Geri Dön

Soğuk stresinin dereotu (Anethum Graveolens L.) mRNA transkriptomuna etkisinin belirlenmesi

Determination of the effect of cold stress on dill (Anethum Graveolens L.) mRNA transcriptome

PDF İndir

  1. Tez No: 1019190
  2. Yazar: SECDE NUR SAFRAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ALİ TEVFİK UNCU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2026
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Necmettin Erbakan Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Dereotu (Anethum graveolens L.), Apiaceae familyasına ait önemli bir aromatik ve tıbbi bitki olup; gıda, kozmetik ve farmakoloji alanlarında yaygın olarak kullanılmaktadır. Ekonomik ve farmakolojik açıdan önemli bir tür olmasına rağmen, dereotunun abiyotik stres koşullarına verdiği moleküler yanıtlar üzerine yapılan çalışmalar oldukça sınırlıdır. Özellikle soğuk stresine karşı gelişen fizyolojik ve genetik mekanizmaları yeterince araştırılmamış olup, dereotunda transkriptom düzeyinde gerçekleştirilen çalışmaların sayısı oldukça azdır. Bu nedenle, dereotu bitkisinde soğuk stresine bağlı transkriptomik değişimlerin belirlenmesi amacıyla mevcut araştırma gerçekleştirilmiştir. Bu kapsamda dereotu kısa okuma platformları kullanılarak sekanslanmış ve elde edilen transkriptom verileri biyoinformatik analizlerle değerlendirilmiştir. Deseq2 aracılığıyla diferansiyel ekspresyonu değişen genler tespit edilmiştir. Soğuk stres koşullarında farklı ifade edilen genlerin tanımlanması amacıyla BLAST analizleri uygulanmış, genlerin biyolojik süreçleri, moleküler fonksiyonları ve hücresel bileşenleri Gen Ontolojisi (GO) analizleri ile incelenmiştir. Ayrıca metabolik yollar ve stres yanıt mekanizmalarının belirlenmesi için KEGG yolak analizlerinden yararlanılmıştır. GMATA yazılımı kullanılarak transkriptom verilerinden basit tekrar dizileri (SSR) belirlenmiş ve SSR primer tasarımları gerçekleştirilmiştir. Elde edilen sonuçların, dereotunda soğuk strese karşı gelişen moleküler savunma mekanizmalarının anlaşılmasına, gelecekte abiyotik stres toleransına yönelik genetik, moleküler ve markör destekli ıslah çalışmalarına katkı sağlaması hedeflenmektedir.

Özet (Çeviri)

Dill (Anethum graveolens L.) is an important aromatic and medicinal plant belonging to the Apiaceae family, widely used in food, cosmetics, and pharmacology. Despite its economic and pharmacological importance, studies on the molecular responses of dill to abiotic stress conditions are quite limited. In particular, the physiological and genetic mechanisms that develop in response to cold stress have not been sufficiently investigated, and the number of studies conducted at the transcriptome level in dill is quite small. Therefore, this research was conducted to determine the transcriptomic changes in dill plants due to cold stress. In this context, dill was sequenced using short-read platforms, and the obtained transcriptome data were evaluated using bioinformatics analyses. Genes with altered differential expression were identified via Deseq2. BLAST analyses were applied to identify genes with differential expression under cold stress conditions, and the biological processes, molecular functions, and cellular components of the genes were examined using Gene Ontology (GO) analyses. Furthermore, KEGG pathway analyses were used to determine metabolic pathways and stress response mechanisms. Simple repeat sequences (SSRs) were identified from transcriptome data using GMATA software, and SSR primer designs were performed. The aim is for these results to contribute to understanding the molecular defense mechanisms that develop against cold stress in dill, and to future genetic, molecular, and marker-assisted breeding studies aimed at abiotic stress tolerance.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    272634

    Ratlarda soğuk stresinin tiroid bezi üzerine etkileri

    Effects of cold stress on thyroid gland in rats

    ÇİĞDEM ÜNAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    AnatomiAtatürk Üniversitesi

    Veterinerlik Anatomisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZEKERİYA ÖZÜDOĞRU

  2. Tez No

    366088

    Soğuk-hareketsizlik stresinin farelerin periferal kanındaki yardımcı T hücre yanıtına etkisi

    Effects of cold-immobilization stress on T helper cell response in periferal blood in mice

    MURAT DOĞAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    FizyolojiHacettepe Üniversitesi

    Fizyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BİLGE PEHLİVANOĞLU

  3. Tez No

    198069

    Domateste soğuk stresinin antioksidatif mekanizmalar yönünden araştırılması

    Investigation of low temparature stress in tomato in respect to antioxidative mechanisms

    ÖZAY ÖZGÜR GÖKMEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Toprak Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. RIFAT DERİCİ

  4. Tez No

    430299

    Çeltikte (Oryza sativa L.) soğuk stresinin verim ve kalite unsurlarına etkileri ile soğuk stresine toleranslı genotiplerin morfolojik ve moleküler yöntemlerle belirlenmesi

    Determination of effect of cold stress on yield and quality parameters and evaluation of cold tolerant genotypes by morphological and molecular methods in rice (Oryza sativa L.)

    RASİM ÜNAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    ZiraatNamık Kemal Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TEMEL GENÇTAN

  5. Tez No

    649294

    Açık barınaklarda yetiştirilen simmental ineklerinde soğuk stresinin süt verimi, süt bileşimi ve bazı davranış özelliklerine etkisi

    Effect of cold stress on milk yield, milk composition and some behavioral traits of simmental cows bred in open barn

    EMRAH KAYGUSUZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Veteriner HekimliğiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Veterinerlik Zootekni Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİLİZ AKDAĞ

Geri Dön