Geri Dön

Sığırlarda doku spesifik genlerin mikroarray verilerinin karşılaştırmalı analiziyle belirlenmesi

Identification of tissue specific genes by comparative analysis of microarray data in bos taurus

  1. Tez No: 335291
  2. Yazar: SELÇUK KAPLAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SAİM BOZTEPE
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Ziraat, Biotechnology, Genetics, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Selçuk Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 71

Özet

Doku spesifik genler gelişim ve metabolizma da önemli roller oynamaktadır. Günümüzde, gen bankasında farklı dokularla ilgili 3.363.628 GEO Profil ve 397.988 mikroarray verisi bulunmaktadır. Bilim adamları için gen bankasında bu kadar çok faydalı veri bulunmasına rağmen, yeni doku spesifik genlerin ortaya çıkarılması için bu verileri analiz edip kullanmaya yönelik bir strateji izlenmesiyle ilgili eksiklikler bulunmaktadır. Bu çalışma, mikroarray ve mikroarraylerle ilişkili GEO Profillerin kullanımı ve analiziyle doku spesifik genlerin ortaya çıkarılmasına yönelik yeni bir metot ortaya koymaktadır. Bu çalışmada, adipoz doku bu metodun doğrulanmasında hedef doku olarak seçilmiştir. İlk olarak, insan ve fare mikroarray verileri karşılaştırmalı olarak analiz edilmiştir. Mikroarray verilerini desteklemek için, adipoz dokuyla ilgili GEO Profilleri gen bankasından seçilmiştir. Daha sonra, adipoz dokuyla ilgili microarray ve GEO Profil verileri eş zamanlı olarak değerlendirilmiştir. Sonuç olarak bu metot, Chordin-like 1 (Chrdl1) olarak isimlendirilen yeni bir adipoz spesifik geni hipotez etmiştir. Hipotezin testi için sığır dokularında RT-PCR yapılmıştır. RT-PCR sonuçlarına göre, Chrdl1 diğer dokulara göre adipoz dokuda yüksek derecede ekspresyon göstermiştir (P

Özet (Çeviri)

Tissue specific genes play important roles in development and metabolism. Currently, Gen Bank has 3.363.628 GEO Profiles and 397.988 microarray data related to various tissues. Although huge amounts of useful data are available to scientists in Gen Bank, there is a lack of a follow-up strategy to analysis and use these data to identify new tissue specific genes. This study suggest a unique new method to using and analyzing microarray and microarray related GEO Profiles to identify tissue specific genes. In this study, adipose tissue sellected as a target tissue in order to validate the method. First, the human and mouse microarray data were analyzed comparatively. To support the microarray data, adipose tissue related GEO Profiles were selected from Gen Bank. Subsequently, adipose tissue related microarray and GEO Profiles data were evaluated simultaneously. Finally, this method hypothesized a novel adipose specific gene called Chordin-like 1 (Chrdl1). In order to test the hypothesis, RT-PCR was performed for the bovine tissue distribution. According to the RT-PCR results, Chrdl1 was highly expressed adipose tissue versus other tissues (P

Benzer Tezler

  1. Serological investigation of peste des petits ruminants in lambs in Iraq-Kirkuk region

    Irak–Kerkük bölgesinde kuzularda küçük ruminant vebası (pestedes petits ruminants ppr)'ın seroprevalansı

    SARWAT KHORSHED RAHEEM

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Sağlık YönetimiVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Sağlık Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SÜLEYMAN KOZAT

  2. Trakya bölgesinde kesime sevk edilen sığırların ileum lenf yumrularında mycobacterium avium subsp. Paratuberculosis varlığının PCR ile araştırılması

    Investigation on presence of mycobacterium avium subsp. Paratuberculosis by PCR in ileal lymph nodes of slaughtered cattle in thrace district

    ERHAN YALÇIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERKAN İKİZ

  3. Erzurum ilinde kesimi yapılan sığırlarda karaciğer lezyonları üzerinde patolojik incelemeler

    Pathological examinations of lessions seen in liver of the cows slaughtered in Erzurum province

    SERDAR ALTUN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    PatolojiAtatürk Üniversitesi

    Patoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAVUZ SELİM SAĞLAM

  4. Ordu ve Erzurum yörelerinde sığır akciğerlerinin paraziter enfeksiyonlarının histopatolojik yönden incelenmesi

    Pathological examinations of lessions seen in lungs of the cows in Erzurum and Ordu provinces

    NURİ FİDAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    PatolojiAtatürk Üniversitesi

    Patoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. KÜBRA ASENA TERİM KAPAKİN

  5. Hayvan modelinde elektronik sigara buharı ve sigara dumanının pulmoner toksik etkilerinin değerlendirilmesi

    Evaluation of pulmonary toxic effects of electronic cigarette vapor and cigarette smoke in animal model

    HALİMENUR ÇELİK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Göğüs HastalıklarıNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TURGUT TEKE