Geri Dön

D10S1248, D14S1434, D22S1045, D4S2364, D2S441, D1S1677 yeni mini STR lokuslarının kan ve kan lekelerinde optimizasyonu

New mini STR loci D10S1248, D14S1434, D22S1045, D4S2364, D2S441, D1S1677 optimization on blood and blood spots

PDF İndir

  1. Tez No: 308059
  2. Yazar: TUĞBA ÜNSAL
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. GÖNÜL FİLOĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Adli Tıp, Forensic Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Adli bilimler, DNA analizi, Bozulmuş biyolojik örnekler, MiniSTR, D10S1248, D14S1434, D22S1045, D4S2364, D2S441, D1S1677, Validasyon, Optimizasyon, Forensic science, DNA typing, Degraded DNA samples, MiniSTR, D10S1248, D14S1434, D22S1045, D4S2364, D2S441, D1S1677
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Adli Tıp Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 100

Özet

STR lokuslarının, hassas ve spesifik olması, sonuçların kolaylıkla değerlendirilebilmesi, birden fazla STR lokusunun aynı anda çalışılabilmesi ve yüksek polimorfizm göstermesi nedeniyle 90'lı yılların başından beri adli bilimlerde ideal genetik işaretler olarak kullanılmaktadırlar. Ancak olay yerinden gelen aşırı derecede bozulmuş örneklerde ya da eser miktarda DNA içeren örneklerde konvansiyonel STR'lerle tipleme sorunu yaşanabilmekte ve sonuç alınmamaktadır.Bunu önlemeye yönelik, National Institute of Standards and Technology (NIST) tarafından çok daha küçük boyutta 26 yeni miniSTR lokusu geliştirilmiştir. Söz konusu lokusların PCR ürünleri 125 bç den küçüktür.Bu çalışmada 6 yeni mini STR lokusunun (D10S1248, D14S1434, D22S1045, D4S2364, D2S441, D1S1677) Coble ve ark. 'nın (2005) uyguladığı metot temel alınarak üzerinde PCR aşamasında çeşitli modifikasyonlar yapıldı. Primerler, FAM, VIC, NED floresans boyalar yerine FAM, TET, HEX olarak işaretlendi. Primer konsantrasyonları D1S1677 1.5?M, D2S441 1.7?M, D4S2364 1.3 ?M, D10S1248 1.6?M, D14S1434 1.5 ?M ve D22S1045 1.5 ?M'a yükseltildi. PCR koşullarında değişiklik yapılmadı, sadece döngü sayısı 32 'ye yükseltildi. PCR için, Top Taq? Master Mix Kit (Qiagen) kullanıldı. 6 lokus 3'lü multiplex şekilde çalışıldı. PCR ürünleri ABI 310 genetik analizörde analizlendi. Bunun için kullanılan boyalara uygun olarak DS-34 Matrix standart ve TAMRA-350 size standart kullanıldı. Yöntem, bu koşullara uygun şekilde optimize edildikten sonra hassasiyet, tekrarlanabilirlik ve karışım örnekler çalışılarak validasyon çalışmaları yapıldı.

Özet (Çeviri)

STR loci, which have been used since 1990s, are ideal genetic markers in forensic science. Because DNA analyses with STR markers are sensitive and specific and easy to analyze. STR analyzes give results in short time, allow multiplex PCR, and show high polymorphism. But, it may occur problems with genotyping highly degraded forensic samples and trace amounts of biological samples. To solve these problems National Institute of Standards and Technology (NIST) had developed 26 new miniSTR loci. These loci amplicons are less than 125 bp.In this study; 6 new mini STR loci (D10S1248, D14S1434, D22S1045, D4S2364, D2S441, D1S1677) were studied, which is based on Coble at all?s method (2005) and several modification were made on this PCR method. Primer Dye set should be FAM-TET-HEX rather than FAM-VIC-NED. Primer concentrations were increased to: D1S1677 1.5 ?M, D2S441 1.7 ?M, D4S2364 1.3 ?M , D10S1248 1.6 ?M , D14S1434 1.3 ?M , D22S1045 1.5 ?M. PCR conditions were the same but cycle was raised to 32. Top Taq? Master Mix Kit(Qıagen) was used for PCR. 6 loci were studied as two triple multiplex sets. PCR amplicons were applied on ABI 310 Genetic analyzer. Compatible with these primer?s dye set, DS-34 Matrix Standart and GeneScan? 350 TAMRA? Size Standard were used.After the method was optimized with these conditions, validation studies were carried out by working the sensitivity and reproducibility of this procedure and analyzing mixed samples.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    326327

    6 mini STR lokusu'nun (d10s1248,d14s1434,d22s1045,d4s2364,d2s441, d1s1677)adli identifikasyondaki önemi ve Türkiye'deki gen sıklığı

    Imporantance of 6 mini STR loci (d10s1248,d14s1434,d22s1045, d4s2364,d2s441,d1s1677)in forensic identification and allele frequencies in Turkey

    ELİF SİPAHİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Adli Tıpİstanbul Üniversitesi

    Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. GÖNÜL FİLOĞLU

  2. Tez No

    606841

    Dna kimliklendirmesi amacıyla 18 lokuslu str (d8s1179, D21S11, D7S820, csf1po, d3s1358, tho1, D13S317, D16S539, D2S1338, d19s433, vwa, tpox, d18s51, alelogenin, d5s818, FGA, D10S1248, d14s1434) kitinin geliştirilmesi.

    Development of 18 loci STR (d8s1179, D21S11, D7S820, CSF1PO, D3S1358, tho1, D13S317, d16s539, d2s1338, d19s433, vwa, tpox, D18S51, alelogenin, d5s818, fga, d10s1248, d14s1434) kit for dna identification.

    HÜSEYİN KARADAYI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Adli Tıpİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. GÖNÜL FİLOĞLU TÜFEK

  3. Tez No

    445380

    10 STR lokusunun multipleks analizi ve Çukurova popülasyonunda allel frekanslarının saptanması

    Multiplex analysis of 10 STR loci and detection of allele frequencies in Çukurova population

    AYÇA ULUBAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Adli TıpÇukurova Üniversitesi

    Adli Tıp Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYŞE SERİN

Geri Dön