Geri Dön

Mezenkimal kök hücre yaşlanmasında NF-KB/P65 ve PKNOX2 protein-protein etkileşimlerinin incelenmesi

Investigation of NF-KB / P65 and PKNOX2 protein-protein interactions in mesenchymal stem cell aging

  1. Tez No: 678389
  2. Yazar: ESRA KOÇAK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AYŞEN ÖZCAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Moleküler Tıp, Biology, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kök Hücre Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 106

Özet

Mezenkimal kök hücreler in vitro kültürde pasajlamalar sonucu replikatif yaşlanmaya uğrayarak kök hücre özelliklerini kaybeder. Grubumuzun daha önceki çalışmalarında sağlıklı Kİ-MKH'de PKNOX2 proteini ile yapılan ko-immünopresipitasyon (ko-İP) sonrası proteomiks analizlerinde PKNOX2 ile etkileşime giren proteinler arasında yaşlanma ilişkili sekretomların ana düzenleyicisi olarak kabul edilen Nüklear Faktör-κB'nin p65 alt ünitesi (NF-κB/p65) bulunmuştur. Bu tez çalışmasında; 1) kültür ortamında yaşlandırılan Kİ-MKH'lerde PKNOX2 ve p65/RelA protein düzeylerinde değişim olup olmadığının araştırılması, 2) PKNOX2 ve NF-κB/p65 (RelA) etkileşiminin kanıtlanması ve 3) yaşlanma sürecindeki etkileşim değişimlerinin olup olmadığının incelenmesi amaçlanmıştır. Replikatif yaşlanma SA-β-Gal boyaması ve p16, p21 protein seviyeleri ile değerlendirildi. Genomik stres, γH2AX seviyeleri immünofloresans görüntüleme ile tespit edildi. Western blotlama sonuçları, PKNOX2 protein düzeylerinin replikatif yaşlanma ile azalma eğiliminde olduğunu gösterdi. 200 μM H2O2 ile indüklenen oksidatif stresin Kİ-MKH'de genel olarak NF-κB/p65 protein düzeylerini arttırdığını gösterdi. Ko-İP sonrası western blotlama ve in situ proximity ligation assay (PLA) teknikleri ile NF-κB/p65 ve PKNOX2 etkileşimde olduğu in vitro ve in situ tespit edildi. PLA analizleri, NF-κB ve PKNOX2'nin etkileşimlerinin Kİ-MKH'lerinin hem sitoplazma hem de çekirdeğinde mevcut olduğunu gösterdi ve etkileşim düzeylerinin 9. pasajda arttığını ve pasaj 12'de düştüğünü gösterdi.

Özet (Çeviri)

Mesenchymal stem cells undergo replicative senescence by cultivating in vitro and as the passage extends they lose their stem cell properties. Previous study of our group investigating proteomics of the co-immunoprecipitated proteins with PKNOX2 revealed interacting proteins with PKNOX2 in BM-MSCs. Nuclear factor kappa B (NF-κB) subunit p65, a main regulator of senescence-related secretomes, was among the interacting proteins with PKNOX2. Goals of this thesis were 1) to investigate the changes in PKNOX2 and p65/RelA protein levels of BM-MSCs aged by serial passaging in culture, 2) to demonstrate the interaction of PKNOX2 and NF-κB/p65 (RelA) and 3) to examine interaction changes during the cellular aging process if there are any. Replicative senescence was assessed by SA-β-Gal staining and p16, p21 protein levels determined by Western blot analysis. Genomic stress was assessed by γH2AX levels obtained by immunofluorescence imaging. Analysis of western blotting showed that PKNOX2 protein levels tended to decrease with replicative senescence and NF-κB/p65 protein levels overall increased in BM-MSCs exposed to oxidative stress induced by 200 µM H2O2. NF-κB/p65 and PKNOX2 interactions were detected in vitro using co-IP followed by western blot and in situ using proximity ligation assay (PLA) technique. PLA analyzes showed that interactions of NF-κB and PKNOX2 were present both in the cytoplasm and nucleus of BM-MSCs, and the levels of interaction increased at passage 9 and decreased at passage 12.

Benzer Tezler

  1. NAC (N-asetilsistein) kullanan ve kullanmayan fare modelinde adipoz doku orijinli mezenkimal kök hücrelerin senesense olan yatkınlıklarının belirlenmesi

    Investigation of NAC (N-acetylcysteine) treatment on adipose tissue originated mesenchymal stem cellsenescence in mouse model

    ZEYNEP GÜNAYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    GenetikErciyes Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERVET ÖZCAN

  2. UVB ışığına maruz kalan epidermal hücrelerde insan adipoz doku mezenkimal kök hücrelerinin onarıcı ve canlandırıcı etkilerinin araştırılması

    İnvestigation of regenerative and reparative effects of human adipose tissue mesencyhmal stem cells on epidermal cells exposed to UVB light

    YASEMİN TİN ARSLAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyokimyaAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÇİĞDEM YENİSEY

  3. İleri pasaj mezenkimal kök hücrelerin aquaporin profilinin erken pasaj mezenkimal kök hücrelerle karşılaştırılması ve adipojenik farklılaşma verimi üzerindeki etkisinin belirlenmesi

    Comparison of Early Passage Mesenchymal stem cells' Aquaporin profile with Early Passage Mesenchymal stem cells and determination of their effect on Adipogenic differentiation performance

    AYŞEGÜL AYTEKİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Histoloji ve EmbriyolojiKocaeli Üniversitesi

    Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YUSUFHAN YAZIR

  4. Deneysel Balb/C OVA akut astım modelinde fare kemik iliği kaynaklı mezenkimal kök hücrelerin farklı uygulama yollarının astım modeli üzerine etkisinin araştırılması

    Investigation the effect of different administration routes of mesenchymal stem cells on experimental BALB/C OVA model of acute asthma

    GÜLBEN GÜRHAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Allerji ve İmmünolojiMarmara Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TUNÇ AKKOÇ

  5. Periferik sinir hasarında olfaktör mukozal mezenkimal kök hücrelerinin terapötik etkinliğinin incelenmesi

    Investigation of therapeutic efficacy of olfactory mucosal mesenchymal stem cells in peripheral nerve injury

    SAHAR EBRAHEM EBRAHEM ORİF

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Moleküler TıpEge Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YİĞİT UYANIKGİL