Konya bölgesindeki Nannospalax nehrigi satunin, 1898 (Mammalia:Rodentia) üst türünün sscp metodu kullanılarak sitokrom B geninin dna dizi analizi varyasyonları
Dna sequence analysis variations of the cytochrome B gene using sscp method of the Nannospalax nehringi satunin, 1898 (Mammalia:Rodentia) superspecies in Konya region
- Tez No: 237512
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. EMİNE ARSLAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Selçuk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 80
Özet
Bu çalışmada morfolojik olarak ayırt edilemeyen Nannospalax nehringi üsttürüne ait 2n=40, 58 ve 60 kromozomal formların mitokondrial bir gen olan sitokrom b geni ile genetik akrabalığın belirlenmesi amaçlanmıştır. Konya bölgesinde yayılış gösteren bu kromozomal formların sitokrom b geninin dizi varyasyonları SSCP ve dizi analizi metodu kullanılarak tespit edilmiştir. DNA dizi analizi sonuçları ile CLC Main Workbench versiyon 5.1 bilgisayar programı yardımıyla genetik akrabalığı gösteren dendrogram elde edilmiştir. Bu dendrograma göre 2n=40 kromozomal forma ait bireyler ayrı monofiletik bir grupta yer alırken, bundan oldukça farklı bir yerde ise 2n=58 ve 60 kromozomal forma ait örnekler kümelenmişlerdir. On üç farklı lokaliteden toplam 14 kör fare örneğinin sitokrom b geni dizi varyasyonları %18.6 olarak hesaplanmıştır ve bu varyasyonların %26.6'sı transversiyondur. Dizi analizi sonuçlarına göre baz pozisyonundaki en çok farklılık 2n=40 kromozomal form ile 2n=60 kromozomal form arasında görülmüştür (%10.2). Elde edilen sonuçlar 2n=40 kromozomal formun türleşmesini desteklemektedir. SSCP ve dizi analizi yöntemleri kullanılarak Sitokrom b geninin kör farelerin filogenisinde oldukça faydalı olduğu görülmüştür.
Özet (Çeviri)
The aim of this study was to determine the genetic relationship of the chromosomal forms of 2n=40, 58 and 60 that belong to Superspecies, Nannospalax nehringi, which was not classified morphologically with cytochrome b gene, the mitochondrial gene. Sequence variations of cytochrome b gene of these chromosomal forms distributed in Konya region were found using SSCP and sequence analysis method. With DNA Sequence analysis results, dendrogram which shows genetic relationship was obtained with the help of CLC Main Workbench version 5.1 computer programme. According to this dendrogram, while indivuduals belonging to 2n=40 choromosomal form take place in a separate monophyletic group, samples belonging to 2n=58 and 60 chromosomal forms are clustered in a quite different place. From thirteen different localities, cytochrome b sequence variations of 14 blind mole rat samples were estimated as 18.6%, and 26.6% of these variations are transversions. According to sequence analysis, the biggest difference in base position was observed between 2n= 40 chromosomal form and 2n= 60 chromosomal form (10.2%). The results supported the classification of the two chromosomal forms. By using SSCP and sequence variation, cytochrome b gene was observed to be quite useful in phylogeny of blind mole rats.
Benzer Tezler
- Konya bölgesindeki nannospalax (Mammalia:Rodentia) kromozomal formlarının (2n=40,58,60) heterokromatin dağılımı ve nükleolar organizatör bölgeleri (NORs)
Heterochromatin distribution and nucleolar organizer regions (nors) of nannospalax (Mammalia:Rodentia) chromosomal forms (2n=40,58,60) in Konya province
ŞÜKRÜYE AKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
BiyolojiSelçuk ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ATİLLA ARSLAN
- Konya bölgesindeki çocuklarda kabakulak antikorlarının araştırılması
Başlık çevirisi yok
ERKAN ATAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1994
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSelçuk ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
- Konya bölgesindeki linyitlerin yıkanabilirliği ve termal özelliklerinin belirlenmesi
Determination of washability and thermal properties of lignites from Konya region
ŞERİFE GÖKÇE ERDOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Maden Mühendisliği ve MadencilikSelçuk ÜniversitesiMaden Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. TEVFİK AĞAÇAYAK
- Konya bölgesindeki mastitisli ineklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının real-time PCR ile çeşitli virulans genlerinin (PVL, LukED, ?-hemolizin) kantitatif analizi
Quantitative analysis of various virulance genes (PVL, LukED, ?-hemolysin) by real-time pcr of Staphylococcus aureus strains isolated from bovine mastitis in Konya region
SERENGÜL LADİKLİ
- Konya bölgesindeki tarihi yapılarda kullanılan kayaların bozunma özelliklerinin araştırılması
Investigation of the weathering properties of rocks used in historical structures in the Konya region
MUSTAFA ASIM TEKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Jeoloji MühendisliğiKütahya Dumlupınar ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNAL ABİDDİN ERGÜLER