Polimeraz zincirleme tepkimesi (PCR) ve floresans rezonans enerji transferi (FRET) ile mutasyon saptanması ve yöntemin tüberküloz basillerinin rifamisin türevlerine direncinin araştırlmasında kullanılması
Identification of mutations by polymerase chain reaction (PCR) and fluorescence resonance energy transfer (FRET) and application of the method to determination of resistance to rifamycin derivatives in tuberculosis bacilli
- Tez No: 107675
- Danışmanlar: DOÇ.DR. N. LEYLA AÇAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: M. tuberculosis, rifampisin direnci, PCR, FRET
- Yıl: 2001
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 70
Özet
Polimeraz zincirleme tepkimesi (PCR) ve floresans rezonans enerji transferi (FRET) ile mutasyon saptanması ve yöntemin tüberküloz basillerinin rifamisin türevlerine direncinin araştırılmasmda kullanılması. Hacettepe Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Biyokimya Programı Doktora Tezi, Ankara, 2001. Günümüzde önemli bir sağlık sorunu olmaya devam eden tübekülozdan toplumu korumanın en etkili yolu, erken tanı ve tedavidir. Antitüberküloz ilaçlara karşı direnç oranının giderek artması, etkili tedavi için tüberküloz basillerinin bu ilaçlara duyarlılığının bilinmesini önemli hale getirmiştir. Kültür yöntemleri ile tüberküloz basillerinin duyarlılığının saptanması aylar sürebildiğinden, ilaç direncini erken saptayacak moleküler yöntemler geliştirilmiş ancak bunlar uygulama zorluğu nedeniyle günlük kullanıma girememiştir. Bu çalışmada PCR ile çoğaltılan Mycobacteriwn luberculosis'in rpoB genindeki rifampisin direncinden sorumlu mutasyonlar, floresans rezonans enerji transferi proplan ile araştırıldı. Tek PCR karışım tüpünde, mutasyonlann en sık görüldüğü bölgelere uygun, farklı floresan boyalarla işaretli iki prop yardımı ile, rifampisin dirençli suşların %92.7'si saptanabildi. Bu yöntemle, rpoB'deki mutasyonlann yerlerininin de büyük ölçüde ayırt edilebilmesi, direncin hangi rifamisin türevlerine karşı olduğu konusunda fikir edinilmesini sağladı. Uygulaması kolay ve birkaç saat içerisinde tamamlanabilen bu yöntemin, klinik patoloji laboratuvannda günlük kullanıma girebileceği ve tüberküloz basillerinde rifampisin direncinin kısa sürede saptanmasında çok yararlı olacağı sonucuna varıldı.
Özet (Çeviri)
Identification of mutations by polymerase chain reaction (PCR) and fluorescence resonance energy transfer (FRET) and application of the method to detemination of resistance to rifamycin derivatives in tuberculosis bacilli Hacettepe University Health Sciences Institute Ph. D. Thesis in Biochemistry. Ankara, 2001. The most efficient way of protecting community from tuberculosis is early diagnosis and treatment. The increase in antituberculosis drug resistance, made susceptibility determination to these drugs more important. Since it often takes months to obtain the results of culture based susceptibiliy tests, many rapid methods based on molecular techniques have been developed but have not been used routinely due to their cumbersome methods. In this study, rifampin resistance due to mutations in rpoB gene of M tuberculosis strains, was investigated by fluorescence resonance energy transfer probes. It was possible to identify 92.7% of rifampin resistant strains, in a single tube PCR assay, by two probes labeled with two different fluorescent dyes. The capability of the method in also identification of mutation regions, provided the means for a good estimation of, which rifamycin derivatives the bacteria were resistant to. It was concluded that, this method which takes only a few hours and which is very easy to perform, may be very beneficial in rapid determination of rifampin resistance, in routine clinical pathology laboratories. ^SSKSSS» msb^
Benzer Tezler
- Engineering of bacteriophage M13 binding to inorganic surfaces as phage display ligands
İnorganik yüzeylere bağlanabilen bakteriyofajların faj gösterim ligandı olarak geliştirilmesi
ESMA AYBAKAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyoteknolojiAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar ÜniversitesiMedikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ERKAN MOZİOĞLU
PROF. DR. ZÜHTÜ TANIL KOCAGÖZ
- Erişkin periondotitis hastalarında Actinobacillus Actinomycetemcomitans'ın görülme sıklığı
Frequency of Actinobacillus Actinomycetemcomitans in adult periodontitis patients
AHMET KORKMAZ
Doktora
Türkçe
1998
Diş HekimliğiHacettepe ÜniversitesiPeriodontoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAKAN AKINCIBAY
- Bariatrik cerrahinin obezite ile ilişkilendirilmiş mikroRNA düzeylerine etkisi
Bariatric surgery effect on associated with obesity microRNA levels
SAMET YIĞMAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Genel CerrahiBezm-i Alem Vakıf ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ERKAN YARDIMCI
- The effect of concentration of biological fluids by hydrophilic elastic polymer beads on the sensitivity of SARS-CoV-2 diagnosis by real-time PCR
Hidrofilik elastik polimer boncuklar tarafından biyolojik sıvıların konsantrasyonunun izlenebilir polimeraz zincirleme tepkimesi kullanılarak SARS-CoV-2 tanısının duyarlılığına etkisi
DİLARA ÇANKAYA
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyoteknolojiAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar ÜniversitesiMedikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZÜHTÜ TANIL KOCAGÖZ
- Leishmania SPP. plasmodium SPP. ve toxoplasma gondii'nin gerçek zamanlı polimeraz zincirleme tepkimesi ile tanısı: Limit saptama
Diagnosis of leishmania sPP., plasmodium SPP. and toxoplasma gondii with polymerase chain reaction: Limit determination
TUBA OYUR KURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
ParazitolojiCelal Bayar ÜniversitesiTıbbi Parazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET ÖZBİLGİN