Geri Dön

Development of a BioChip System with Multiplexing Capability for Detection of Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) and Mutations Based on Surface-Enhanced Raman Scattering

Genlerdeki Tek Nükleotid Polimorfizm (SNP) ve Mutasyonların Tanısı İçin Yüzeyde Zenginleştirilmiş Raman Saçılmasına (YZRS) Dayalı Multipleks Özelliğine Sahip Bioçip Geliştirilmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 536481
  2. Yazar: ÖMER FARUK KARATAŞ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA ÇULHA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 48

Özet

İnsan genomu, en yaygın polimorfizim olan tek nükleotid polimorfizimin (SNP) de içinde bulunduğu birçok genetik anomaliye maruz kalmaktadır. SNP'ler birçok hastalığın teşhisinde yaygın bir şekilde kullanılmaktadırlar. SNPlerin tespitinde günümüzde kullanılan metotlar pahalı ve zaman alıcıdır. Dolayısıyla maliyeti azaltacak ve süreden tasarruf sağlayacak yöntemlerin geliştirilmesine ihtiyaç vardır. Bu da ancak multipleks özelliği olan bir yöntemle geliştirilebilecektir. Yüzeyce zenginleştirilmiş Raman saçılması (YZRS), parmak izi (fingerprinting) özelliğinden dolayı moleküllerin yapıları hakkında bilgi veren titreşimsel spektroskopik bir tekniktir. YZRS'nin multipleks özelliği ve yüksek hassaslığı, çiplerdeki spot sayısını azaltmada kullanılmıştır. İnsan genomundaki çok sayıda SNP göz önüne alındığında multipleks olarak SNP tespitinin başarılması para ve zaman kaybının azaltılmasında önemli rol oynayacaktır. Bu çalışmada, SNP mutasyonlarının YZRS tabanlı olarak tespitleri için bir tanı sistemi geliştirilmesi amaçlanmıştır. Yaklaşımın fizibilitesinin test edilmesi için MEFV geninin 10. ekzonunda bulunan M694V SNP mutasyonu model olarak kullanılmıştır. Elde edilen pozitif sonuçlar, geliştirilen tanı sistemi ile multipleks olarak SNP tespitinin yapılmasının mümkün olduğunu göstermiştir.

Özet (Çeviri)

Human genome is exposed to several types of genetic abnormalities including single nucleotide polymorphisms (SNPs), which are the most common polymorphisms throughout the human genome. Because SNPs are abundant and stable, they are widely used in diagnostics of several diseases like familial Mediterranean fever (FMF), Parkinson, and Alzheimer. Identification of SNPs provides opportunities in the diagnosis, prevention and treatment of related diseases. Current methods that are used to detect SNPs are time-consuming and expensive. Therefore, there is a need to improve the speed and reduce the cost. This can only be achieved with a technique capable of multiplexing. Surface-enhanced Raman scattering (SERS) is a vibrational spectroscopic technique, which provides specific information about a molecule's structure due to its“fingerprinting property”. The multiplexing property and high sensitivity of SERS is used to reduce the number of spots on the array chip. Considering great number of SNPs present on the human genome, achievement of the multiplex SNP detection will cut the cost and time spent for the screening SNPs. The development of an assay for the detection of SNP mutations has been attempted based on SERS in this study. To test the feasibility of approach, M694V SNP on 10 th exon of MEFV gene is investigated as a model. The promising results indicate that it is possible to detect SNPs using this assay.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    902417

    Development of microRNA-based lab-on-a-chip biosensor platforms with direct electrical readout for screening of colorectal cancer biomarkers

    Kolorektal kanser biyobelirteçlerinin taraması için doğrudan elektriksel okuma özellikli mikroRNA tabanlı çip-üstü-laboratuvar biyosensör platformlarının geliştirilmesi

    OSMAN ŞAHİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyoteknolojiSabancı Üniversitesi

    Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MURAT KAYA YAPICI

  2. Tez No

    216728

    Non-manyetik ve manyetik lateks partiküllerin sentezi, karakterizasyonu ve doku mühendisliği uygulamaları

    Synthesis and characterization of non-magnetic and magnetic latex particles and tissue engineering applications

    ANIL SERA KAHRAMAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyomühendislikHacettepe Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MENEMŞE GÜMÜŞDERELİOĞLU

  3. Tez No

    636104

    Development of a plasmonic biosensor for detection of exosomes

    Eksozomların tayini için plazmonik biyosensör geliştirilmesi

    DAMLA TAYKOZ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Biyomühendislikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ESMA VOLGA BULMUŞ ZAREIE

    DR. HÜSEYİN CUMHUR TEKİN

  4. Tez No

    824536

    Development of an advanced LSPR-based biosensor chip for rapid detection of border disease virus

    Sınır hastalığı virüsünün hızlı tespiti için gelişmiş LSPR tabanlı biyosensör çipinin geliştirilmesi

    ABDULLAH ALAKBAROV

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Biyoteknolojiİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ESMA VOLGA BULMUŞ ZAREIE

    DOÇ. DR. HÜSEYİN CUMHUR TEKİN

  5. Tez No

    82438

    Development of an artificial neural network model for the estimation of chlorophyll-a in lakes

    Göllerdeki klorofil-a'nın belirlenmesi için bir yapay sinirsel ağ modelin geliştirilmesi

    CÜNEYT KARUL

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    Çevre MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELÇUK SOYUPAK

Geri Dön