Geri Dön

Helicobacter pylori suşlarinda genotipik farklılıkların ve ilaç direncinin saptanması

Detection of genotypic diversities and drug resistanse in helicobacter pylori strains

  1. Tez No: 289311
  2. Yazar: SALİHA BAKIR ÖZBEY
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SAFİYE HELVACI
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Gastroenteroloji, Mikrobiyoloji, Gastroenterology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2008
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Uludağ Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 68

Özet

Helicobacter pylori enfeksiyonu dünyada yaygın olarak görülen kronik bakteriyel enfeksiyonlardan biridir. H pylori enfeksiyonu kronik gastrit, peptik ülser ve gastrik kanser ile illşkilidir. H pylori'de antibiyotiklere karşı gelişen direnç tedavide başarısızlığa neden olmaktadır. Son yıllarda bu direnç oranı giderek artmaktadır. cag patojenite adası (cagPAI) H pylori'nin majör virulans faktörüdür. Ancak, H pylori enfeksiyonunun klinik sonucu cagA, cagT ve cagE de dahil olmak üzere bazı cagPAI genlerinin analiziyle tam olarak öngörülememektedir.Bu çalışmada 31 H pylori izolatının klaritromisin, amoksisilin, metronidazol, tetrasiklin ve siprofloksasin duyarlılığı E test yöntemi ile çalışıldı. Sırasıyla %41.9, %3.2, %41.9, %3.2 ve %45.2 oranlarında direnç saptandı. Tek antibiyotiğe direnç %32.2, çoklu direnç ise %45.2 oranında bulundu. Klaritromisin direnci ayrıca FISH (Floresan In Situ Hibridizasyon) yöntemi ile çalışıldı. Klaritromisin direncini saptamada her iki yöntem arasında fark saptanmadı. Ayrıca 50 H pylori isolatı (21 ülser, 20 gastrit ve 9 nonülser dispepsi) PCR ile incelendi. Sekiz primer çifti (cagA1, cagA2, cagAP1, cagAP2, cagE, cagT, LEC1 ve LEC2) kullanılarak cag PAI genlerinden beş farklı lokusun (cagA, cagA promoter bölgesi ve cagE'nin olduğu cagPAI-I bölgesi ile cagT ve LEC'in olduğu cagPAI-?? bölgesi ) varlığı incelendi. On hastada (%20) intakt cagPAI saptandı. Suşların %36'sında cagA geni bulunurken cagE ve cagT genleri sırasıyla %64 ve %58 olarak saptandı. cagPAI genleri ile klinik sonuçlar arasında anlamlı bir ilişki saptanmadı. Bu çalışma cagE'nin varlığının cagA ile değil cagT ile ilişkili olduğunu göstermiştir. (p=0.003). Bununla birlikte cag promoter bölgesi %58 ve LEC bölgesi de %56 oranında saptandı. Bu da, bu iki genin de virülansa katkıda bulunduğunu desteklemektedir.

Özet (Çeviri)

Helicobacter pylori infection is one of the common seen chronic bacterial infections in the world. H pylori infection is associated with a variety of clinical outcomes ranging from to chronic gastritis, peptic ulcer disease and gastric cancer. H pylori acquired resistance to antimicrobial agent treatment failure occurs. The resistance rate has been increasing in the past years. The cag pathogenicity island (cagPAI) is on of the majör virulence determinants of H pylori. Howover, the clinical outcome of H pylori infection is not reliably predicted by analyzing several genes of the cagPAI, including cagA, cagT and cagE.In this study 31 H pylori isolates examined for sensitivity to clarithromycin, amoxicillin, metronidazole, tetracycline and ciprofloxacin by E-test method The resistance rates were 41.9%, 3.2%, 41.9%, 3.2%, and 45.2%.respectively. The single resistance rate to antibiotics was found to be 32.2%, the multiple resistance rate on the other hand was found to be 45.2%. Susceptibility to clarithromycin was tested by E-test and FISH (Fluorescent In Situ Hybridization). No discrepancies were found between both methods. In addition, H pylori strains from 50 patients (21 ulser, 20 gastritis and 9 nonulser dispepsi) were analyzed using PCR. Eight pairs of oligonucleotid primers (cagA1, cagA2, cagAP1, cagAP2, cagE, cagT, LEC1 ve LEC2) of five different loci (cagA, cagA promoter region, cagE which represents cagPAI-I region and cagT, LEC representing cagPAI-II region) were used to detect the presence of the cag PAI genes. Intact cagPAI has been determined in 10 patients (20%). CagA gene was present in 36% of strain while cagE and cag T genes were present in 64% and 58% respectively. No association could be discerned between the presence of cagPAI genes and the clinical outcome. This study revealed consistency in the presence of cagE with cagT but not cagA. (p=0.003). Howover, the cag promoter region and the LEC region has been determined for 58%, 56% respectively. This supports that these two genes have an impact on the virulence.

Benzer Tezler

  1. Helicobacter pylori'nin virulans genlerinin araştırılması ve klaritromisin direnci ile ilişkisinin belirlenmesi

    Investigation of virulance genes of Helicobacter pylory and determination of association with clarythromycin resistance

    ARZU İRVEM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    MikrobiyolojiKocaeli Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FETİYE KOLAYLI

  2. Helicobacter pylori'de metronidazol direnci ve virülans faktörleri ile ilişkisi

    Başlık çevirisi yok

    EVREN DORUK ENGİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLŞEN HASÇELİK

  3. Dispeptik yakınmalı hastalarda helicobacter pylori varlığı, direnç ve virulans faktörlerinin moleküler yöntemler ile değerlendirilmesi

    Evaluation of the helicobacter pylori, resistance and virulance factors by molecular methods in patients with dyspepsia

    EBRU DEMİRAY GÜRBÜZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZLEM YILMAZ

  4. Helicobacter pylori tedavisi için kombine tedavi alan (Lansoprozol 30 mg 2x1 tablet, Amoksisilin 1000 mg 2x1 tablet ve Klaritromisin 500 mg 2x1 tablet) naiv hastaların gaita örneklerinde vankomisin dirençli enterokok ve genişlemiş spektrumlu beta laktamaz ve/veya karbapenemaz üreten enterobactericeae üyesi bakterilerin aranması

    The search for vancomycin resistant Enterococcus and enlarged spectrum beta lactamase and/or carbapenemase-producing Enterobactericeae member bacteria in Gaita samples of Naiv patients receiving combined treatment for Helicobacter pylori (Lansoprozol 30 MG 2x1 Tablet, amoxicillin 1000 MG 2x1 Tablet and Claritromycin 500 MG 2x1 Tablet)

    HALİME ARAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bakanlığı

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. ADALET AYPAK

  5. Dispeptik hastalardan izole edilen helıcobacter pylorı suşlarının antijenik heterojenitesinin belirlenmesi

    Determination of the antigenic heterogeneity of helicobacter pylori strains isolated from patients with dyspepsia

    NESLİHAN SAVAŞKAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZLEM YILMAZ