Geri Dön

Discovery of specific kinase inhibitors : Main focus on Aurora B and cSrc kinases

Aurora B ve cSrc kinazlara özgü inhibitör moleküllerin bulunması

PDF İndir

  1. Tez No: 313563
  2. Yazar: BAHAR DEĞİRMENCİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. BURAK ERMAN, YRD. DOÇ. DR. NURHAN ÖZLÜ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Biochemistry, Bioengineering, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Koç Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 92

Özet

Hücre içinde faaliyet gösteren kinazların denetim mekanizmalarının bozulması birçok kanser çeşidine sebep olmaktadır. Bu nedenle kinazlar kanser tedavisi için yürütülen araştırmaların ana hedeflerindendir. Bu doğrultuda hücre içi birçok yaşamsal olayı düzenleyen kinazlara özgü küçük molekül inhibitörleri geliştirilmiş ve yeni inhibitörler geliştirilmesine çalışılmaktadır. Bu projede kanser hastalığının tedavisi için Aurora B ve cSrc kinazını inhibe eden yeni ilaçların bulunması ve geliştirilmesi amaçlanmaktadır. Aurora kinazlar sadece mitoz bölünme sırasında rol oynayıp bölünmeyen hücrelerde ifade edilmemesi sebebiyle kanser tedavisi için ideal hedeflerdendir ancak bu kinazını inhibe eden hiçbir ilaç henüz piyasada bulunmamaktadır. Aurora B kinaz için geliştiren ilaçların tümü kinazın aktif kısmına bağlanan ATP rekabetçi ilaçlardır bu ilaçlar az da olsa diğer yaşamsal kinazların da faaliyetini engellemektedir. Bu özgün araştırma projesinde Aurora B kinazın ve diğer 14 önemli kinazın aktif kısmına bağlanmayan ancak Aurora kinazların bu kinazları aktive eden proteinlerle bağlanma yerini hedefleyen moleküller hesaplamalı biyoloji metodları ile bulunmuş ve deneysel yöntemler ile sonuçların ümit vaat edici olduğu gösterilmiştir. İkinci bir proje olarak cSrc kinazın kendine özgü kısmı ilaç hedefi olarak belirlenmiştir. Aurora B projesinde uygulanan hesaplamalı yöntemler uygulanmıştır. Projede moleküller sadece hesaplamalı yöntemlerle bulunmuş deneysel çalışmalar yapılmamıştır. Bulunan ilaçlar özellikle cSrc kinaza bağlanmakta ve bağlanma şekli 2.çeşit kinaz sınıfına aittir.

Özet (Çeviri)

Many cancers have been associated with the deregulation of kinases that have become a prime target for cancer treatment. In this project, we aim to determine Aurora B kinase specific and cSrc kinase specific inhibitors by conducting virtual screening on ZINC database molecules. In our first project, our vision includes different binding site of drugs for the inhibition of Aurora B that have not yet been taken into account in previous reported studies. Indeed not only we aim to find the compounds that inhibit Aurora B but we also want to find drugs that are specific to Aurora B. Those molecules, which are theoretically shown to act as good inhibitors, are also verified experimentally. Promising results are obtained which display that our inhibitors cause reduction in Aurora B activity. As a second project, we identify cSrc specific inhibitors theoretically. The molecules found for cSrc are bound in the ATP pocket and extended into the allosteric site in the inactive conformation of the cSrc kinase. They are bound in conserved ATP pocket by hydrophobic interactions and resided in the allosteric site by making direct hydrogen bonds with residue GLU310. The binding mode of these inhibitors is the same as of type II kinase inhibitors. They bind to less conserved allosteric site and conserved ATP pocket simultaneously.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    411796

    State Behavior in Cyberspace: Russia, China and the USA

    Siber alanda devlet davranışları: Rusya, Çin ve ABD

    AYNABAT GARAYEVA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    Uluslararası İlişkilerİstanbul Bilgi Üniversitesi

    Uluslararası İlişkiler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET ALİ TUĞTAN

  2. Tez No

    411807

    A web based multi-criteria decision support system for department selection process of vocational high school students

    Meslek lisesi öğrencilerinin bölüm seçim süreci için web tabanli çok kriterli karar destek sistemi

    MUSTAFA COŞKUN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Bilgi ve Belge YönetimiBoğaziçi Üniversitesi

    Yönetim Bilişim Sistemleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELTEM SEBA ÖZTURAN

  3. Tez No

    411824

    Orta doğu'da yeni stratejik çevreleme girişimlerinin Türk dış politikasına etkisi: Suriye örneği

    The effects of strategic containment attempts in the middle east on turkish foreign policy: The example of Syria

    OĞUZHAN ERGÜN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Kamu YönetimiDokuz Eylül Üniversitesi

    Kamu Yönetimi Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. AHMET NAZMİ ÜSTE

  4. Tez No

    411908

    Koroner arter hastalığında serum resistin düzeylerinin incelenmesi

    Evaluation of serum resistin levels in coronary artery disease

    ELİF KILIÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyokimyaSağlık Bakanlığı

    Biyokimya ve Klinik Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DR. NEZAKET EREN

  5. Tez No

    412109

    Mecmûa-i Eş'âr (Houghton Ktp. MS Turk 59) inceleme - karşılaştırmalı metin

    Poetry Collections (Houghton Library MS Turk 59) text - analysis

    HASAN ALİ GÜNEŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Türk Dili ve EdebiyatıSakarya Üniversitesi

    Türk Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. OZAN YILMAZ

Geri Dön