Salmonella typhimurium'da tip 1 fimbriyanın biyofilm oluşumu üzerine etkisi
Effect of type 1 fimbriae on biofilm formation in Salmonella typhimurium
- Tez No: 774722
- Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA AKÇELİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biyoloji, Biotechnology, Biology
- Anahtar Kelimeler: Biyofilmler, Dam, Fimbriae, Salmonella, Salmonella typhimurium, Selüloz, Biofilms, Roof, Fimbriae, Salmonella, Salmonella typhimurium, Cellulose
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, fimF geninin S. Typhimurium ATCC 14028 suşunda biyofilm oluşumu üzerine etkisinin belirlenmesi amacı ile, 14028 suşunun fimF ve dam geni mutantları yanında, fimF geninin sadece N domaininin klonlandığı konstrakt kullanıldı. S. Typhimurium fimF ve dam mutantında, doğal suşa oranla biyofilm oluşumunun istatistiki açıdan anlamlı bir şekilde azaldığı (p<0.05), fimF geninin N domaini klonlanmış konstraktında ise, fimF mutantına oranla biyofilm oluşturma kapasitesinin arttığı saptandı (p<0.05). Doğal tip ve mutant suşların oluşturduğu biyofilm morfotipleri incelendiğinde; doğal tip suş 'rdar' morfotip gösterirken, fimF mutant suşunun ve onun N domaini klonlanmış konstraktının 'bdar' morfotipe dönüştüğü ve dam mutant suşunun ise, tam 'rdar' morfotipi olmayan, 'ara morfotip' olarak adlandırdığımız biyofilm morfotipini gösterdiği saptandı. Bunun yanında, fimF geninin, bu genin sadece N domainini ifade eden gen bölgesinin ve dam geninin, Salmonella'da pelikül oluşumu ve peliküllerin yapısal özellikleri üzerinde etkili olduğu belirlendi. Katı ve sıvı kültür ortamlarında mutant suşların doğal tipe kıyasla daha az, fimF geninin N domaini klonlanmış konstraktının, fimF mutant suşuna oranla daha fazla selüloz ürettiği belirlendi. Bu suşların yüzde otoagregasyon miktarları karşılaştırıldığında, doğal tipe kıyasla fimF ve dam mutantlarında otoagregasyon yeteneği bakımından istatistiki açıdan önemli düzeyde azalma (p<0.05) tespit edildi. Oksidatif stres koşullarında bakteriyel üreme oranları incelendiğinde, doğal tip suş ve fimF geninin N domaini klonlanmış konstraktının aksine, fimF ve dam mutantlarında artış olduğu saptandı. HEp-2 ve Caco-2 hücrelerine tutunma denemeleri sonucu, fimF mutant suşunda doğal suşa kıyasla aderansının önemli ölçüde düştüğü saptandı (p<0.05).
Özet (Çeviri)
In this study, in order to determine the effect of fimF gene on biofilm formation in S. Typhimurium ATCC 14028 strain, fimF and dam gene mutants of 14028 strain, as well as the construct in which only the N domain of the fimF gene was cloned was used. In the S. Typhimurium fimF and dam mutant, biofilm formation was found to be statistically significantly reduced compared to the wild strain (p<0.05), while the N domain cloned construct of the fimF gene increased the biofilm forming capacity compared to the fimF mutant (p<0.05). When the biofilm morphotypes formed by wild type and mutant strains are examined; It was determined that the wild type strain showed the 'rdar' morphotype, while the fimF mutant strain and its N domain cloned construct converted to the 'bdar' morphotype, and the dam mutant strain showed the biofilm morphotype, which we call the 'intermediate morphotype', without the complete 'rdar' morphotype. In addition, it was determined that the fimF gene, the gene region expressing only the N domain of this gene, and the dam gene were effective on pellicle formation and structural properties of pellicles in Salmonella. It was determined that mutant strains produced less cellulose compared to wild type in solid and liquid culture media, and the N-domain cloned construct of fimF gene produced more cellulose compared to the fimF mutant strain. When the percent autoaggregation amounts of these strains were compared, a statistically significant decrease (p<0.05) was found in fimF and dam mutants in terms of autoaggregation ability compared to wild type. When bacterial growth rates were examined under oxidative stress conditions, it was determined that there was an increase in fimF and dam mutants, in contrast to the wild type strain and the N-domain cloned construct of the fimF gene. As a result of the adhesion experiments to HEp-2 and Caco-2 cells, it was determined that the adherence of the fimF mutant strain was significantly reduced compared to the wild strain (p<0.05).
Benzer Tezler
- Klinik örneklerden izole edilen salmonella suşlarının serogrupları ve antimikrobiyallere direnç durumları
Serogroups of salmonella strains isolated from clinical samples and their resistance to antimicrobials
BAŞAK TEK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
MikrobiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ATİFET YASEMİN ÖZTOP
- Isoӏation molecular identification of Salmoneӏla typhemurium from Iraqi patients/Babylon
Irak/Babil'deki hastalardan Salmonella typhemurium'un izole moleküler tanımlanması
AHMED YOUNUS HASAN HOOGY
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR KEMAL YAZGAN
PROF. DR. AӏYAA SAAD ABED KARKOSH
- Kars yöresinde evcil hayvanlardan salmonellaların izolasyonu, identifikasyonu ve serotiplendirilmesi
The Isolation, identification and serotyping of salmonellas isolated from domestic animals in Kars district
GENÇ OKTAY
- Molecular characterization of multi-drug resistant salmonella isolates in Turkey
Türkiye'deki çoklu antibiyotik dirençliliği gösteren salmonella izolatlarının moleküler karakterizasyonu
KUTLU GÖKSU ELPEK
Yüksek Lisans
İngilizce
2001
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ
DOÇ. DR. CANDAN GÜRAKAN
- Extracellular biosynthesis and characterization of zinc oxide and nisin-loaded zinc oxide nanoparticles using Bacillus subtilis ZBP4
Çinko oksit ve nisin-yüklü çinko oksit nanopartiküllerinin Bacillus subtilis ZBP4 ile hücre dışı biyosentezi ve karakterizasyonu
MOHAMMED HAMK
Doktora
İngilizce
2023
Gıda MühendisliğiSakarya ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE AVCI