Geri Dön

Polimeraz zincirleme tepkimesi (PCR) ve floresans rezonans enerji transferi (FRET) ile mutasyon saptanması ve yöntemin tüberküloz basillerinin rifamisin türevlerine direncinin araştırlmasında kullanılması

Identification of mutations by polymerase chain reaction (PCR) and fluorescence resonance energy transfer (FRET) and application of the method to determination of resistance to rifamycin derivatives in tuberculosis bacilli

PDF İndir

  1. Tez No: 107675
  2. Yazar: Z. TANIL KOCAGÖZ
  3. Danışmanlar: DOÇ.DR. N. LEYLA AÇAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: M. tuberculosis, rifampisin direnci, PCR, FRET
  7. Yıl: 2001
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Polimeraz zincirleme tepkimesi (PCR) ve floresans rezonans enerji transferi (FRET) ile mutasyon saptanması ve yöntemin tüberküloz basillerinin rifamisin türevlerine direncinin araştırılmasmda kullanılması. Hacettepe Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Biyokimya Programı Doktora Tezi, Ankara, 2001. Günümüzde önemli bir sağlık sorunu olmaya devam eden tübekülozdan toplumu korumanın en etkili yolu, erken tanı ve tedavidir. Antitüberküloz ilaçlara karşı direnç oranının giderek artması, etkili tedavi için tüberküloz basillerinin bu ilaçlara duyarlılığının bilinmesini önemli hale getirmiştir. Kültür yöntemleri ile tüberküloz basillerinin duyarlılığının saptanması aylar sürebildiğinden, ilaç direncini erken saptayacak moleküler yöntemler geliştirilmiş ancak bunlar uygulama zorluğu nedeniyle günlük kullanıma girememiştir. Bu çalışmada PCR ile çoğaltılan Mycobacteriwn luberculosis'in rpoB genindeki rifampisin direncinden sorumlu mutasyonlar, floresans rezonans enerji transferi proplan ile araştırıldı. Tek PCR karışım tüpünde, mutasyonlann en sık görüldüğü bölgelere uygun, farklı floresan boyalarla işaretli iki prop yardımı ile, rifampisin dirençli suşların %92.7'si saptanabildi. Bu yöntemle, rpoB'deki mutasyonlann yerlerininin de büyük ölçüde ayırt edilebilmesi, direncin hangi rifamisin türevlerine karşı olduğu konusunda fikir edinilmesini sağladı. Uygulaması kolay ve birkaç saat içerisinde tamamlanabilen bu yöntemin, klinik patoloji laboratuvannda günlük kullanıma girebileceği ve tüberküloz basillerinde rifampisin direncinin kısa sürede saptanmasında çok yararlı olacağı sonucuna varıldı.

Özet (Çeviri)

Identification of mutations by polymerase chain reaction (PCR) and fluorescence resonance energy transfer (FRET) and application of the method to detemination of resistance to rifamycin derivatives in tuberculosis bacilli Hacettepe University Health Sciences Institute Ph. D. Thesis in Biochemistry. Ankara, 2001. The most efficient way of protecting community from tuberculosis is early diagnosis and treatment. The increase in antituberculosis drug resistance, made susceptibility determination to these drugs more important. Since it often takes months to obtain the results of culture based susceptibiliy tests, many rapid methods based on molecular techniques have been developed but have not been used routinely due to their cumbersome methods. In this study, rifampin resistance due to mutations in rpoB gene of M tuberculosis strains, was investigated by fluorescence resonance energy transfer probes. It was possible to identify 92.7% of rifampin resistant strains, in a single tube PCR assay, by two probes labeled with two different fluorescent dyes. The capability of the method in also identification of mutation regions, provided the means for a good estimation of, which rifamycin derivatives the bacteria were resistant to. It was concluded that, this method which takes only a few hours and which is very easy to perform, may be very beneficial in rapid determination of rifampin resistance, in routine clinical pathology laboratories. ^SSKSSS» msb^

Benzer Tezler

  1. Tez No

    749951

    The effect of topography-induced mechanotransduction on expression levels of focal adhesion-related genes in neuro-2A cells

    Topografyaya bağlı mekanotransdüksiyon'un nöro-2A hücrelerinde fokal adezyonla ilişkili genlerin ekspresyon düzeyleri üzerine etkisi

    ŞEYDA CULFA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyofizikOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÇAĞDAŞ DEVRİM SON

    DOÇ. DR. ALPAN BEK

  2. Tez No

    331282

    Kan dışı örneklerde hepatit C virus RNA'sının araştırılması

    Investigation of hepatitis C virus RNA in samples other than blood

    TUĞÇE İŞADAM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. A. ARZU SAYINER

  3. Tez No

    528895

    QCM tespit sistemlerinin genetik tespit yönünden kıyaslanması

    Comparison of QCM detection systems from genetic inspection

    ZEYNEP GÜNAYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyoteknolojiErciyes Üniversitesi

    Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHMET ÇAĞRI SOYLU

  4. Tez No

    476156

    Model tükürükte qcm sensör ile sentetik genetik materyal tespiti

    Synthetic genetic material detection with qcm sensor in model saliva

    FURKAN SOYSALDI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyomühendislikErciyes Üniversitesi

    Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MEHMET ÇAĞRI SOYLU

  5. Tez No

    649076

    Engineering of bacteriophage M13 binding to inorganic surfaces as phage display ligands

    İnorganik yüzeylere bağlanabilen bakteriyofajların faj gösterim ligandı olarak geliştirilmesi

    ESMA AYBAKAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    BiyoteknolojiAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi

    Medikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ERKAN MOZİOĞLU

    PROF. DR. ZÜHTÜ TANIL KOCAGÖZ

Geri Dön