Geri Dön

Computational search of the interaction between melanopsin and cryptochrome proteins

Melanopsin ve cryptochrome proteinleri arasındaki etkileşimin hesaplamalı araştırması

PDF İndir

  1. Tez No: 182054
  2. Yazar: EVRİM BESRAY ÜNAL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. BURAK ERMAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biyoloji, Mühendislik Bilimleri, Biochemistry, Biology, Engineering Sciences
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2006
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Koç Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Hesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 134

Özet

Canlıların biyolojik, fizyolojik ve davranışsal fonksiyonlarındaki salınımlara Sirkadyanritmleri adı verilir. Sirkadyan ritmler yaklaşık olarak 24 saatlik döngülerle tekrarlanırlar.Memelilerde bu ritmler içsel bir saat tarafından düzenlenir; iç saat mekanizması beyindebulunan suprakiazmatik çekirdek (SCN) adlı yapı tarafından kontrol edilmektedir. SCN,çevresel ışık-karanlık evreleri ile senkronize çalışır.Retina tarafından algılanan ışık SCN'ye optik sinirler aracılığı ile haber verilmektedir.Retinada ışık algılayıcı proteinler bulunmaktadır. Bu proteinler retinadaki ışığı algılayıp içselsaate sinyal iletimi yapmak ile görevlidirler. Cryptochrome ve Melanopsin adlı proteinler(muhtemelen opsin familyasından başka proteinler ile birlikte) Sirkadyan ritmlerde görevalan, ışığı algılayan fotoreseptörlerdir.Deneysel sonuçlar iç saatin düzenli çalışması için Cryptochrome ve Melanopsinproteinlerinin muhtemel bir etkileşim içinde olmalari gerektiğini göstermektedir. Buçalışmada, olası etkileşimi kanıtlayabilmek için Melanopsin ve Cryptochrome proteinlerinintersiyer yapıları; ve iki protein arasındaki etkileşim hesaplamalı yöntemler kullanılarakbulunmuştur.Çalışmanın sonuçları memeli Melanopsin ve Cryptochrome proteinlerinin etkileşimiçerisinde olduğunu göstermektedir. Cryptochrome proteinin N-ucu Melanopsin proteinin C-ucu ve sitoplazmik kısımları ile etkileşmektedir. In vivo etkileşim, flüoresan mikroskopitekniği ile desteklenmektedir.

Özet (Çeviri)

Circadian rhythms are oscillations in the biochemical, physiological, and behavioralfunctions of organisms that occur with a periodicity of approximately 24 hours. Inmammals, circadian rhythm is generated by a molecular clock. The molecular clock,which is located at suprachiasmatic nuclei (SCN) part of brain, is synchronized byenvironmental light-dark cycle.The cryptochromes are the mammalian circadian photoreceptors; they absorb light andtransmit the signal to the molecular clock. The cryptochromes and melanopsin (andpossibly other opsin family pigments) have been proposed as circadian photoreceptorpigments that exist in the inner retina. Experimental studies imply that there is mostprobably an interaction between melanopsin and cryptochromes for molecular clock tofunction normally. In order to uncover this interaction; the tertiary structures ofMelanopsin and Cryptochrome; the possible interaction between those two proteins havebeen predicted by usage of different computational means.The results of this study imply that mammalian Melanopsin and Cryptochrome proteinsinteract. The N-termini of Cryptchrome protein interacts with C-termini and cytoplasmictails of Melanopsin protein. The in vivo interaction is supported by preliminaryflourescent microscopy technique.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    879006

    Kr VII için elektrik dipol (E1), elektrik kuadrupol (E2) ve manyetik dipol (M1) geçişleri

    Electric dipole (E1), electric quadrupole (E2) and magnetic dipole (M1) transitions for Kr VII

    HURİSEL BASMACI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Fizik ve Fizik MühendisliğiSakarya Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SELDA ESER

  2. Tez No

    355294

    Visual structures for generative design search spaces

    Üretken tasarım çözüm alanlarında görsel yapılandırma

    GÜNSU MERİN ABBAS

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    MimarlıkOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Mimarlık Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. İPEK GÜRSEL DİNO

    PROF. DR. AHMET CAN BAYKAN

  3. Tez No

    353682

    İnsan ve HIV-1 proteinleri arasındaki etkileşimlerin rastgele orman yöntemi ve birlikte öğrenme yaklaşımı ile tahmin edilmesi

    Predicting human-HIV 1 protein-protein interactions using random forests in a co-training approach

    İSMAİL BİLGEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZEHRA ÇATALTEPE

  4. Tez No

    445065

    Dolgun geometrili bir gemide kıç formu ve pervane konumunun sevk verimine olan etkisinin incelenmesi

    An investigation into the effect of the aft form and propeller location on the propulsive efficiency of a blunt ship

    GÜRBÜZ BİLİCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Gemi Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gemi İnşaatı ve Gemi Makineleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. UĞUR ORAL ÜNAL

    DOÇ. DR. EBRU SARIÖZ

  5. Tez No

    255978

    Causality analysis in biological networks

    Biyolojik ağlarda nedensellik analizi

    ÖZGÜN BABUR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2010

    Biyoistatistikİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

    DOÇ. DR. UĞUR DOĞRUSÖZ

Geri Dön