Geri Dön

Peroksidaz gen markırları kullanılarak bazı karpuz çeşitlerinde genetik çeşitliliğin belirlenmesi

Determination of genetic diversity in some watermelon cultivars using peroxidase gene markers

PDF İndir

  1. Tez No: 320826
  2. Yazar: NECİP ÖCAL
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. MİKAİL AKBULUT, DOÇ. DR. OSMAN GÜLŞEN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Erciyes Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 131

Özet

Türkiye dünyada ikinci büyük karpuz üreticisidir, farklı bölgelerinde kayda değer miktarda yerel çeşitler ve ekotipler mevcuttur. Bu çalışma da, Çeltik genomundan geliştirilen 12 spesifik peroksidaz gen (POX) primeri 259 karpuz hattında peroksidaz gen polimorfizmini (POGP) belirlemek için kullanılmıştır. UPGMA metodu kullanılarak yapılan kümeleme analizleri sonucu karpuz genotiplerinin türler bazında gruplandığı, grupların oluşmasında coğrafi orijinlerinin etkili olmadığı belirlenmiştir. Temel bileşenler analizi (PCA) ile de benzer sonuçlar elde edilmiştir. Genotipler arasında genetik varyasyon bakımından 3 ayrı küme belirlenmiştir. Moleküler Varyans Analizi (AMOVA) ile coğrafi gruplar arasında %38.56, grup içinde populasyonlar arasında %7.39, populasyonlar içinde %54.06 varyasyon oranı tespit edilmiştir. Populasyonlar içi farklılıklar istatistiki olarak önemli (P

Özet (Çeviri)

Turkey is the second largest producer of watermelon and considerable number of local cultivars and ecotypes exist in different regions. Twelve peroxidase gene (POX) specific primers developed from rice genome were used to detect peroxidase gene polymorphism (POGP) in 259 watermelon lines. Cluster analysis indicated a species based clustering and geographical origin of the genotypes was not found to be significant in clustering. Principle component analysis (PCA) revealed similar results and created three different clusters. First three Eigen value was calculated to be 58.1 which explains the 58% of the total variation. Analysis of molecular variance (AMOVA) indicated 38.56 % variation among the groups, 7.39% variation between population and within the groups, and 54% variation within the population. Genetic polymorphism rate was found to be considerably high in the genotypes studied (98.2%). High linkage disequilibrium was determined in second population composed of diverse genotypes and high linkage was observed between markers. Linkage disequilibrium was low in other three populations containing genetically close genotypes. Considering the level of polymorphisms obtained in this study we can conclude that POGP markers could be usefull to evaluate genetic variation and evolutionary relationships in watermelon genotypes.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    150702

    Önemli zeytin (Olea europaea L.) çeşitlerinin izoenzim polimorfizmleri ve genetik özellikleri

    Isoenzyme polymorphisms and genetic characteristics of important olive (Olea europaea L.) cultivars and types

    SEVDA DÜLGER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MURAT ŞEKER

  2. Tez No

    512720

    Peroksidaz gen markörleri kullanarak bazı biber türlerinde genetik çeşitliliğin belirlenmesi

    Determination of genetic diversity in some capsicum species using peroxidase gene markers

    RIFAT AKYAVUZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyoteknolojiVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHTAP YILDIZ

  3. Tez No

    360765

    Mercimek cinsinde (lens mıller) dayanıklılık gen analogları, peroksidaz ve wrky transkripsiyon faktörü gen ailelerinin polimorfizmi

    Polymorphism of resistance gene analogs, peroxidase and wrky transcription factors gene families in the genus lens miller

    DUYGU SARI YOL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiAkdeniz Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CENGİZ TOKER

  4. Tez No

    513551

    Demir yüklemesi durumunda tiyoredoksin sistemin fare karaciğer ve böbrek dokusunda gen ve protein seviyesinde çalışılması

    Investigation of the thyoredoxine system to the gene and protein level of mouse liver and kidney tissues in iron loading

    FEYZA SÖNMEZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HARUN BUDAK

  5. Tez No

    282967

    Türkiye orijinli bazı buğday çeşitlerinde peroksidaz gen polimorfizminin belirlenmesi

    Detection of peroxidase gene polymorphism in wheats from Turkey

    HAMİD CEYLAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    BiyolojiErciyes Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. OSMAN GÜLŞEN

    YRD. DOÇ. DR. MİKAİL AKBULUT

Geri Dön