Geri Dön

Development of a BioChip System with Multiplexing Capability for Detection of Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) and Mutations Based on Surface-Enhanced Raman Scattering

Genlerdeki Tek Nükleotid Polimorfizm (SNP) ve Mutasyonların Tanısı İçin Yüzeyde Zenginleştirilmiş Raman Saçılmasına (YZRS) Dayalı Multipleks Özelliğine Sahip Bioçip Geliştirilmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 536481
  2. Yazar: ÖMER FARUK KARATAŞ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA ÇULHA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

İnsan genomu, en yaygın polimorfizim olan tek nükleotid polimorfizimin (SNP) de içinde bulunduğu birçok genetik anomaliye maruz kalmaktadır. SNP'ler birçok hastalığın teşhisinde yaygın bir şekilde kullanılmaktadırlar. SNPlerin tespitinde günümüzde kullanılan metotlar pahalı ve zaman alıcıdır. Dolayısıyla maliyeti azaltacak ve süreden tasarruf sağlayacak yöntemlerin geliştirilmesine ihtiyaç vardır. Bu da ancak multipleks özelliği olan bir yöntemle geliştirilebilecektir. Yüzeyce zenginleştirilmiş Raman saçılması (YZRS), parmak izi (fingerprinting) özelliğinden dolayı moleküllerin yapıları hakkında bilgi veren titreşimsel spektroskopik bir tekniktir. YZRS'nin multipleks özelliği ve yüksek hassaslığı, çiplerdeki spot sayısını azaltmada kullanılmıştır. İnsan genomundaki çok sayıda SNP göz önüne alındığında multipleks olarak SNP tespitinin başarılması para ve zaman kaybının azaltılmasında önemli rol oynayacaktır. Bu çalışmada, SNP mutasyonlarının YZRS tabanlı olarak tespitleri için bir tanı sistemi geliştirilmesi amaçlanmıştır. Yaklaşımın fizibilitesinin test edilmesi için MEFV geninin 10. ekzonunda bulunan M694V SNP mutasyonu model olarak kullanılmıştır. Elde edilen pozitif sonuçlar, geliştirilen tanı sistemi ile multipleks olarak SNP tespitinin yapılmasının mümkün olduğunu göstermiştir.

Özet (Çeviri)

Human genome is exposed to several types of genetic abnormalities including single nucleotide polymorphisms (SNPs), which are the most common polymorphisms throughout the human genome. Because SNPs are abundant and stable, they are widely used in diagnostics of several diseases like familial Mediterranean fever (FMF), Parkinson, and Alzheimer. Identification of SNPs provides opportunities in the diagnosis, prevention and treatment of related diseases. Current methods that are used to detect SNPs are time-consuming and expensive. Therefore, there is a need to improve the speed and reduce the cost. This can only be achieved with a technique capable of multiplexing. Surface-enhanced Raman scattering (SERS) is a vibrational spectroscopic technique, which provides specific information about a molecule's structure due to its“fingerprinting property”. The multiplexing property and high sensitivity of SERS is used to reduce the number of spots on the array chip. Considering great number of SNPs present on the human genome, achievement of the multiplex SNP detection will cut the cost and time spent for the screening SNPs. The development of an assay for the detection of SNP mutations has been attempted based on SERS in this study. To test the feasibility of approach, M694V SNP on 10 th exon of MEFV gene is investigated as a model. The promising results indicate that it is possible to detect SNPs using this assay.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    977835

    Hava örnekleme sistemi ile biyoaerosol tespiti için mikroakışkan tabanlı tanı sistemi geliştirilmesi

    Development of a microfluidics-based diagnostic system for bioaerosol detection using an air sampling system

    HÜLYA ERASLAN GÜLTEKİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Biyomühendislikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Mekatronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALİ FUAT ERGENÇ

  2. Tez No

    936855

    Droplet Microfluidics for DNA-Based Assays

    DNA Bazlı Tahliller için Damlacık Mikroakışkanları

    YUNUS ASLAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyomühendislikThe Unıversıty Of Glasgow

    Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. JONATHAN COOPER

  3. Tez No

    902417

    Development of microRNA-based lab-on-a-chip biosensor platforms with direct electrical readout for screening of colorectal cancer biomarkers

    Kolorektal kanser biyobelirteçlerinin taraması için doğrudan elektriksel okuma özellikli mikroRNA tabanlı çip-üstü-laboratuvar biyosensör platformlarının geliştirilmesi

    OSMAN ŞAHİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyoteknolojiSabancı Üniversitesi

    Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MURAT KAYA YAPICI

  4. Tez No

    621620

    Design and development of a personalized medicine oriented microfluidic organ on a chip platform

    Kişiselleştirilmiş tıbba yönelik mikro akışkan çip üstü organ platformunun tasarım ve geliştirilmesi

    AHMET AKİF KIZILKURTLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    BiyomühendislikGebze Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALİ AKPEK

  5. Tez No

    364156

    Yüzey plazmon resonansına dayalı yeni bir algılayıcı geliştirilmesi

    Development of a novel Sensor based on surface plasmon resonance

    BURAK TÜRKER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Elektrik ve Elektronik MühendisliğiYıldız Teknik Üniversitesi

    Elektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. LALE ÖZYILMAZ

    YRD. DOÇ. DR. AYKUTLU DANA

Geri Dön