Gram negatif bakterilerde plazmid aracılı kinolon direnci varlığının araştırılması
Investigation of the presence of plasmid mediated quinolone resistance in gram negative bacteria
- Tez No: 409573
- Danışmanlar: PROF. DR. MÜNEVVER UFUK HASDEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Escherichia coli, qnr, plazmid, gyrA, mutasyon, Escherichia coli, qnr, plasmid, gyrA, mutation
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 64
Özet
AMAÇ: Gram negatif bakteriler arasından seçilen ve kinolonlara azalmış duyarlılık ya da direnç gösteren Escherichia coli izolatlatlarında, plazmid aracılı kinolon direnç determinantlarının varlığını ve rolünü araştırmayı amaçladık. GEREÇ VE YÖNTEM: Laboratuvarımızda izole edilen 50 Escherichia coli izolatının siprofloksasin ve levofloksasin MİK'leri, gradiyent strip yöntemiyle belirlenmiş, EUCAST 2015'e göre duyarlılık sınıflaması yapılmıştır. Kromozomal gyrA ve parC mutasyonları dizi analizi yöntemiyle; plazmidik direnç genleri, qnrA, qnrB, qnrC ve qnrS, PZR yöntemiyle araştırılmıştır. BULGULAR: İzolatlarımızın 10'unda (%20) qnrS geni saptanmıştır. Bunların 6'sında qnrS tek başına olup kinolon MİK'leri 0,25 ile 2μg/mL arasındadır. qnrS'e, gyrA'da Ser-83-Leu mutasyonunun eşlik ettiği üç izolat, siprofloksasine dirençli (1,5-2μg/mL); levofloksasine orta (bir izolat: 2 μg/mL) ve dirençli (iki izolat: 3 μg/mL) bulunmuştur. qnrS'e, gyrA'da Ser-83-Leu ve Asp-87-Asn mutasyonlarının eşlik ettiği bir izolatın siprofloksasin MİK'i 12 μg/mL; levofloksasin MİK'i ise 24 μg/mL olarak belirlenmiştir. qnrS saptanmayan 40 izolatın 16'sında gyrA'da Ser-83-Leu ve Asp-87-Asn mutasyonları saptanmış; 13'ünde de gyrA çift mutasyonuna parC Ser-80-Ile mutasyonu eşlik etmiştir. Bu 29 izolat kinolonlara yüksek düzey direnç (8->32 μg/mL) göstermiştir. Kırk izolatın beşinde gyrA'da Ser-83-Leu ve parC'de Ser-80-Ile mutasyonu birlikte; ikisinde gyrA'da Ser-83-Leu mutasyonu tek başına olup kinolon MİK'leri göreceli olarak yüksek (0,19-3 μg/mL) saptanmıştır. Araştırılan direnç determinantlarından hiç birinin saptanmadığı dört izolatın kinolon MİK'leri de 0,19 ile 1 μg/mL arasında bulunmuştur. SONUÇLAR: Çalışmamız qnrS'in izolatlarımızda yaygın (%20) olarak bulunduğunu ve bunun tek başına kinolon MİK'lerini belirgin olarak yükselttiğini; gyrA geninde çift mutasyon varlığının yüksek düzey kinolon direncine yol açtığını açıkça göstermiştir. Araştırılan direnç determinantlarından hiç birinin saptanmadığı dört izolatta MİK değerlerinin göreceli yüksek bulunması, bunlarda aktif pompa sistemlerinin kinolon direncine katkıda bulunabileceğini düşündürmektedir.
Özet (Çeviri)
Aim: We aimed to investigate the presence and the role of plasmid mediated quinolone resistance determinants in Escherichia coli isolates selected from our gram negative bacteria collection with decreased susceptibility or resistance to quinolones. Material and Methods: Ciprofloxacin and Levofloxacin MICs of 50 Escherichia coli isolates that isolated in our laboratory, are determined using gradient strip method; and susceptibility classification is done according to EUCAST 2015. gyrA and parC chromosomal mutations are investigated using sequence analyze, plasmidic resistance genes; qnrA, qnrB, qnrC and qnrS are investigated by PCR method. Results: 10 isolates found to have qnrS, in 6 of them just qnrS is detected and quinolone MICs range from 0,25 to 2 μg/mL. In 3 isolates in addition to qnrS, Ser-83-Leu mutation in gyrA is detected. These 3 isolates are resistant to ciprofloxacin (1,5-2 μg/mL); 1 of them is intermediate (2 μg/mL) and two of them are resistant (3 μg/mL) to levofloxacin. In 1 isolate Ser-83-Leu and Asp-87-Asn mutations in gyrA exists in addition to qnrS and in this isolate ciprofloxacin and levofloxacin MICs are found 12 and 24 μg/mL. In 40 isolates qnrS is not detected. In 16 of these 40 isolates Ser-83-Leu and Asp-87-Asn mutations in gyrA is detected. In 13 of them Ser-83-Ile mutation in parC and double gyrA mutations are detected. All this 29 isolates show high level resistance (8->32 μg/mL) to quinolones. In 5 of 40 isolates Ser-83-Leu in gyrA and Ser-80-Ile in parC mutation are detected together. In 2 of 40 isolates Ser-83-Leu in gyrA mutation is detected alone and quinolone MICs of these 7 isolates found higher (0,19-3 μg/mL). In 4 isolates that we didn't detect any resistance determinant we found quinolone MICs in between 0,19-1 μg/mL. Conclusions: Our study shows that; qnrS is found in our isolates commonly and increases the quinolone MICs significantly and presence of double mutations in gyrA lead to high level quinolone resistance. We thougt that, higher quinolone MICs in 4 isolates that none of the resistance determinants detected, active pump systems may contributing to resistance.
Benzer Tezler
- Kan kültürlerinden izole edilmiş kinolon dirençli escherichia coli ve klebsiella spp. izolatlarında plazmid aracılı kinolon direncinin araştırılması
Investigation of plasmid-mediated quinolone resistance among quinolone-resistant isolates of escherichia coli and klebsiella spp. isolated from blood cultures
HİKMET ÖZTEL OCAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
MikrobiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FARUK AYDIN
- Klinik örneklerden izole edilen Klebsiella pneumoniae suşlarında plazmid aracılı kinolon direnç geni QNR'nin araştırılması
Detection of the plazmid-mediated quinolone resistance determinant gene QNR among clinical isolates of Klebsiella pneumoniae
YAĞMUR EKENOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AKGÜN YAMAN
- İdrar yolu enfeksiyonlarından izole edilen Enterobacteriaceae'lerde antibiyotik direnç genlerinin moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of antibiotic resistance genes in Enterobacteriaceae isolated from urinary tract infections (UTI)
HUSAM MAHDI SALEH ALSHABBANI
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiKırşehir Ahi Evran ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ELİF SEVİM
- Hastane enfeksiyonlarından en sık izole edilen gram negatif bakterilerde beta laktam antibiyotiklere, aminoglikozidlere ve kolistine karşı gelişen direncin moleküler olarak tanımlanması
The molecular identification of resistance of gram negative bacteria, which are mostly isolated from hospital infecitons, against beta lactam antibiotics, aminoglycosides and colistin.
TÜLAY KANDEMİR
Doktora
Türkçe
2021
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ TOĞRUL NAĞIYEV
- Kan kültürlerinden izole edilen genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üreten escherichia coli ve klebsiella spp. izolatlarında plazmid aracılı beta-laktamaz direnç genlerinin araştırılması
Investigation of plasmid-mediated beta-lactamase resistance genes among extended spectrum beta-lactamase (ESBL) producing escherichia coli and klebsiella spp. isolates from blood cultures
DİLEK KOCABAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
MikrobiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CELAL KURTULUŞ BURUK