Geri Dön

Türkiye'de metakromatik lökodistrofi hastalığına neden olan mutasyonların belirlenmesi biyokimya-genotip-fenotip ilişkisinin kurulması.

Determination of mutations causing Metachromatic Leukodystrophy disorder in Turkey: Building the biochemical-genotype-phenotype relationship.

  1. Tez No: 195743
  2. Yazar: EVREN ÖNDER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ASUMAN ÖZKARA
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 82

Özet

Metakromatik lökodistrofi (MLD), sülfatidi parçalayan arilsülfataz A (ASA) enzimi veya aktivatör proteini olan sapozin B'nin eksikliği nedeni ile oluşan bir lizozomal depo hastalığıdır. Bu eksiklik sonucu lizozom içinde sülfatid birikerek, periferik ve santral sinir sisteminde ilerleyici tipte demiyelinizasyona neden olur. Bu çalışmada klinik bulguları ve enzim analizi ile MLD tanısı almış 6 hasta ile bir ailenin ASA genindeki mutasyonları araştırıldı. Bu mutasyonların saptanması için polimeraz zincir reaksiyonu (PCR), Tek Zincir Konformasyon Polimorfizmi (SSCP) analizi, DNA dizi analizi yapıldı. Çalışmamız sonucunda hastalığa neden olan 2 yeni mutasyon ve 2 polimorfizm bulundu. Yeni mutasyonlar ekson 5'te 1568G-A, 307Glu-Lys ve 1603G-T, 318Trp-Cys mutasyonları, polimorfizmler ise ekson 7'de 2161C-G, 391Thr-Ser ve ekson6'da 178A-G, 350Asn-Ser değişimleridir. Yeni tanımlanan ekson5 mutasyonları ASA proteininin iyi korunmuş yapısal elemanlar bölgesinde bulunmaktadır. Bu nedenle, ekson5'teki 307Glu-Lys ve 318Trp-Cys mutasyonları, muhtemelen ASA proteininde sırasıyla 6. alfa-heliks ve 12. beta-tabakalı yapıyı bozarak aktif bölge konformasyonunu değiştirmekte ve enzim aktivitesinde eksikliğe neden olmaktadır. Ekson5'te 1568G-A 307Glu-Lys mutasyonu olan iki hastada hastalığa neden olan bu mutasyonun yanısıra, ekson7'de daha önce tanımlanmış 2161C-G, Thr391-Ser polimorfizmi de saptanmıştır. Ekson7 polimorfizminin 6 hastanın 3 tanesinde bulunması bu polimorfizmin Türkiye'de MLD hastalığına yatkınlık yapan bir faktör olabileceğini düşündürmektedir. Bu çalışma, MLD'li Türk hastalarda, hastalığın mekanizmasını anlamak için yapılan moleküler düzeydeki ilk çalışmadır ve MLD'ye neden olan mutasyonların ülkemize özgü olduğunu ve polimorfizmlerle birlikte olabileceğini göstermiştir.

Özet (Çeviri)

Metachromatic leukodystrophy (MLD) is a lysosomal storage disorder caused by the deficiency of arylsulfatase A (ASA) that hydrolyzes sulfatide or its activator protein saposin B. This deficiency causes sulfatide accumulation in lysosome leading to demyelination in central and peripheral nervous system. In this research, ASA gene mutations in 6 patients and a family diagnosed as MLD through clinical symptoms and enzyme analysis were investigated; polymerase chain reaction (PCR), single strand conformation polymorphism (SSCP) analysis and DNA sequence analysis were carried. Findings revealed that two novel mutations and two polymorphisms caused the disorder. The novel mutations are 1568G-A, 307Glu-Lys, 1603G-T, 318Trp-Cys in exon5, polymorphisms are 2161C-G, 391Thr-Ser in exon7, 1788A-G, 350Asn-Ser in exon6. Newly identified exon5 mutations are in highly conserved structural elements region of ASA protein. Thus, 307Glu-Lys and 318Trp-Cys mutations in exon5 probably change the active site conformation by disrupting the 6th alpha helix and the 12th beta-sheet structure of ASA protein, respectively and cause deficiency in enzyme activity. In two of the patients, in addition to exon5 1568G-A, 307Glu-Lys mutation that caused the disorder, 2161C-G, 391Thr-Ser polymorphism that was previously identified in exon 7 was also detected. Three out of 6 patients had exon7 polymorphism showing the possibility that polymorphism is a predisposition causing MLD disorder in Turkey. This is the first study on the molecular basis to understand the mechanism of the disorder in Turkish patients with MLD and revealed that mutations leading to MLD are unique to our country and could develop together with polymorphism.

Benzer Tezler

  1. Geological, geochemical investigation and subsurface modeling of porphyry copper-molybdenum deposit in Tepeoba-Havran, Balikesir (NW Turkey)

    Tepeoba-Havran, Balıkesir'in porfir bakır-molibden yatağının jeoloji, jeokimya ve yer altı modelleme incelenmesi

    TORKAN TAHERI BONAB

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Jeoloji Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA KUMRAL

  2. Şapçı (İbirler-Balıkesir) Volkaniti'nin petrografisi, jeokimyası ve petrolojisi

    Petrography, geochemistry and petrology of the Şapçı (İbi̇rler-Balıkesi̇r) volcanite

    DİLBER ERDEM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Jeoloji MühendisliğiBalıkesir Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZAFER ASLAN

  3. Kızıldağ (Hatay, G Türkiye) ofiyolitinin petrolojisi: Yitim zonunda meydana gelen ergiyik-kayaç etkileşimi ilişkili metazomatik olaylar

    Petrological characteristics of Kızıldağ (Hatay, SW-Turkey) ophiolite, melt-rock interaction and metasomatizm effects in a supra-subduction zone setting

    AHMET DÜNDAR ŞEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Jeoloji MühendisliğiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İBRAHİM UYSAL

  4. Yıldızeli (Sivas) ve Almus (Tokat) ilçeleri arasında yer alan senozoyik yaşlı magmatik birimlerin petrojenezi ve bölgenin jeotektonik evriminin araştırılması

    Petrogenetic and geotectonic evolution of the cenozoic magmatism in between Yildizeli (Sivas) and Almus (Tokat) regions

    GÖNENÇ GÖÇMENGİL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Jeoloji Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEKİYE KARACIK

  5. Kalsik bor-silikatların duraylılık alanlarının deneysel incelenmesi: Ege bölgesi (Türkiye) hidrotermal mineralizasyon sistemlerine uygulanması

    The Experimental investigation of stability field of calcic boro-silicates; application to the hydrothermal mineralisation systems of Aegean region (Turkey)

    TOLGA OYMAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    Jeoloji MühendisliğiDokuz Eylül Üniversitesi

    PROF.DR. ÖZKAN PİŞKİN