Şizofreni ilişkili potansiyel miRNA'ların comt geni ile olası ilişkisinin in vitro model oluşturularak araştırılması
Investigation of the possible association of schizophrenia-associated potential miRNAs with the comt gene by creating an in vitro model
- Tez No: 715090
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NURAY ALTINTAŞ, DR. ÖĞR. ÜYESİ ONUR TOKGÜN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Şizofreni, miRNA, COMT, Schizophrenia, miRNA, COMT
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Manisa Celal Bayar Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 78
Özet
Amaç: Çalışmamızda TargetScan veritabanından ve literatüratür taramasından belirlediğimiz miRNA'ların (miR-30a-5p, miR-30e-5p ve miR-34a-5p) COMT geni ile bir ilişkisinin olup olmadığınının in vitro ortamda araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Şizofreni hücreleri olarak SH-SY5Y insan nöroblastom hücre hattı kullanılmıştır. Çalışmamızda miRNA mimik transfeksiyonu, RNA ekstraksiyonu, miRNA ve mRNA ters transkripsiyonu, RT-qPCR analizi, protein ekstraksiyonu, immunoblotlama analizi ve istatiksel analiz metodları kullanılmıştır. RT-qPZR araştırılmaları 2-ΔΔCT yöntemi kullanılarak analiz edilmiştir. Bulgular: Çalışmamızda miR-30a-5p, miR-30e-5p ve miR-34a-5p'nin COMT genindeki rolü araştırılmış ve miRNA mimik transfeksiyonu yapılan SH-SY5Y hücrelerinde miR-30a-5p ve miR-34a-5p transfeksiyonu sonucunda COMT geni ekspresyon seviyesinde anlamlı bir değişiklik gözlemlenmedi fakat miR-30e-5p transfeksiyonu sonucunda COMT geni ekpresyon seviyesinin anlamlı derecede azaldığı gözlemlendi. Sonuçlar: Çalışmamız miR-30a-5p, miR-30e-5p ve miR-34a-5p'nin COMT genine olan etkisi ile ilgili yapılan ilk çalışma olması nedeniyle yüksek özgün değere sahiptir. Çalışmamız sonucunda miR-30e-5p COMT genini baskılamakta olduğu sonucuna varılmıştır. TargetScan database verilerine göre seçmiş olduğumuz miR-30e-5p'nin COMT genine doğrudan bağlanabileceği ve potansiyel bir terapötik strateji olabileceği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Aim: In our study, it was aimed to investigate in vitro whether the miRNAs (miR-30a-5p, miR-30e-5p and miR-34a-5p) that we determined from the TargetScan database and literature review have a relationship with the COMT gene. Material and Method: : The SH-SY5Y human neuroblastoma cell line was used as schizophrenia cells. MiRNA mimic transfection, RNA extraction, miRNA and mRNA reverse transcription, RT-qPCR analysis, protein extraction, immunoblotting analysis and statistical analysis methods were used in our study. RT-qPCR studies were analyzed using the 2-ΔΔCT method Results: In our study, the role of miR-30a-5p, miR-30e-5p and miR-34a-5p in the COMT gene was investigated and the COMT gene expression level was investigated in miRNA mimic transfected SH-SY5Y cells as a result of miR-30a-5p and miR-34a-5p transfection. no significant change was observed, but it was observed that COMT gene expression level decreased significantly as a result of miR-30e-5p transfection. Conclusion: Our study has a high specificity because it is the first study on the effect of miR-30a-5p, miR-30e-5p and miR-34a-5p on the COMT gene. As a result of our study, it was concluded that miR-30e-5p suppresses the COMT gene. According to the TargetScan database data, it is thought that the miR-30e-5p we selected can directly bind to the COMT gene and be a potential therapeutic strategy.
Benzer Tezler
- Otizm Spektrum Bozukluğu tanılı hastalarda Bipolar Bozukluk gelişimi ile miRNA-132, miRNA-134, miRNA-206, miRNA-126 ve miRNA-137 düzeylerinin ilişkisinin incelenmesi
The relationship between miRNA-132, miRNA-134, miRNA-206, miRNA-126, and miRNA-137 levels and comorbidity of Bipolar Disorder in Autism Spectrum Disorder patients
HÜSNA KAAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Psikiyatriİstanbul ÜniversitesiÇocuk ve Ergen Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NUSRET SOYLU
- Ankilozan spondilit te kan mikro-rna düzeylerinin araştırılması ve hastalık aktivitesi ile fonksiyonel kapasite arasındaki ilişkisi
The investigation of blood micro-rna levels in ankylosing spondylitis and the relationship between disease activity and functional capacity
KORAY ÇOĞUL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
Fiziksel Tıp ve RehabilitasyonMersin ÜniversitesiFiziksel Tıp ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ BİÇER
- Multiomic data analysis of schizophrenia and bipolar disorder
Şizofreni ve bipolar bozukluğa dair çoklu omik verilerinin analizi
BURAK ÇARDAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Biyomühendislikİstanbul Medeniyet ÜniversitesiBiyolojik Veri Bilimi Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MUHAMMED ERKAN KARABEKMEZ
- Şizofreni tanılı kadın hastalarda antipsikotik tedavi öncesi ve sonrası drd2, nrg1 ve pı3k/akt/mtor ekspresyon düzeylerinin incelenmesi
Investigation of drd2, nrg1 and pi3k/akt/mtor expression levels before and after antipsychotic treatment in female patients with schizophrenia
OSMAN ŞEHİTOĞULLARI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
PsikiyatriSağlık Bilimleri ÜniversitesiRuh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TONGUÇ DEMİR BERKOL
- Examining the genetic complexity of schizophrenia: A comparative analysis of gene-environment interactions in Turkish and Pakistani populations using genomic tools and computational methods
Şizofrenin genetik karmaşıklığının incelenmesi: Türk ve Pakistan nüfusunda gen-çevre etkileşimlerinin genomik araçlar ve hesaplamalı yöntemler kullanılarak karşılaştırılmış bir analizi
ARSHAD BEGUM
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiÜsküdar ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÇİĞDEM SEZER ZHMUROV