Geri Dön

Tümörle ilişkili makrofaj hücrelerinin transkriptomik özelliklerinin incelenmesi

Examining the transcriptomic properties of tumor-associated macrophages

PDF İndir

  1. Tez No: 1019380
  2. Yazar: DUYGU KEREMİTÇİ
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ YASİN KAYMAZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu tezde akciğer kanseri tümör mikro çevresinde bulunan immün hücrelerinden makrofaj hücreleri ve alt türleri makine öğrenmesi modeli ve çeşitli analizler ile incelenmiştir. Akciğer kanseri başta olmak üzere çeşitli kanser türlerinin tümör mikro çevresinde bulunan immün hücrelerinin çeşitleri ve konsantrasyonlarının tümör gelişimine ve hastalığın ilerlemesine etki ettiği çeşitli araştırmalarda ortaya konmuştur. Bu çalışmada ise makrofaj hücrelerinin ve alt türlerinin tümör mikro çevresindeki kompozisyonlarını ve etkilerini incelemeyi amaçladık. Bu amaç doğrultusunda scRNA-seq verileri üzerinden hem M0, M1 ve M2 makrofaj alt türlerini hem de LA-TAMs (Lipid-associated Tumor-associated Macrophages) ve RTM-TAMs (Tissue-Resident Tumor-associated Macrophages) gibi fonksiyonları bazında alt türlerine ayrılmış makrofaj alt türlerini inceledik. Analizlerde makine öğrenmesi modeli, kompozisyon analizleri ve diferansiyel gen ifadesi (DGE) analizi kullanılmıştır. Analizler sonucunda, bazı makrofaj alt türlerinin kompozisyonunun tümör evreleri ile ilişkili olarak arttığı, bazılarının ise azaldığı gözlemlenmiştir.

Özet (Çeviri)

In this thesis, macrophage cells and their subtypes, which are immune cells found in the tumor microenvironment of lung cancer, were investigated using machine learning models and various analyses. It has been demonstrated in several studies that the types and concentrations of immune cells present in the tumor microenvironment, particularly in lung cancer and other cancer types, influence tumor progression and disease advancement. This study aims to analyze the composition and effects of macrophage cells and their subtypes in the tumor microenvironment. To achieve this goal, we examined macrophage subtypes, including M0, M1, and M2 macrophages, as well as functional subtypes such as lipid-associated tumor-associated macrophages (LA-TAMs) and tissue-resident tumor-associated macrophages (RTM-TAMs), based on scRNA-seq data. Machine learning models, composition analyses, and differential gene expression (DGE) analysis were utilized in these analyses. The results revealed that the composition of certain macrophage subtypes increased proportionally with tumor stages, while others decreased.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    501893

    Meme kanserinde, normal fibroblastlar ve kanserle ilişkili fibroblastların monosit çağrılması, makrofaj polarizasyonu ve invazyona etkisi

    The effect of normal fibroblasts and cancer associated fibroblasts on monocyte recruitment, macrophage polarization and invasion in breast cancer

    BETÜL GÖK YAVUZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tümör Biyolojisi ve İmmünolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DİCLE GÜÇ

  2. Tez No

    1021583

    Üçlü negatif meme kanserinde folat reseptör alfa ekspresyonu ile M2-benzeri tümör asosiye makrofaj ilişkisi

    Association between folate receptor alpha expression and M2-like tumor-associated macrophages in triple-negative breast cancer

    ÖMER SERTAÇ İLASLAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    Patolojiİstanbul Medeniyet Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ TUÇE SÖYLEMEZ AKKURT

  3. Tez No

    967858

    Modulation of glioblastoma cell behavior by monocyte-derived macrophages and frequency-dependent attraction on a microfluidic chip

    Glioblastoma hücre davranışının monosit kökenlimakrofajlar tarafından düzenlenmesi ve mikroakışkan çipüzerinde frekansa bağımlı çekim

    HANİFE KANTARCI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    BiyolojiSabancı Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MELTEM ELİTAŞ

  4. Tez No

    921989

    Determination of the effect of α7 nAChR-mediated cholinergic anti-inflammatory pathway activation on regorafenib resistance

    α7 nAChR aracılıklı kolinerjik anti-inflamatuar yolak aktivasyonunun regorafenib direncine etkisinin belirlenmesi

    SILA SEZAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    Biyomühendislikİzmir Ekonomi Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP FIRTINA KARAGONLAR

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ELİF BARIŞ

  5. Tez No

    680380

    Understanding cancer and immune cell heterogeneity using microfluidics, dielectrophoresis, and conventional methods

    Mikroakışkan, dielektroforezis ve geleneksel yöntemler kullanarak kanser-immün hücre heterojenliğini anlamak

    ESRA ŞENGÜL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Mühendislik BilimleriSabancı Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MELTEM ELİTAŞ

Geri Dön