Melanoma hastalığını oluşturan sentetik peptidlerin poliakrilikasit ve kopolimerleri ile konjugasyonu
Conjugation of melanoma based synthetic peptides with polyacrylic acid and their copolymers
- Tez No: 312221
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ZEYNEP MUSTAFAEVA AKDESTE
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biyoteknoloji, Kimya, Biochemistry, Biotechnology, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 214
Özet
Sentetik polimerlerin biyomoleküllerle birlestirilmesi tıp, eczacılık ve mühendislik dallarında çesitli uygulamaalanları bulmaktadır. Kontrollü ilaç-salınımı, doku mühendisligi ve hücreüretimi gibi fonksiyonel uygulamalarda kullanılan katı hal (suda çözünmeyen) polimerik sistemlerin yanısıra suda çözünebilen polimer-biyomolekül konjugatları son zamanlardaenzim kararlılıgının arttırılmasında, biyosensörler üretiminde, DNA'nın hücre içi transferinde veantijenlerin immünojenliginin düzenlenmesi için protein modifikasyonunda kullanılmaktadırlar.Ayrıca, polimerlerin biyomoleküllerle etkilesiminin incelenmesi, gerek canlı organizmadakidavranıslarının anlasılmasında, gerekse de biyoseperasyon ve biyokonjugasyon teknolojisinin gelistirilmesi için önem tasımaktadır.Sentetik peptidler zayıf immunojenik özelliklerinden dolayı çesitli tasıyıcı moleküllere baglanmaktadırlar.Tasıyıcı moleküllere baglanan sentetik peptidler, daha yüksek immuncevap olusturabilmekte, biyolojik sistemde daha uzun süre kalabilmekte (prolongation time)vebozucu etkenlere karsı daha kararlı olabilmektedirler.Bahsedilen avantajlarından dolayı bu tez çalısmasında; sentetik peptidler adjuvant özelliktekipolimerlere baglanmıstır. Bu amaçla öncelikle radikalik benzoilperoksit baslatıcısıkullanılarak akrilik asit ve vinil pirolidon monomerlerinin farklı oranlarında kopolimerlersentezlenmistir. Kopolimer sentezine paralel olarak da Melanoma kanserine ait antijenikNYESO-1 155-163 (Q-L-S-L-L-M-W-I-T) ve MAGE-3 121-134 (L-L-K-Y-R-A-R-E-P-V-T-K-A-E)dizili sentetik peptidler Katı faz peptid sentezi yöntemi ile sentezlenmistir. Sentetik peptidler1-etil-3-3-dimetil aminopropil karbodiimid çapraz baglayıcısı kullanılarak PAA ve VP/AA polimerleriile kovalent olarak baglanmıstır. Sentezlenen biyokonjugatların vekomplekslerin yapı islev analizleri bölümümüz laboratuvarlarında gerçeklestirilmistir.Fizikokimyasal yapı analizi amacı ile biyokonjugatlar ve kompleks sistemleri Yüksek Basınçlı SıvıKromatografisi (HPLC), Jel Geçirgenlik Kromatografisi (GPC), FluoresansSpektrofotometre ve Zeta-Sizer sistemi ile incelenerek üç boyutlu yapılarının analizi,kompleks ve konjugat olusumu ile moleküler yapılarda meydana gelen degisimlerarastırılmıstır.Bu tez kapsamında elde edilecek bilgiler ısıgında immun cevabın elde edilmesi ileMelanoma kanserine karsı çesitli koruyucuların gelistirilmesi (prophylactics) vetümörlerin teshisinde kullanılabilecek spesifik antikorların elde edilmesi için yeni olasılıklarortaya çıkarabilecekbir ön çalısmadır.
Özet (Çeviri)
Conjugation of synthetic polymers with biomolecules has been studied for the application inthe fields of medicine, pharmacy and engineering. Insoluble polymer-biomolecule conjugateshave various functional applications such as drug-release systems, tissue engineering andrecovery of cultured cells. At the same time, the water-soluble conjugates are used in thestabilization of enzymes, for the creation of biosensors, transformation of DNA into cells andfor the regulation of immunogenicity of antigens. Besides, interaction of polymers withbiomolecules is important for understanding the action mechanism of biopolymers inorganism, bioseperation and elaboration of conjugation technology.Synthetic peptides can be conjugated with various carrier molecules because of their weakimmunogenic properties. Synthetic peptides linked carrier molecules, create higher immuneresponse, stay lopnger in biological system (prolongation time), and can be more stableagainst adverse effects.Due to the advantages mentioned in this thesis; synthetic peptides bound to polymers whichhave adjuvant properties. For this purpose, copolymers of acrylic acid and vinyl pyrrolidonemonomers in different ratios were synthesized using a radical initiator benzoilperoxide. Inparallel with the synthesis of copolymer, melanoma cancer antigenic NY-ESO-155-163 (Q-L-S-L-L-M-W-I-T)and MAGE-3121-134 (L-L-K-Y-R-A-R-E-P-V-T-K-A-E) peptidesequences were synthesized by solid phase peptide synthesis method. Synthetic peptidescovalently linked with PAA and VP/AA polymers by using 1-ethyl-3-3-dimethyl aminopropy-1karbodiimid cross-linker. Structural and functional analysis of complexes and bioconjugateswere made in our department laboratories.Three-dimensional structures, molecular structures and changes in the formation of complexand conjugate were investigated with the aim of physicochemical and structural analysis byHigh Performance Liquid Chromatography (HPLC), Gel Permeation Chromatography (GPC),Fluorescence spectrophotometer and Zeta-Sizer system.The light of information to be obtained within the scope of this thesis, obtaining immuneresponse against melanoma cancer is a preliminary study of new possibilities for developmentin various preservatives (prophylactics) and tumor-specific antibodies used in the diagnosis.
Benzer Tezler
- Primer ve metastatik melanom hücre hatlarında hotspot mutasyonların karşılaştırılması
Comparison of hotspot mutations in primary and metastatic melanoma cell lines
CANAN DOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Tıbbi BiyolojiAnkara Yıldırım Beyazıt ÜniversitesiKanser Biyolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ENDER ŞİMŞEK
- Kutanöz melanom tanılı hastalarda sosyodemografik ve klinik özelliklerin hastalık algısı ve güneşten korunma davranışları üzerindeki etkisi
The effect of sociodemographic and clinical featureson disease perception and sun protection behavior inpatients with cutaneous melanom
ÖZLEM GÜRBÜZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
DermatolojiDokuz Eylül ÜniversitesiDeri ve Zührevi Hast. Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZLEM ÖZBAĞÇIVAN
- Synthesis of dye-conjugated PD-L1 targeted peptides for use in pet/ct in diagnosis of lung cancer
Akciğer kanseri teşhisi için PET/CT sistemlerinde kullanılacak PD-L1 proteini hedefli boya takılı peptitlerin sentezi
SAADET YEŞİLMEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ONUR ALPTÜRK
DR. ÖZGÜR YILMAZ
- Malign melanoma hücre hattı ve malign melanoma kanser kök hücre hattında asetilasyon mekanizmasının karşılaştırmalı incelenmesi
Comparative investigation of acetylation mechanism in malignant melanoma cell line and malignant melanoma cancer stem cell line
MERVE ÖZDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Histoloji ve EmbriyolojiEge ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜSEYİN AKTUĞ
- IFNγ sinyal yolağının braf inbitörlerine yanıttaki rolünün A375 ve SK-MEL-1 insan melanom hücrelerinde araştırılması
Investigation of the role of İFNγ signaling pathway in response to braf inhibitors in A375 and SK-MEL-1 human melanom cells
FERDİ OĞUZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiManisa Celal Bayar ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HARİKA ATMACA İLHAN