Salmonella typhimurium' da stj fimbriyal operonu aktive edilmiş mutantların genetik analizi
Genetic analysis of stj fimbrial operon activated mutants in Salmonella typhimurium
- Tez No: 284982
- Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA AKÇELİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 373
Özet
stj fimbriyal operonunun in vitro koşullarda ifadesinin tanımlanması amacı ile stjE::lacZYA füzyonu içeren Salmonella Typhimurium LT2 mutantı (MA2) kullanıldı. T-POP transpozonu ile gerçekleştirilen mutasyonel çalışmalar sonucu stj fimbriyal operonu ifade edilen mutantların seçiminde stj operonu içine füzyonu yapılan lacZYA genlerinin fenotipik özelliğinden yararlanıldı. Bu mutantlardan yüksek ß-galaktozidaz aktivitesi belirlenenlerde T-POP giriş bölgesi ters yön PZR yöntemi kullanılarak çoğaltıldı ve PZR ürünleri, DNA dizi analizine tabi tutuldu. DNA dizi analizleri sonucu, T-POP olası giriş bölgeleri (olası stj regülatör genleri) çoklu ilaç dirençlilik gen bölgesi regülatörü (mdr), transkripsiyonel bir global regülatör olan cadC, bir diğer transkripsiyonel regülatör LysR ve H-NS genleri ile homoloji vermiştir. DNA dizi analizinden elde edilen bulgular, DNA veritabanları, proteomik çalışmalar ile birlikte yorumlandığında; stj fimbriyal operonunun H-NS ve LysR ailesi transkripsiyonel regülatörler tarafından koordineli bir şekilde negatif regülasyona tabi tutulduğu sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
Salmonella Typhimurium LT2 mutant (MA2), which contains stjE::lacZYA fusion, was used to identify in vitro expression conditions of stj fimbrial operon. Phenotypic characteristics of lacZYA genes that are fused in stj fimbrial operon were used for selection of mutants, whose stj fimbrial operon was expressed as a result of T-POP transposon mutation. Among these mutants, inverse PCR analyses and sequencing of PCR products were performed at which exhibit high ß-galactosidase activity. As a result of DNA sequence analysis, T-POP entry sites (possible stj regulator genes) shown similarity with the regulator of multi-drug resistance gene (mdr), global transcriptional regulator cadC, another transcriptional regulator LysR and H-NS genes. These findings, obtained from DNA sequence analysis, were interpreted with DNA database and proteomic analyses and it was concluded that stj fimbrial operon is subjected to coordinated negative regulation of H-NS and LysR family transcriptional regulators.
Benzer Tezler
- Salmonella enterica serotip Typhimurium'da stj fimbriyal operonunun regülasyonunun ve patojenitede oynadığı rolün tanımlanması
Identification of the regulation and the role in the pathogenesis of the stj fimbrial operon in Salmonella enterica serotype Typhimurium
BANU ÖZDEN
- Salmonella typhimurium'da tip 1 fimbriyanın biyofilm oluşumu üzerine etkisi
Effect of type 1 fimbriae on biofilm formation in Salmonella typhimurium
TUBA NUR SÜRKAÇ
- marT as a global regulatory gene for biofilm formation in Salmonella Typhimurium
Salmonella Typhimurium'da biyofilm oluşumu için yeni bir regülatör gen: marT
ZEYNEP ERAN
Doktora
İngilizce
2020
MikrobiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ
- Salmonella typhimurium'da pagn geninin biyofilm oluşturma yeteneği üzerine etkisi
Effect of pagn gene on biofilm forming ability in Salmonella typhimurium
ASİYE NUR KARACA
- Salmonella typhimurium'da CsgD regülasyonunun otoindüktör-2 aktivitesine ve quorum sensing ilişkili küçük RNA'ların ekspresyon seviyelerine etkilerinin belirlenmesi
Determination of the effects CsgD regulation on autoinducer-2 activity and expression levels of quorum sensing related small RNAs in salmonella typhimurium
MELİH AŞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NEFİSE AKÇELİK