Hepatit B virüsü ile enfekte hastalarda genotip belirlenmesi
Determination of hepatitis B genotypes in patients with HBV infection
- Tez No: 102998
- Danışmanlar: PROF. DR. NURDAN TÖZÜN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Gastroenteroloji, Gastroenterology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2001
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Gastroenteroloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 65
Özet
4. ÖZET Hepatit B virüsünün genomik yapısının araştırılmasında ileri moleküler biyolojik yöntemler kullanılarak önemli adımlar atılmıştır. HBV infeksiyonunun ciddi seyirli olması, kronikleşmesi ve tedavideki güçlükler infeksiyonun süreğenliğinde konağın dışında virüsün genom yapısındaki bazı değişikliklerle de ilişkili olduğunu akla getirmektedir. Hepatit B virüsü genomları moleküler düzeyde incelendiğinde, genomlar arasında en az %8 veya daha fazla farklılık olanlar kendi aralarında gruplandınlarak günümüzde A'dan G'ye 7 genotip tanımlanmıştır. Bu genotipler farklı coğrafi dağılım ve klinik tablolara eşlik etmektedirler. Bu çalışma, kronik HBV infeksiyonlannda PZR-RFLP yöntemiyle HBV genotiplerinin belirlenmesi ve hastalığın klinik seyriyle karşılaştırılması amacıyla, Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Gastroenteroloji Bilim Dalı işbirliği ile Marmara Üniversitesi Gastroenteroloji Enstitüsü'nde (M.Ü.G.E.) planlanmış ve enstitünün moleküler biyoloji laboratuvannda yapılmıştır. Bu amaçla çalışmaya, M.Ü.G.E. 'nde Digene Kiti ile rutin olarak serumdan bakılan HBV DNA miktarlarından sonuçları S pg/ml üzerinde pozitif olan 52 hasta alındı. HBV DNA, genotip tayini için NaOH ve HC1 yöntemi ile serumdan ekstrakte edilip PZR ile çoğaltıldıktan sonra Tsp 5091 ve Hinf I restriksiyon enzimleri ile kesildi. RFLP yöntemi ile elde edilen sonuçlan doğrulamak ve nükleotid farklılıklarını göstermek amacıyla 13 hastanın da otomatik DNA dizi analizleri, Ankara Üniversitesi Hepatoloji Enstitüsü'nde ABI 3 10 Genetic Analyser sistemi ile yapıldı. Çalışmada 52 kronik B hepatitli olgunun 24'ü çocuk ve 28'i ise erişkin hastalardan oluşmaktaydı. Hastaların tamamında HBV genotipinin genotip D olduğu saptandı. Aynı zamanda hastalarda bu genotipe ait literatürde belirtilen altı patemden üçü tespit edildi. D2 paterni %83 oranla baskın olarak saptandı. Sonuç olarak; ülkemizde hepatit B virüsü ile enfekte hastalarda D2 patemli genotip D dominant HBV genotipidir.
Özet (Çeviri)
5. SUMMARY Important steps have been achieved in the investigation of hepatitis B vims' genomic structure by the use of advanced molecular biological techniques. Genomic variation is an important subject since there are frequent relapsers or nonresponders among treated patients and the disease course can be quite severe. When HBV genomes were studied at molecular level, seven genomic groups called genotypes of HBV were defined based on a divergence of 8% or more of the complete genome and were designated from A to G. These genotypes were from different geographic regions and associated with different clinical outcomes. This study has been carried out at Marmara University Gastroenterology Institute (M.U.G.I.) in collaboration with Marmara University School of Medicine, Department of Gastroenterology in patients with chronic HBV infection with the aim of determining HBV genotypes by PCR-RFLP method and to compare the results with the patients clinical outcome. Fifty-two patients with an HBV DNA level over 5 pg/ml as determined by Digene Kit were entered into the trial. To determine genotypes, HBV DNA was extracted from the serum by the NaOH and HC1 method and amplified by PCR and then restricted by Tsp 5091 and Hinf I enzymes. Thirteen of patients DNA samples were sequenced automatically by ABI 310 system in Ankara University Hepatology Institute with the aim of confirming the results of RFLP method and to determine the nucleotide differences. In this study, 24 out of 52 patients with chronic hepatitis B were children and 28 were adults. Genotype D was found in all of the patients. Among 6 patterns of genotype D reported in the literature 3 were present in our series and D2 pattern was found to be the most frequent (83%). As a result, genotype D with pattern D2 is the dominant genotype in patients infected with HBV in our country.
Benzer Tezler
- Kronik hepatit b virüs (HBV) hastalarında hepatit d virüs (HDV) genotiplendirilmesi ve filogenetik analizi
Genotypes and phylogenetic characterization of hepatitis delta virus (HDV) in patients with chronic hepatitis B virus
PINAR DEMİREL ÖNER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Tıbbi BiyolojiFırat ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN BULUT
- Hatay bölgesinde hepatit B virus genotip dağılımı
Determination of hepatitis B virus genotypes in hatay
ŞULE PAKSOY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıMustafa Kemal ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SABAHATTİN OCAK
- Hepatit B virusu (HBV) ile kronik enfekte hastalarda HBV bazal kor promoter/prekor gen mutasyonları ve genotip değerlendirilmesi
Basal core promoter/precore gene mutations in chronically infected patients with hepatitis B virus and genotype evaluation
SEDA TEZCAN
Doktora
Türkçe
2009
MikrobiyolojiMersin ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜROL EMEKDAŞ
- Doğu karadeniz bölgesinde kronik hepaptit c hastalarının genotiplerinin değerlendirilmesi
Evaluation of the genotypes of patients with cronic hepatitis c in the eastern Karadeniz region
ESRA GÖKMEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıKaradeniz Teknik Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DOĞAN YUSUF UZUN
- The effect of HLA DPB1 alleles on the immune response in chronic Hepatitis B
Kronik Hepatit B hastalığında HLA DPB1 allelerin hastalığın immun yanıta etkisi
NİLAY GURBET KARATAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Tıbbi Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. GİZEM DİNLER DOĞANAY