Metavirüs ty3'de frameshift'e sinyal iletim yollarının etkilerinin moleküler analizi
Molecular analysis of the effects of signal transduction pathways on the frameshift in metavirus ty3
- Tez No: 340040
- Danışmanlar: PROF. DR. SEZAİ TÜRKEL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Uludağ Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 56
Özet
Programlı Ribozomal Frameshift translasyonun elongasyon aşaması sırasında oluşan bir kontrol mekanizmasıdır. Programlı Ribozomal Frameshift ile aynı mRNA'dan farklı oranlarda farklı proteinler sentezlenir. Retrovirüslerde gag ve pol polypeptidlerinin belirli oranlarda sentezi için kullanılan bu kontrol mekanizmasının farklı organizmaların hücresel genlerinde de görüldüğü bulunmuştur. Programlı Ribozomal Frameshift farklı mRNA'larda +1 veya -1 yönde olabilir ve farklı frekanslarda gerçekleşmektedir. Ty3, S. cerevisiae'da doğal olarak bulunan ve maya hücrelerindeki replikasyon mekanizması retrovirüslere benzeyen bir virüstür. Bu araştırmada metavirüs Ty3'de Programlı Ribozomal Frameshift'e glukoz ve azot sinyal iletim yolarının etkileri araştırıldı. Ty3'de frameshift oranının maya hücrelerinin üreme koşullarına göre değişebildiği bulundu. Glukoz sinyal iletim yolunun Ty3'de ribozomal Frameshift oranını kontrol edebildiği gösterildi. Ty3'de frameshift oranının gliserol laktatda üretilen S. cerevisiae hücrelerinde çok fazla gerçekleştiği ve bunun da protein kinaz Snf1p'ye bağlı olduğu gösterildi. Bu sonuçlara ek olarak, Ty3'de frameshift oranının haploid ve diploid hücrelerde farklı olduğu bulundu. Ayrıca, azot sinyal iletim yolunun ise metavirüs Ty3'de frameshift'e etkisi olmadığı gösterildi.
Özet (Çeviri)
Programmed Ribosomal Frameshift is a type of control mechanism which occurs during the translation elongation stage. As a result of Programmed Ribosomal Frameshift, different proteins synthesized with a different ratios from the same mRNA. This control mechanism is commonly used for the synthesis of Retroviral gag and pol polypeptides with a certain ratios and it is also found in different cellular genes of different organisms. Programmed Ribosomal Frameshift can occur at different rates at +1 or -1 directions at different mRNAs. TY3 is present within S. cerevisiae naturally and it replicates via retroviral-like mechanisms within the yeast cells. The effects of glucose and nitrogen signaling pathways on the Programmed Ribosomal Frameshift in TY3 were investigated in this research. It was found that the frameshift rate can vary depending on the growth conditions of the yeast cells. It was shown that the glucose signaling pathway controls the frameshift rate in TY3. It was also shown that the frameshift occurs at very high levels in glycerol lactate grown yeast cells in a protein kinase Snf1p dependent manner. Moreover, it is also found that the frameshift rate is very different in haploid and diploid yeast cells. In addition, it was also shown that the nitrogen signaling pathway has no effect on the frameshift rate in metavirus Ty3
Benzer Tezler
- Pediatrik yaş grubu hastalarda hepatik fibrozisin evrelemesinde 2D shearwave ultrason elastografi etkinliğinin değerlendirilmesi
Evaluation of the efficiency of 2D shearwave ultrasound elastography in liver fibrosis score in pediatric age group
MELİH AKYÜZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Radyoloji ve Nükleer TıpGazi ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SUNA ÖZHAN OKTAR
- Erişkin hastalarda hepatik fibrozisin tanı ve evrelemesinde sonoelastografinin etkinliğinin değerlendirilmesi
Evaluation of the effectiveness of sonoelastography in the diagnosis and staging of hepatic fibrosis in adult patients
MEHMET AKSAKAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Radyoloji ve Nükleer TıpGazi ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. SUNA ÖZHAN OKTAR
- Kronik viral hepatitlerde uygulanan histopatolojik skorlama kriterlerinin tedavi başarısı ile ilişkisinin araştırılması
The relationship between treatment response and histological scoring systems applied in chronic viral hepatitis
SAMİR ABDULLAZADE
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
PatolojiHacettepe ÜniversitesiPatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CENK SÖKMENSÜER
- Kronik viral hepatitli hastalarda diffüzyon ağırlıklı MR görüntüleme bulgularının histopatolojik bulgularla karşılaştırılması
DWMRI findings in cases of chronic viral hepatitis and to compare with histopathologic findings
HATİCE TÜLAY DOĞANTÜRK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Radyoloji ve Nükleer TıpHarran ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SAİME SHERMATOVA
YRD. DOÇ. DR. HASAN ÇEÇE
- Karaciğer fibrozisinin evrelendirilmesinde proteomiks analizi ile yeni biyomarkerların araştırılması
Searching for novel biomarkers in determination of the stages of liver fibrosis by using proteomic analysis
SENEM CEREN ÖZEN KARATAYLI
Doktora
Türkçe
2009
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiTemel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. A. MİTHAT BOZDAYI