Ceviz yapraklarından izole edilen epifitik bakterilerin bitki gelişimini teşvik edici özellikleri ve bakır direnç mekanizmalarının belirlenmesi
Determination of plant growth-promoting traits and copper resistance mechanisms in epiphytic bacteria isolated from walnut (Juglans regia l.) leaves
- Tez No: 1022093
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AHMET AKKÖPRÜ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışma, Türkiye'nin Doğu ve Güneydoğu Anadolu bölgelerinde ceviz (Juglans regia L.) yetiştiriciliğinin yoğun olarak yapıldığı yedi ilden toplanan yaprak örneklerinden elde edilen epifitik bakterilerin bitki gelişimini teşvik edici özelliklerinin, bakır toleranslarının ve Xanthomonas arboricola pv. juglandis (Xaj)'e karşı biyokontrol potansiyellerinin belirlenmesi amacıyla yürütülmüştür. Toplam 58 ceviz bahçesinden elde edilen örneklerden 100 adet bakteri izolatı kültüre alınmıştır. İzolatların bakır toleransı, CuSO₄·5H₂Oiçeren MGY besiyerinde 0–2.5 mM aralığında değerlendirilmiştir. Bakır toleransı ile ilişkili copA ve cusA genlerine spesifik primerler kullanılarak PCR yöntemiyle analiz edilmiş, ancak incelenen izolatlarda bu genlere rastlanmamıştır. İzolatların bakır stresine karşı geliştirdikleri fenotipik adaptasyonları belirlemek amacıyla biyofilm oluşturma kapasiteleri Congo Red Agar (CRA) yöntemi ile ekzopolisakkarit (EPS) üretimi nitel olarak, Crystal Violet (CV) mikroplak yöntemi ile kantitatif olarak ölçülmüştür. Elde edilen sonuçlar, izolatların önemli bir bölümünün birden fazla PGPB özelliğine sahip olduğunu ve yüksek düzeyde bakır toleransı gösterebildiğini ortaya koymuştur Bitki gelişimini teşvik edici özellikler kapsamında yapılan çalışmalar ile izolatların %74'ün siderofor üretimine, %69,5'nin IAA üretimine, %14'ün fosfat çözündürme yeteneğine, %8'i ACC-deaminaz aktivitesine ve %21'i azot fiksasyonu özelliği sahip olduğu belirlenmiştir. Ayrıca bakteri izolatlarının ceviz patojeni Xaj'ye karşı in vitro testler ile antagonistik etkileri değerlendirilmiş ve bazı izolatların patojen gelişimini önemli düzeyde baskıladığı belirlenmiştir. CRA sonuçlarına göre izolatların %65'i biyofilm oluşturma potansiyeline sahip olduğu belirlenirken, CV yöntemi ile biyofilm oluşum düzeylerinin izolatlar arasında farklılık gösterdiği saptanmıştır. Özellikle WMY1-6, WGŞ1-3, WMY2-1, WMYA2-1 ve WGN2-1 kodlu izolatlar; bitki gelişimini teşvik edici özellikleri, biyofilm oluşturma kapasiteleri, bakır toleransları ve biyokontrol potansiyelleri bakımından öne çıkan adaylar olarak belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
This study was conducted to determine the plant growth-promoting properties, copper tolerance, and biocontrol potential against Xanthomonas arboricola pv. juglandis (Xaj) of epiphytic bacteria isolated from walnut (Juglans regia L.) leaves collected from seven provinces in the Eastern and Southeastern Anatolia regions of Türkiye, where walnut cultivation is widespread. A total of 100 bacterial isolates were cultured from samples collected from 58 walnut orchards. Copper tolerance of the isolates was evaluated on MGY medium supplemented with CuSO₄·5H₂O at concentrations ranging from 0 to 2.5 mM. The presence of the copA and cusA genes associated with copper tolerance was investigated by PCR using specific primers; however, neither gene was detected in the examined isolates. To determine the phenotypic adaptations developed by the isolates under copper stress, biofilm-forming capacities were assessed qualitatively through exopolysaccharide (EPS) production using the Congo Red Agar (CRA) method and quantitatively using the Crystal Violet (CV) microplate assay. The results revealed that a considerable proportion of the isolates possessed multiple plant growth-promoting bacterial (PGPB) traits and exhibited high levels of copper tolerance. Evaluation of plant growth-promoting characteristics showed that 74% of the isolates produced siderophores, 69.5% produced indole-3-acetic acid (IAA), 14% were capable of phosphate solubilization, 8% exhibited ACC deaminase activity, and 21% demonstrated nitrogen fixation ability. In addition, the antagonistic effects of the bacterial isolates against the walnut pathogen Xaj were evaluated through in vitro assays, and several isolates were found to significantly suppress pathogen growth. According to the CRA assay, 65% of the isolates exhibited biofilm-forming ability, while the CV assay demonstrated considerable variation in biofilm formation levels among the isolates. In particular, isolates WMY1-6, WGŞ1-3, WMY2-1, WMYA2-1, and WGN2-1 were identified as promising candidates due to their plant growth-promoting traits, biofilm-forming capacities, copper tolerance, and biocontrol potential.
Benzer Tezler
- Implementation of IPM strategies to control bacterial diseases of stone fruits and nuts caused by copper resistant/ tolerant pseudomonads and xanthomonads
Bakıra dayanıklı/ tolerant pseudomonads ve xanthomonads'ların sert çekirdekli meyveler ve cevizde neden oldukları bakteriyel hastalıkların kontrolünde tamamlayıcı IPM stratejileri
İREM ALTIN
Doktora
İngilizce
2021
ZiraatTekirdağ Namık Kemal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA MİRİK
PROF. DR. EMİLİO STEFANI
- Ceviz bakteriyel yanıklık hastalık etmeni Xanthomonas arboricola pv. juglandis'e karşı antagonist bakteriyel izolatların in vitro koşullarda biyokontrol etkinliklerinin belirlenmesi
Determination of in vitro biocontrol potentials of antagonist bacterial isolates against walnut blight disease agent Xanthomonas arboricola pv. juglandis
BİLGEN YÖRÜK
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatNamık Kemal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA MİRİK
- Juglonun evre IV glioblastoma multiforme beyin tümörü hücre hattındaki sitotoksik ve apoptotik etkilerinin analizi
Analysis of cytotoxic and apoptotic effects in Juglone's grade IV glioblastoma multiforme brain tumor cell line
TOLGA ÖNTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyokimyaYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHAMMED HAMZA MÜSLÜMANOĞLU
- Juglon yüklü nanopartiküllerin üretimi ve karakterizasyonu
Juglon loaded nanoparticles: preparation and characterization
GÖZDE YELKENCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyoteknolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. BANU MANSUROĞLU
DR. SERAP DERMAN