Geri Dön

Türkiye populasyonunda 16 Y-STR lokusunun (DYS456, DYS389I, DYS390, DYS389II, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS635, DYS392, Y GATA H4, DYS437, DYS438, DYS448) polimorfizmleri ve bunların adli alanda kullanımı

Polimorphisms of 16 Y-STRs loci (DYS456, DYS389I, DYS390, DYS389II, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS635, DYS392, Y GATA H4, DYS437, DYS438, DYS448) in Turkish population and their forensic evaluation

PDF İndir

  1. Tez No: 256857
  2. Yazar: ABDÜLMÜTTALİP ÖZKORKMAZ
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MELİKE BOR
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Adli Tıp, Biyoloji, Tıbbi Biyoloji, Forensic Medicine, Biology, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 176

Özet

Y kromozomal STR lokusları adli vakaların çözülmesinde, babalık davalarında, evrim ve antropolojik çalışmalar ile moleküler çalışmalarda kullanılmaktadır. Bu çalışmada Türk populasyonuna ait 130 sağlıklı ve birbirleriyle akrabalığı bulunmayan bireyde 16 Y kromozomal kısa tekrar dizilerinin haplotip frekansları belirlenmiştir. DNA örnekleri ağız svapları kullanılarak toplanmış ve Qiagen ticari kiti ile DNA ekstraksiyonları yapılmıştır. PCR amplifikasyonu ve elektroforezi uygulandıktan sonra DYS456, DYS389I, DYS390, DYS389II, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS635, DYS392, Y GATA H4.1, DYS437, DYS438 ve DYS448 lokuslarının tiplendirilmesi yapılmıştır. Çalışmamızda alel duplikasyonu ve mutasyonları gibi olağan dışı durumlara rastlanmıştır. DYS389 I, DYS458, DYS19, DYS393, DYS439, DYS635, DYS438 ve DYS448 lokuslarında lokus başına birden fazla alel gözlenmiştir. Daha önce Türk populasyonunda bildirilmemiş toplam 14 duplikasyon DYS389I (iki duplikasyon), DYS458(dört duplikasyon) DYS19 (dupliasyon), DYS393 (duplikasyon), DYS 391 (iki duplikasyon), DYS439 (duplikasyon), DYS635 (üç duplikasyon), DYS438 (duplikasyon), DYS448 (duplikasyon) bulunmuştur. Lokus duplikasyonlarının tanımlanması, genetik varyasyonun dağılımı ve ilk kez belirlenen aleller referans databazlar için daha konsantre örnekleme stratejilerine ihtiyaç olduğunu işaret etmektedir. Çalışmamızda bilinen alel aralığının dışında beş alel daha tanımlanmıştır: lokus DYS389I de alel 7, lokus DYS635 de alel 27, lokus DYS437de alel 9 ve 12, lokus DYS438de alel 15.Çalışmada, elde edilen tüm haplotipler birbirinden farklı olup haplotip çeşitliliği 1.0 ve ayırım gücü %100'dür. Y STR lokusu için gen çeşitlilik değerleri 0.6002 (DYS391) ile 0.9689 (DYS385a/b) arasında değişmektedir. Yüksek haplotip çeşitliliğini etkileyen nedenlerden biri çalışılan populasyonda yakın zamanda meydana gelen demografik farklılıklar olabilir. Anadolu populasyonunu çoklu etnik ve ırksal populasyonlardan oluştuğu unutulmamalıdır. Adli açıdan, 16 Y STR'nin ortak polimorfizmi teşhis etkinliğini artırmaktadır. Aynı zamanda sonuçlar bu lokusların Türkiye'de adli alanda insan identifikasyonu ve babalık testlerinde çok kullanışlı olduğunu ortaya koymaktadır.

Özet (Çeviri)

Y-Chromosomal STR loci are used as powerful tools in forensic casework, paternity testing, evolutionary and anthropological studies and moleculer diagnostics. In this study haplotype frequencies for 16 Y-chromosomal short tandem repeat (STR) loci, were determined in 130 unrelated healthy individuals from Turkey. DNA was extracted from buccal swabs by Qiagen Tissue kit.After PCR amplification and denaturing electrophoresis, DYS456, DYS389, DYS390, DYS389II, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS635, DYS392, Y GATA H4.1, DYS437, DYS438 and DYS448 loci were typed. We report some non-standard situations, such as allele duplications and mutations. More than one allele per locus at the DYS389 I, DYS458, DYS19, DYS393, DYS439, DYS635, DYS438 and DYS448 loci was observed. A total of fourteen duplications, not reported previously in Turkish population, were found at DYS389I (two duplication), DYS458(four duplication) DYS19 (duplication), DYS393 (duplication), DYS 391 ( two duplication), DYS439 (duplication), DYS635 (three duplication), DYS438 (duplication), DYS448 (duplication). Identification of locus duplications, distribution of genetic variation and firstly identified alleles point to the necessity of more focused sampling strategies for reference databases. We additionally identified five allele outside the known allelic range: allele 7 at locus DYS389I, allele 27 at locus DYS635, allele 9 and 12 at locus DYS437, allele 15 at locus DYS438.In this sample, all haplotypes obtained were different, therefore, haplotype diversity was 1.0 and discrimination capacity was 100%. The gene diversity values for the Y-STRs loci ranged from 0.6002 (DYS391) to 0.9689 (DYS385a/b). One factor that may have influenced the high haplotype diversity observed is the recent demographic change of the studied population. It must be remembered that Anatolian population is a combination of multiethnic and multiracial one. From the forensic point of view, the combined polymorphisms of the 16 Y-STRs provide a high diagnostic efficiency. Also the results demonstrate that these loci will be very useful for human identification in forensic cases and paternity tests in Turkey.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    282510

    Elazığ il populasyonuna ait 16 Y-STR lokusları için alel frekansları dağılımının incelenmesi

    Examining the distribution of allele frequencies of 16 Y Short Tandem Repeat (STR) loci in the Elazig population

    SELMA DÜZER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Adli TıpFırat Üniversitesi

    Adli Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET TOKDEMİR

  2. Tez No

    460152

    Düşük ejeksiyon fraksiyonlu kalp yetersizliği hastalarında tam kan viskozitesinin hemodinamik parametreler ve prognozla ilişkisinin değerlendirilmesi

    The association of whole blood viscosity with hemodynamic parameters and its prognostic importance in patients with heart failure with reduced ejection fraction

    ELİF HANDE ÖZCAN ÇETİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    KardiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Kardiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. KUMRAL ÇAĞLI

  3. Tez No

    469030

    Türkiye'nin Akdeniz kıyılarında dağılım gösteren lesepsiyen gümüş balığı atherinomorus forskalii (Rüppell, 1838) 'nin bazı biyo-ekolojik özellikleri

    Some bio-ecological features of lessepsian silverside atherinomorus forskalii (Rüppell, 1838) distributed along the mediterranean coast of Turkey.

    UĞUR ÖZDEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Su Ürünleriİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Su Ürünleri Temel Bilimleri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ERHAN IRMAK

  4. Tez No

    344225

    Türkiye Batı bölgelerinde hantavirus araştırılması: Trakya bölgesi kemiricilerinde hantavirus antikorlarının prevalansının araştırılması

    Investigation of hantavirus in Western regions of Turkey: Analysis of hantavirus antibody prevalence in rodents in Thrace region of Turkey

    CEYLAN POLAT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İ. MEHMET ALİ ÖKTEM

    PROF. DR. Y. HAKAN ABACIOĞLU

  5. Tez No

    184300

    Göller bölgesi Abies cilicica Carr. ormanlarında Choristoneura murinana (Hübner) üzerine araştırmalar

    Investigation on Choristoneura murinana (Hübner) in lakes district Abies cilicica Carr. forests

    OĞUZHAN SARIKAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Ormancılık ve Orman MühendisliğiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Orman Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. MUSTAFA AVCI

Geri Dön