Nöronopatik Gaucher hastalarında etiyopatogeneze yönelik transkriptomik verilerin incelenmesi
Analysis of transcriptomic data for etiopathogenesis in neuropathic Gaucher patients
- Tez No: 1023667
- Danışmanlar: PROF. DR. SERAP DÖKMECİ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Endokrinoloji ve Metabolizma Hastalıkları, Tıbbi Biyoloji, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları, Endocrinology and Metabolic Diseases, Medical Biology, Child Health and Diseases
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Gaucher hastalığı, glukoserebrosidaz enzimini kodlayan GBA genindeki mutasyonlardan kaynaklanan otozomal resesif geçişli bir hastalıktır. Hastalığın üç alt tipi olup Tip 1 nörolojik tutulumun olmadığı düşünülen viseral bulgularla seyreden alt tipidir. Tip II akut nörolojik tutulum ile giden ve mortalitesi ağır olan bir alt gruptur. Tip III ise kronik nörolojik tutulum ile seyretmektedir. Nöronopatik formlarda bilinen mekanizmalar, kronik viseral formla aynı temel mekanizmalar üzerine oturmakta ve nöronlar birincil hedef olarak yer almaktadır. Artmış glukoserebrozidler, astrosit ve nöronlarda birikerek otofajik yolağın bozulmasına ve endoplazmik retikulumda kalsiyum miktarının artışına bağlı olarak nöronal hücre ölümünün artışı ile sonuçlanmaktadır. Makrofajların asıl etkilenen doku olması nedeniyle makrofajlardan izole edilen RNA verileri ile bu değişkenliklerin ve etkileşimlerin aydılatılabileceği düşünülmektedir. Bu projede, 5 nöronopatik GBA varyantları, 5 nöropatik olmayan GBA, 1 nöropatik GBA taşıyıcı ile 2 sağlıklı kontrol üzerinden analizlerin yapılması planlanmıştır. GBA genindeki mutasyonların neden olduğu bireylerin transkriptomik verileri etiyopatofizyolojik mekanizması araştırılacaktır. Alınacak periferik kandan polimorfonükleer hücreler, monosit kökenli makrofajlara dönüştürülerek RNA izolasyonu yapılacaktır.Olgulara RNA dizileme yapılarak örneklerin kalite kontrolleri sonrası referans genoma haritalandırılacak, diferansiye gen ekspresyon analizleri gerçekleştirilecektir. Elde edilen transkiptom verileri, DESeq2 package (v.1.30.1), ile bulunan transkriptlerin hangi biyolojik süreç, moleküler işlev ve biyokimyasal yolakta yer aldığını belirlemek için gen ontoloji (GO) ve yolak analizleri (etkilenen yolaklar CluePedia v. 1.5.7.) ile izole edilebilecektir. Bu projeden elde edilecek veriler ile Gaucher hastalarında hangi yolakların etkilendiği saptanacak, elde edilen veriler yeni moleküler mekanizmalara ve yeni tedavilere ışık tutacaktır.
Özet (Çeviri)
Gaucher disease is an autosomal recessive disease caused by mutations in the GBA gene encoding the glucocerebrosidase enzyme. There are three subtypes of the disease and Type 1 is the subtype with visceral findings, which is thought to be without neurological involvement. Type II is a subgroup with acute neurological involvement and severe mortality. Type III progresses with chronic neurological involvement. The mechanisms known in neuronopathic forms are based on the same basic mechanisms as in the chronic visceral form, with neurons as the primary target. Increased glucocerebrosides accumulate in astrocytes and neurons, resulting in an increase in neuronal cell death due to disruption of the autophagic pathway and an increase in the amount of calcium in the endoplasmic reticulum. Since macrophages are the main affected tissue, it is thought that these variations and interactions can be elucidated with RNA data isolated from macrophages. In this project, it is planned to analyze 5 neuropathic GBA variants, 5 non-neuropathic GBA, 1 neuropathic GBA carrier and 2 healthy controls. The transcriptomic data of individuals caused by mutations in the GBA gene will be investigated and the etiopathophysiological mechanism will be investigated. Polymorphonuclear cells from the peripheral blood to be taken will be transformed into monocyte-derived macrophages and RNA will be isolated. RNA will be sequenced and the samples will be mapped to the reference genome after quality controls, and differential gene expression analyzes will be performed. The obtained transcriptome data were used for gene ontology (GO) and pathway analyzes (pathways affected CluePedia v. 1.5.7) to determine which biological process, molecular function and biochemical pathway the transcripts found with the DESeq2 package (v.1.30.1) are involved in. can be isolated with The data obtained from this project will determine which pathways are affected in Gaucher patients, and the data obtained will shed light on new molecular mechanisms and new treatments.
Benzer Tezler
- Tip ı Gaucher hastalığında dentomaksillofasiyal tutulumun klinik ve radyolojik açıdan değerlendirilmesi
Clinical and radiological evaluation of the dentomaxillofacial involvement in the patients with TYPE gaucher disease
FİRDEVS AŞANTOĞROL
Diş Hekimliği Uzmanlık
Türkçe
2020
Diş HekimliğiErciyes ÜniversitesiAğız, Diş ve Çene Radyolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMİN MURAT CANGER
- Gaucher hastalığı izleminde uzun süreli sonuçlar
Long-term results in Gaucher disease monitoring
ELVIN ORUJOV
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAHMUT ÇOKER
- Glukozilseramidaz-beta gen mutasyonlarının dopaminerjik nöronlarda α-sinüklein yıkım mekanizmaları üzerindeki etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of glucosylceramidase-beta gene mutations on α-synuclein degradation mechanisms in dopaminergic neurons
GİZEM ÖNAL
Doktora
Türkçe
2021
Tıbbi BiyolojiHacettepe ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERAP DÖKMECİ
- Samsun ili yenidoğan gaucher taraması deneyimi
Samsun province newborn gaucher screening experience
TURAL MAMMADALIYEV
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıOndokuz Mayıs ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. IŞIL ÖZER
- Kemik iliği, karaciğer ve dalak biyopsisi patoloji materyalleri üzerinden prospektif olarak gaucher hastalığı sıklığının araştırılması
Investigation of the frequency of gaucher's disease through bone marrow, liver and sleen biopsy pathology materials prospectively
ALEV CANSU CERTEL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıOndokuz Mayıs ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. IŞIL ÖZER