a polyphyletic genera.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    483442

    Türkiye Paronychia Mill. (Caryophyllaceae) cinsinde görülen tohum yüzey çeşitleri

    The seed surface varieties of Paronychia genus (Caryophyllaceae) in Turkey

    YUSUF ALTUN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyolojiBozok Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÜMİT BUDAK

  2. Tez No

    769612

    Türkiye'de yayılış gösteren bazı campanula türlerinin fitokimyasal açıdan değerlendirilmesi ve biyolojik aktivitelerinin araştırılması

    Investigation of phytochemical properties and biological activities of some campanula species distributed in Turkey

    AYŞE ERDOĞAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Eczacılık ve Farmakolojiİstanbul Üniversitesi

    Farmakognozi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYNUR SARI

  3. Tez No

    770254

    Türkiye'de yayılış gösteren Bolboschoenus palla cinsine ait türlerin filogenetik analizi ve DNA barkodlaması

    Phylogenetic analysis and DNA barcoding of species of the genus Bolboschoenus palla distributing in Turkey

    HİLAL NUR VURAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    GenetikErciyes Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CEM VURAL

    DR. ÖĞR. ÜYESİ HANDAN ŞAPCI SELAMOĞLU

  4. Tez No

    770729

    Türkiye'de yayılış gösteren Tomares türleri üzerinde sistematik araştırmalar

    Systematic studies on the types of Tomares distributed in Turkey

    FATMA YILDIZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyolojiGazi Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELMA ÇALIŞKAN

  5. Tez No

    771356

    Türkiye'de yayılış gösteren Cistus L. (Cistaceae) cinsinin tavuk koronavirüsüne karşı antiviral etkilerinin araştırılması

    Investigation of the antiviral effects of the Cistus LK(cistaceae) genus, which is spread in Turkey against the chicken corona virus

    FEYRUZ BOZOĞLAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyoteknolojiEge Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE NALBANTSOY

Geri Dön