Geri Dön

Türkiye'nin Akdeniz sahilinden örneklenen çeşitli ploidi düzeylerine sahip bermuda çimi (Cynodon spp.) türlerinde kloroplast DNA polimorfizminin belirlenmesi

Detection of chloroplast DNA polymorphism in bermudagrass (Cynodon spp.) species of different ploidy level collected from Mediterranean region of Türkiye

PDF İndir

  1. Tez No: 275015
  2. Yazar: AHMET CEYLAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. OSMAN GÜLŞEN, YRD. DOÇ. DR. MİKAİL AKBULUT
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Bermuda çimi, kloroplast DNA polimorfizmi, ccSSR, Bermuda grass, chloroplast DNA polymorphism, ccSSR
  7. Yıl: 2010
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Erciyes Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 115

Özet

Bu çalışmanın amacı cpDNA PZR-RFLP ve cpDNA SSR yöntemleri kullanarak Türkiye'de doğal olarak yayılış gösteren farklı bermuda çimi (Cynodon spp.) genotiplerinde kloroplast DNA polimorfizminin belirlenmesidir. Bermuda çimi birçok ülkede kamu parkları, evsel alanlar, golf sahaları ve spor sahalarında çim ve mera bitkisi olarak ve ayrıca toprak ıslahında kullanılmaktadır. Çeşitli ploidi seviyelerinden 47 farklı genotiple çalışılmıştır. Bu genotiplerden 40 tanesi Akdeniz bölgesinden toplanan 182 genotip arasından seçilmiş ve 7 tanesi ise Kayseri ve Nevşehir'den toplanmıştır. Farklı genotiplerin kloroplast DNA'larındaki rbcL, TrnHK, 30S, Psb-TrnS ve TrnST bölgeleri, ilgili primerler kullanılarak çoğaltıldıktan sonra EcoRI, TaqI, MseI, DraI, Hin1II, BsuRI, MspI, MboI, RsaI ve EcoRV restriksiyon enzimleri ile kesilmiştir. cpDNA PCR-RFLP metodu kullanılarak elde edilen 143 bandtan 53 tanesi polimorfik bulunmuştur (%37). Bu bermuda çimi genotipleri aynı zamanda 10 ccSSR primerleri ile de analiz edilmiştir. Bütün genotipler arasındaki benzerlik cpDNA PCR-RFLP kullanıldığında ortalama 0.88 olup 0.77 ile 1 arasında değişirken, bu değer ccSSR için ortama 0.75 olup 0.50 ile 1 arasında değişmektedir. Her iki markır sistemi birlikte kullanıldığında UPGMA tarafından üretilen dendrogram bermuda çimi genotiplerini 0.76 benzerlik değeri ile birlikte kümelemiştir. Çalışılan 47 genotip içerisinde 5. genotip hariç tüm diploid genotipler birlikte kümelenmiştir. Bu sonuçlar doğal olarak oluşan bermuda çimi populasyonlarında kloroplast DNA polimorfizminin düşük olduğunu göstermektedir

Özet (Çeviri)

Main purpose of this study was to detect chloroplast DNA polymorphism by using cpDNA PZR-RFLP and CpDNA SSR in different bermudagrass genotypes (Cynodon spp). Bermudagrass is a perennial grass which is used for pasture, forage, turf grass, soil stabilization, and remediation. Forty seven bermudagrass genotypes from various ploidy levels were used in this study. Fourty of the genotypes were selected among the 182 genotypes collected from Mediterranean region and seven were collected from Kayseri and Nevşehir. rbcL, TrnHK, 30S, Psb-TrnS ve TrnST regions of chloroplast DNA were amplified by polymerase chain reaction (PCR) using universal chloroplast primer pairs and EcoRI, TaqI, MseI, DraI, Hin1II, BsuRI, MspI, MboI, RsaI ve EcoRV enzymes were used for restriction analysis of amplified fragments. Of the 143 scored fragments, 53 were polymorphic (%37) when cpDNA PCR-RFLP method is used. These 47 bermudagrass genotype was also analyzed by using 10 ccSSR primers. Among the 10 primers used for PCR analysis, eight of them produce clear PCR product. Of the 16 scored SSR bands 14 of them were polymorphic (%87.5). Similarites among all genotyes ranged from 0.77 to 1, with a mean of 0.88 and ranged from 0.50 to 1, with a mean 0.75, when cpDNA PCR-RFLP and ccSSR analysis is used, respectively. The UPGMA analysis clustered bermudagrasses together when both markers are used with similarity value of 0.76. Excluding diploid genotype 5, diploid genotypes (%13) were clustered together in 47 genotypes studied. These results suggest that low level of chloroplast DNA polymorphism is present in naturally occuring bermudagrass populations.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    155481

    Akdeniz bölgesinde ozon kirliliği ve ormanlara olan etkisinin incelenmesi

    Ozone pollution in the Mediterranean region assesments of its effects on forests

    EVRİM AKKOYUNLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Çevre MühendisliğiHacettepe Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. GÜLEN GÜLLÜ

  2. Tez No

    348471

    Türkiye sahillerinin mediolittoral bölgesinde yaşayan parastenhelia (Copepoda, Harpacticoida, Parastenheliidae) türlerinin taksonomik revizyonu

    Taxonomic revision of parastenhelia (Copepoda, Harpacticoida, Parastenheliidae) species inhabiting in the mediolittoral zone of Turkish coasts

    SEHER KURU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiMersin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SÜPHAN KARAYTUĞ

  3. Tez No

    178777

    Beymelek Lagünü'ne giren bazı migrator balıkların yağ asidi bileşiminin araştırılması

    Investigation of fatty acids composition of some migratory fish in Beymelek Lagoon

    HALİL YILMAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyolojiDumlupınar Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. KAZİM UYSAL

  4. Tez No

    650672

    Hatay ili küçük ölçekli balıkçılığının durumu

    Status of small-scale fishery of the Hatay region

    BURCU ATAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Su Ürünleriİskenderun Teknik Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MEVLÜT GÜRLEK

  5. Tez No

    170699

    Feeding habits of some selected fish species of Beymelek estuary, Antalya, Turkey

    Beymelek Lagün'ünde (Antalya/Türkiye) seçilmiş bazı balık türlerinin beslenme alışkanlıkları

    MÜGE ÖZTÜRKCAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2005

    BiyolojiAbant İzzet Baysal Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. MUSTAFA ÜNAL

    Y.DOÇ.DR. ŞENOL AKIN

Geri Dön