Konya bölgesindeki Nannospalax nehrigi satunin, 1898 (Mammalia:Rodentia) üst türünün sscp metodu kullanılarak sitokrom B geninin dna dizi analizi varyasyonları
Dna sequence analysis variations of the cytochrome B gene using sscp method of the Nannospalax nehringi satunin, 1898 (Mammalia:Rodentia) superspecies in Konya region
- Tez No: 237512
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. EMİNE ARSLAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Selçuk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 80
Özet
Bu çalışmada morfolojik olarak ayırt edilemeyen Nannospalax nehringi üsttürüne ait 2n=40, 58 ve 60 kromozomal formların mitokondrial bir gen olan sitokrom b geni ile genetik akrabalığın belirlenmesi amaçlanmıştır. Konya bölgesinde yayılış gösteren bu kromozomal formların sitokrom b geninin dizi varyasyonları SSCP ve dizi analizi metodu kullanılarak tespit edilmiştir. DNA dizi analizi sonuçları ile CLC Main Workbench versiyon 5.1 bilgisayar programı yardımıyla genetik akrabalığı gösteren dendrogram elde edilmiştir. Bu dendrograma göre 2n=40 kromozomal forma ait bireyler ayrı monofiletik bir grupta yer alırken, bundan oldukça farklı bir yerde ise 2n=58 ve 60 kromozomal forma ait örnekler kümelenmişlerdir. On üç farklı lokaliteden toplam 14 kör fare örneğinin sitokrom b geni dizi varyasyonları %18.6 olarak hesaplanmıştır ve bu varyasyonların %26.6'sı transversiyondur. Dizi analizi sonuçlarına göre baz pozisyonundaki en çok farklılık 2n=40 kromozomal form ile 2n=60 kromozomal form arasında görülmüştür (%10.2). Elde edilen sonuçlar 2n=40 kromozomal formun türleşmesini desteklemektedir. SSCP ve dizi analizi yöntemleri kullanılarak Sitokrom b geninin kör farelerin filogenisinde oldukça faydalı olduğu görülmüştür.
Özet (Çeviri)
The aim of this study was to determine the genetic relationship of the chromosomal forms of 2n=40, 58 and 60 that belong to Superspecies, Nannospalax nehringi, which was not classified morphologically with cytochrome b gene, the mitochondrial gene. Sequence variations of cytochrome b gene of these chromosomal forms distributed in Konya region were found using SSCP and sequence analysis method. With DNA Sequence analysis results, dendrogram which shows genetic relationship was obtained with the help of CLC Main Workbench version 5.1 computer programme. According to this dendrogram, while indivuduals belonging to 2n=40 choromosomal form take place in a separate monophyletic group, samples belonging to 2n=58 and 60 chromosomal forms are clustered in a quite different place. From thirteen different localities, cytochrome b sequence variations of 14 blind mole rat samples were estimated as 18.6%, and 26.6% of these variations are transversions. According to sequence analysis, the biggest difference in base position was observed between 2n= 40 chromosomal form and 2n= 60 chromosomal form (10.2%). The results supported the classification of the two chromosomal forms. By using SSCP and sequence variation, cytochrome b gene was observed to be quite useful in phylogeny of blind mole rats.
Benzer Tezler
- Konya bölgesindeki nannospalax (Mammalia:Rodentia) kromozomal formlarının (2n=40,58,60) heterokromatin dağılımı ve nükleolar organizatör bölgeleri (NORs)
Heterochromatin distribution and nucleolar organizer regions (nors) of nannospalax (Mammalia:Rodentia) chromosomal forms (2n=40,58,60) in Konya province
ŞÜKRÜYE AKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
BiyolojiSelçuk ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ATİLLA ARSLAN
- Konya bölgesindeki büyükbaş hayvan işletmelerinde biyogaz tesisi kurulumunun incelenmesi
Investigation of the establishment of biogas plant in cattle farms in Konya region
MUSTAFA DEMİRÖZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
EnerjiMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiEnerji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALİ KEÇEBAŞ
- Konya bölgesindeki mevcut tabii agrega ve kırmataş ile yüksek mukavemetli beton imali
Production of high strength concrete from the available natural and crushed stone aggregates in Konya
Z.ULVİYE ATAY
Yüksek Lisans
Türkçe
1992
İnşaat MühendisliğiSelçuk Üniversitesiİnşaat Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA KARADUMAN
- Konya bölgesindeki sığırlarda bovine herpesvirus-1 (BHV-1) enfeksiyonunun nötralizasyon testi ve enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) ile karşılaştırmalı olarak araştırılması
Comparative study of bovine herpesvirus-1 (BHV-1) infection in cattle by neutralisation test and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) in Konya region
SERPİL YANBAKAN
- Konya bölgesindeki linyitlerin yıkanabilirliği ve termal özelliklerinin belirlenmesi
Determination of washability and thermal properties of lignites from Konya region
ŞERİFE GÖKÇE ERDOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Maden Mühendisliği ve MadencilikSelçuk ÜniversitesiMaden Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. TEVFİK AĞAÇAYAK