Geri Dön

Structure prediction of TB rPOß and its mutations binding analysis

TB rPOß geni modellenmesi ve mutasyon bağlanma analizi

  1. Tez No: 318409
  2. Yazar: ERÇİN DİNÇER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KEMAL YELEKÇİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Kadir Has Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Hesaplamalı Biyoloji ve Biyoinformatik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 45

Özet

Tüberküloz bugün hala yüksek risk sınıfında bir hastalıktır. Verem tedavisinde en yaygın kullanılan ilaç rifampisindir. Günümüzde biliyoruz ki bu ilacın TB üzerinde ki etki bölgesi RNA Polimerazdır. Yapılan araştırmalarda ne yazık ki henüz Rpoß için üç boyutlu bir kristal yapısı elde edilememiştir. Bu çalışmada DNA sekansından yola çıkılarak; üç boyutlu model oluşturulması, bu model üzerinden mutasyon dirençlerinin ölçülmesi ve sonuçlarının değerlendirilmesi hedeflenmiştir.DNA veya Amino Asit sekanslarından yararlanarak üç boyutlu modelleme yapan bir çok online tool arasından yapılan modellemeler sonucunda deneysel sonuçlara en uygun çıkan model kullanılmıştır.En iyi model bulunduktan sonra, bu model üzerinde TB mutasyonları uygulanarak yeni durumda RIF'in bağlanma enerjileri ölçülmüştür.

Özet (Çeviri)

Today Tuberculosis is a disease that is still a high-risk categories. Rifampicin is a drug that?s used common in the treatment of TB. We know that the effect of this drug in the region of RNA polymerase on TB. Unfortunately, there isn?t any three-dimensional crystal structure in the rpoß. In this study, three-dimensional model was created from DNA sequence and applied the resistance mutations of TB for computing resistance .There are many online tools for three-dimensional modeling with using DNA or amino acid sequences. And the best result of the modeling was used in studying that?s more same with the experimental results.After finding best model, the mutations were applied for computing binding energy of mutations.

Benzer Tezler

  1. Physics and applications of coupled cavity structures in photonic crystals

    Fotonik kristallerdeki etkileşimli-kavite yapılarının fiziği ve uygulamaları

    MEHMET BAYINDIR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2002

    Fizik ve Fizik Mühendisliğiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EKMEL ÖZBAY

  2. İki boyutlu kafes parametrelerinin sınırlı veri alanlarından hesaplanması

    The Calculation of the 2-D lattice parameters from short data records

    NURŞEN YILDIZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1994

    Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    PROF.DR. AHMET HAMDİ KAYRAN

  3. DNS big data processing for detecting customersbehaviour of isp using an optimized apache spark cluster

    İSP müşterilerin davranışlarını tespiti için optimize edilmiş bir apache spark kümesi kullanarak dns büyük veri işleme

    YOUSEF ALKHANAFSEH

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Elektrik ve Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TAHİR ÇETİN AKINCI

  4. Marmara Denizindeki sıcaklık profilinin modellenmesi

    Başlık çevirisi yok

    E.GÜL EMECEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    Meteorolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Meteoroloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YUNUS BORAN

  5. Tecelli'nin gül-endam u kecib mesnevisi (inceleme/metin )

    Tecelli's gul-endam u ke'id masnavi̇ (textual-analysis)

    MEHMET ALİ YILDIZTEKİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Eğitim ve ÖğretimAtatürk Üniversitesi

    Ortaöğretim Sosyal Alanlar Eğitimi Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. Rıfat KÜTÜK