İn vitro kültür ortamında kemik iliği nişi modellenmesine yönelik çalışmalar
Studies on modeling of bone marrow niche under in vitro conditions
- Tez No: 499164
- Danışmanlar: PROF. DR. RIZA KÖKSAL ÖZGÜL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biyomühendislik, Hematoloji, Biology, Bioengineering, Hematology
- Anahtar Kelimeler: Rejeneratif tıp, kemik iliği nişi, mezenkimal kök hücre, ekstraselüler matriks, deselülerizasyon, doku mühendisliği (*), Regenerative medicine, bone marrow niche, mesenchymal stem cell, extracellular matrix, decellularization
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kök Hücre Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 104
Özet
Mezenkimal kök hücreler (MKH), preklinik araştırmalar, klinik çalışmalar ve yeni araştırma ilacı başvurularında en yaygın kullanılan kök hücre tipidir. İnsanlarda MKH izolasyonu başlıca kemik iliği ve adipoz dokudan yapılmakta olup, izole edilebilir MKH miktarı tüm çekirdekli hücrelerin yalnızca %0.001-3'lük kısmını oluşturmaktadır. Bu nedenle yeni izolasyon yöntemleri ve kaynaklarına ihtiyaç duyulmaktadır. Bu tez kapsamında ilk bölümde, kemik iliği nakli sırasında kullanılan ve sonrasında tıbbi atık olarak uzaklaştırılan filtre ve torba sistemlerinin MKH kaynağı olarak uygunluğu araştırılmıştır. Kök hücre uygulamalarında güncel yaklaşım, sistemik ve/veya bölgesel olarak doğrudan MKH uygulanması yerine“cell-free therapy”olarak adlandırılan MKH kaynaklı biyoaktif bileşenlerin kullanılmasıdır. Çalışmamızın ikinci aşamasında, kök hücre nişinin temelini oluşturan, MKH kaynaklı biyoaktif bileşenlerden olan ekstraselüler matriks yapısının üretimi ve güncel doku mühendisliği uygulaması olan çeşitli deselülerizasyon yöntemleri ile izolasyonu, mikroskobik inceleme çalışmaları, kalıntı DNA miktarı ve glikozaminoglikan içeriği açısından değerlendirilmiş ve proteomik tekniklerle yapısı aydınlatılmıştır. Elde edilen sonuçlara göre,“kullanılmış”filtre ve torba sistemleri, özgül antijen ifadesine sahip, adipojenik, osteojenik ve kondrojenik farklılaşma potansiyeli bulunan MKH izolasyonu için önemli bir kaynak oluşturmaktadır. Osteojenik farklılaşma besiyeri ile EM üretimi sonrasında Triton X-100, NH4OH içeren çözelti ile deselülerizasyon yöntemi ile insan trabeküler kemik morfolojisi benzeri MKH-dEM izole edilmiş ve nLC-MS/MS yöntemi ile MKH-dEM kompozisyonunda yer alan 2005 farklı protein tanımlanmıştır. EM yapısını oluşturan, bağlantılı olan ve düzenlenmesinde rol alan önemli proteinler insan matrizom veritabanı ile karşılaştırılarak analiz edilmiştir.
Özet (Çeviri)
Mesenchymal stem cells (MSC) are the widely used stem cell type in preclinical research, clinical studies and investigational new drug applications. Isolation of MSC can be provided from bone marrow and adipose tissue, and the total isolated amount of MSC consists of 0.001-3% of nucleated cells. Thus, novel isolation techniques and resources are still needed. In the first section of this thesis, the suitability of the filter and bag systems, which are used during bone marrow transfer, were investigated. Those systems are removed as a medical waste, after the transfer, in routine. The current approach in stem cell-based therapy is using bioactive compounds named as“cell-free therapy”resourced from MSC, instead of applying MSC as systemically or locally. In the second stage of this study, the production of extracellular matrix (ECM) structure, which is constructed as bioactive compounds resourced from MSC, providing the basis of stem cell niche was carried out. The isolation of this structure was performed by using various decellularization techniques, as a current tissue engineering application was evaluated with microscopic studies, residual DNA and glycosaminoglycan content. Afterward, the structure was enlightened by using proteomics techniques. The results demonstrated the used filter and bags systems are an important source for isolation of MSC, which has a specific antigen expression and representing adipogenic, osteogenic and chondrogenic differentiation potential. Besides, after producing EM with osteogenic differentiation medium, human trabecular bone morphology-like MSC-dECM was isolated by using solution containing Triton X-100, NH4OH. Then, 2005 different protein structures were demonstrated by using nLC-MS/MS technique. The important proteins, which consist, associate and regulate EM structure, were detected by using Human Matrisome Database.
Benzer Tezler
- Yapay niş mikroçevrede doku gelişim modeli oluşturulması
Generation of a tissue development model inside artificial niche microenvironment
NURAY EMİN
- Towards generation of ß-tcp scaffold based osteogenic niches in microfluidic bioreactors
Mikroakışkan biyoreaktörlerde ß-tcp esaslı doku iskeleleri kullanılarak osteojenik niş geliştirilmesi
İBRAHİM HALİLULLAH ERBAY
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyomühendislikDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SİNAN GÜVEN
- Kültür ortamında farklılaşan sıçan ve köpek kemik iliği stroma hücrelerinin, kemik dokusunda yara tamiri üzerine etkileri, stroma hücrelerinin implant materyalleri ile etkileşimi ve yönlendiren faktörler
The effect of in vitro differentiated rat and dog bone marrow stromal cells on the healing of bone defect, interactions between stromal cells and implant materials and influencing factors
FEYZAN KURT
Doktora
Türkçe
2006
BiyolojiCelal Bayar ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. İSMET DELİLOĞLU GÜRHAN
- Neural differentiation potentiall variability of bone marrow derived human mesenchymal stem cells
İnsan kemik iliği kökenli mezenkimal kök hücrelerinin nöral farklılaşma potansiyel değişkenliğinin araştırılması
MERVE ZAİM
- Talasemi majörlü hastalarda Mezenkimal kök hücre özellikleri ve kemik iliğinde GDF15 ve Eritropoetin düzeyleri
Characteristics of Mesenchymal stem cells in thalassemia major patients and GDF 15 and Erythropoietin levels in bone marrow
ALI GULİYEV
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
HematolojiHacettepe ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DUYGU UÇKAN ÇETİNKAYA