Türkiye'de yetişen Silene L. cinsinin Auriculatae ve Brachypodeae seksiyonlarına ait türlerin ITS nrDNA dizilerine dayalı filogenetik ilişkileri
Molecular systematic relation ITS nrdDNA of Silene L. taxa belonging Auriculatae and Brachypodeae section spread in Turkey
- Tez No: 299353
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. FATİH COŞKUN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Balıkesir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 98
Özet
Bu çalışmada Türkiye'nin farklı illerinden toplanan Silene L. (Caryophyllaceae) cinsine ait 17 türün nrDNA ITS bölgelerinin moleküler sistematik analizi yapılmıştır.Arazi çalışmasında toplanan örneklerin önce tanımı yapılıp daha sonra her örnek herbaryum haline dönüştürülmüştür. Daha sonra örneklerin ITS profillerinin belirlenmesi için her türün yaprak örneklerinden DNA izolasyonu yapılmıştır. Örneklerin daha sonra ITS bölgeleri uygun ITS4 ve ITS5A primerleri kullanılarak polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile çoğaltımıştır. Çoğalan DNA bölgelerinin baz diziler elde edilip işlenerek PAUP programı ile filogenetik analiz yapılmıştır. Değerlendirme sonucu çalışılan türler arası akrabalık ilişkilerini ortaya koyan Parsimoni, NJ, UPGMA, Boostrap ağaçları elde edilmiştir.Bu çalışmadan elde ettiğimiz veriler ışığında türler arasında filogenetik ilişkinin açıklanmasında ITS dizin analizlerinin daha güvenilir bilgiler ortaya koyduğu sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
In this study, 17 types of Silene L. (Caryophyllaceae) species which were collected from different provinces of Turkey were subjected to systematic molecular analysis for their nrDNA ITS sequences.Describe were made for species gathered during the field study and then each sample was transformed into herbarium state. DNA isolation was performed in order to determine the ITS profiles of the samples. They were duplicated through polymerase chain reactions(PCR) using ITS sections with appropriate ITS4 and ITS5 primers. Base sequence analysis of duplicated DNA sections was performed and they were evaluated through PAUP. As a result of the study, Parsimoni, NJ, UPGMA, Bootstrap analyses were performed to show the relationships between and among the studied taxa.In the light of the data we obtained from this study, it was concluded that ITS sequence analysis provides more reliable data when it comes to explaining the phylogenetic relationships among the studied taxa
Benzer Tezler
- Güneydoğu Anadolu bölgesinde yetişen bazı Silene L. (Caryophyllaceae) türleri ile morfolojik ve anatomik çalışmalar
The morphological and anatomical studies of some Silene L. (Caryophyllaceae) species grown in Southeastern Anatolia region
YASEMİN AKGÖZ
- Isolation and structural elucidation of secondary metabolites from some Caryophyllaceae Plants
Bazı Caryophyllaceae Bitkilerinden sekonder metabolitlerin izolasyonu ve yapı analizleri
RABİA NUR ÜN
- Türkiye'de yetişen satureja parnassica subsp. sipylea üzerine anatomik, morfolojik, ekolojik ve korolojik çalışmalar
Ecological, corological, morphological, anatomic studies about satureja parnassica subsp. siplae in Turkey
AHMET AKÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
BiyolojiBalıkesir ÜniversitesiBiyoloji Eğitimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLENDAM TÜMEN
- Türkiye'de yetişen Acinos Miller türleri üzerinde morfolojik anatomik ve kimyasal araştırmalar
Başlık çevirisi yok
AYLA KAYA
Doktora
Türkçe
1997
Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu ÜniversitesiFarmakognozi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FEHMİYE KOCA
- Türkiye'de yetişen Taxus baccata L. bitkisinin Taksan türevi bileşikleri üzerinde araştırmalar
Researches on taxane-type compounds of Taxus baccata growing in Turkey
NURGÜN ERDEMOĞLU
Doktora
Türkçe
1999
Eczacılık ve FarmakolojiGazi ÜniversitesiFarmakognozi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BİLGE ŞENER
