Ortam şartlarının Ty2 retrotranspozunu transkripsiyonuna ve frameshift oranına etkilerinin analizi
The Analysis of the growth conditions transcription and frameshift rate of Ty2 retrotransposon
- Tez No: 139923
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SEZAİ TÜRKEL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2003
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Uludağ Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 71
Özet
m ÖZET: Ortam Şarttaımaa Ty2 Retrotranspozoöu Transkripsiyonuna ve Frameshift Oamna Etkilerinin Analizi Ty2 retrotranspozonu S.cerevisim genomunda bulunan ve RNA aracüıgı 3e genomda bir bölgeden başka bir bölgeye hareket eden beş grup Ty LTR elementinden birisidir. Ty2 retroteanspozonu çok sayıda düzenleyici element içeren yoğun bir promoter yapışma sahip olup hücre içerisindeki bir çok metabolik dalgalanmalara karşı transkripsiyon seviyesinde dengeleme yapma yeteneğine satuptir. B» yüzden, mayanın içinde bulunduğu ortam şartlan, aynı zamanda Ty2 retroelementinm transkripsiyonel düzenlenmesinde önemli role sahiptir. Ty2 retroelementi retroviral GAG ve POL homologu, TYA ve TYB genlerine sahiptir. Bunlardan POL homologu, T¥B translasyon sırasında TYA:TYB fuzyon pepticü halinde Translasyonal Frameshift olarak adlandırılan bir mekanizma üe sentezlenir. Frameshift olayı translasyonda % 26 lık bir oranla gerçekleşir ve bu oran Ty2 retrotranspozonunun yaşamında hayati öneme sahiptir. Bu oranda herhangi bir sapma Ty2'nin yaşam döngüsünü negatif olarak etkiler. Bu araştırmada, Ty2 elementinin, büyüme safhalarına ve karbon kaynağındaki değişimlere göre, transkripsiyon ve frameshift oranındaki değişiklikleri incelendi. Buna ek olarak karbon kaynağındaki değişime yanıt olarak tor İL, sip-4A ve cot-SA mutantlarmda Ty2 elementinin transkripsiyon ve frameshift oranının seviyesi incelendi. Çalışmalarda Ty2 transkripsiyonu ve frameshift oranının, durağan safha dışında büyümeye paralellik gösterdiği gözlendi. Karbon kaynağındaki değişime yanıt olarak sip~4&. ve cot-SA mutantlarmda yaban tipe kıyasla transkripsiyon seviyesinde önemli bir farklılık gözlenmezken, tor] A mutanönda fermente edilebilen karbon kaynağında% fermente edilemeyen karbon kaynağına aktarıldığında, frameshift orammn yaban tip hücrelerde görülenden % 50 daha düşük seviyede kaldığı belirlendi.
Özet (Çeviri)
IV ABSTRACT: The analysis of the effects of the growth conditions on the transcription and frameshift rate of Ty2 retrotransposon. Ty2 retrotransposon of S.cerevisiae is one of the five families of Ty LTR elements found in the yeast genome. They transpose by way of RNA intermediates from one location to the another in the yeast genome. Ty2 retrotransposon has a highly saturated promoter structure containing many regulatory elements giving it the ability of buffering the intracellular metabolic fluctuations at the transcription level. Therefore the environmental conditions m which S.cerevisae cells grow have a significant role in the transcriptional regulation of Ty2 retroelement. Ty2 retroelenient has TYA and TYB genes homologous to retroviral GAG and POL genes. The POL homolog of Ty2, TYB is synthesized in the form of TYA::TYB fusion peptide by a mechanism called Traaslational Frameshift during the translation. Frameshift event occurs at % 26 of times during translation and that Frameshift rate is very crucial for the life of Ty2 retrotransposon. Any deviation from this rate affects the life cycle of Ty2 negatively. In this research, the alterations in the transcription and frameshift rate of Ty2 element were investigated with respect to the growth stages and the changes of carbon source. Apart from that, the levels of Frameshift rate and transcription of Ty2 element were examined in tori A, sip-4A and cat-8A mutant strains in response to carbon source changes. Transcription and frameshift rate were seen to show paralel patterns relative to the Growth curve except for the stationary phase, la the mutants of sip-4A and cat-SA, while no dramatic alteration was observed in response to the changes in the earbon source, when compared with the wild type, in tori A mutant, frameshift rate was detected to stay % 50 less than it was seen in the wild type, when shifted to non-fermentable carbon source.
Benzer Tezler
- Soğuk ortam şartlarının, tercih edilen kadans ve hareket ekonomisine etkileri
Effects of cold ambient on self-selected cadence and efficiency
YASİN YÜZBAŞIOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
SporEge ÜniversitesiHareket ve Antrenman Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BEKİR MUZAFFER ÇOLAKOĞLU
- Biyoklimatik konfor ölçütlerinin peyzaj planlama sürecindeki etkinliği; Van ili örneği
The effectiveness of the landscape planning process of the bioclimatic comfort criteria; example of Van province
AMRAGIA H MOSTAFA ELAHSADI
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
MimarlıkKastamonu ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET ÇETİN
- Dış ortam şartlarının ağaç malzemenin yanma özelliklerine etkileri
Effects of outdoor conditions to the combustion properties of wood materials
ŞEKİP ŞADİYE YAŞAR
Doktora
Türkçe
2015
Ağaç İşleriGazi ÜniversitesiMobilya ve Dekorasyon Eğitimi Ana Bilim Dalı
PROF. MUSA ATAR
- Dış ortam şartlarının verniklenmiş ardıç odununun bazı fiziksel özelliklerine etkisi
The effects of outside conditions over some characteristics of varnished juniper wood
SERVET BİLGEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
Ağaç İşleriKarabük ÜniversitesiMobilya ve Dekorasyon Eğitimi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYHAN ÖZÇİFÇİ