Peroksidaz gen markırları kullanılarak bazı karpuz çeşitlerinde genetik çeşitliliğin belirlenmesi
Determination of genetic diversity in some watermelon cultivars using peroxidase gene markers
- Tez No: 320826
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MİKAİL AKBULUT, DOÇ. DR. OSMAN GÜLŞEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 131
Özet
Türkiye dünyada ikinci büyük karpuz üreticisidir, farklı bölgelerinde kayda değer miktarda yerel çeşitler ve ekotipler mevcuttur. Bu çalışma da, Çeltik genomundan geliştirilen 12 spesifik peroksidaz gen (POX) primeri 259 karpuz hattında peroksidaz gen polimorfizmini (POGP) belirlemek için kullanılmıştır. UPGMA metodu kullanılarak yapılan kümeleme analizleri sonucu karpuz genotiplerinin türler bazında gruplandığı, grupların oluşmasında coğrafi orijinlerinin etkili olmadığı belirlenmiştir. Temel bileşenler analizi (PCA) ile de benzer sonuçlar elde edilmiştir. Genotipler arasında genetik varyasyon bakımından 3 ayrı küme belirlenmiştir. Moleküler Varyans Analizi (AMOVA) ile coğrafi gruplar arasında %38.56, grup içinde populasyonlar arasında %7.39, populasyonlar içinde %54.06 varyasyon oranı tespit edilmiştir. Populasyonlar içi farklılıklar istatistiki olarak önemli (P
Özet (Çeviri)
Turkey is the second largest producer of watermelon and considerable number of local cultivars and ecotypes exist in different regions. Twelve peroxidase gene (POX) specific primers developed from rice genome were used to detect peroxidase gene polymorphism (POGP) in 259 watermelon lines. Cluster analysis indicated a species based clustering and geographical origin of the genotypes was not found to be significant in clustering. Principle component analysis (PCA) revealed similar results and created three different clusters. First three Eigen value was calculated to be 58.1 which explains the 58% of the total variation. Analysis of molecular variance (AMOVA) indicated 38.56 % variation among the groups, 7.39% variation between population and within the groups, and 54% variation within the population. Genetic polymorphism rate was found to be considerably high in the genotypes studied (98.2%). High linkage disequilibrium was determined in second population composed of diverse genotypes and high linkage was observed between markers. Linkage disequilibrium was low in other three populations containing genetically close genotypes. Considering the level of polymorphisms obtained in this study we can conclude that POGP markers could be usefull to evaluate genetic variation and evolutionary relationships in watermelon genotypes.
Benzer Tezler
- Önemli zeytin (Olea europaea L.) çeşitlerinin izoenzim polimorfizmleri ve genetik özellikleri
Isoenzyme polymorphisms and genetic characteristics of important olive (Olea europaea L.) cultivars and types
SEVDA DÜLGER
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MURAT ŞEKER
- Peroksidaz gen markörleri kullanarak bazı biber türlerinde genetik çeşitliliğin belirlenmesi
Determination of genetic diversity in some capsicum species using peroxidase gene markers
RIFAT AKYAVUZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyoteknolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHTAP YILDIZ
- Mercimek cinsinde (lens mıller) dayanıklılık gen analogları, peroksidaz ve wrky transkripsiyon faktörü gen ailelerinin polimorfizmi
Polymorphism of resistance gene analogs, peroxidase and wrky transcription factors gene families in the genus lens miller
DUYGU SARI YOL
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyolojiAkdeniz ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CENGİZ TOKER
- Demir yüklemesi durumunda tiyoredoksin sistemin fare karaciğer ve böbrek dokusunda gen ve protein seviyesinde çalışılması
Investigation of the thyoredoxine system to the gene and protein level of mouse liver and kidney tissues in iron loading
FEYZA SÖNMEZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyolojiAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HARUN BUDAK
- Türkiye orijinli bazı buğday çeşitlerinde peroksidaz gen polimorfizminin belirlenmesi
Detection of peroxidase gene polymorphism in wheats from Turkey
HAMİD CEYLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyolojiErciyes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. OSMAN GÜLŞEN
YRD. DOÇ. DR. MİKAİL AKBULUT