Tetraploit yoncada (Medicago sativa L.) genetik çeşitlilik, populasyon yapısı ve moleküler filogenetik
Genetic diversity, population structure and molecular phylogeny in tetraploid alfalfa (Medicago sativa L.)
- Tez No: 354517
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MUHAMMET ŞAKİROĞLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Kafkas Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 98
Özet
Yonca (Medicago sativa L.) bitkisi, hem ekonomik önemi hem de besin içeriğinden dolayı dünyada yaygın bir şekilde yetiştirilen önemli bir baklagil yem bitkisidir. Medicago sativa Tür Kompleksi ya da Medicago sativa-falcata kompleksi olarak bilinen bir taksonomik grup içerisinde yer alan bu bitki, ploidi seviyesine göre diploit ve tetraploit altbirimlerden oluşmaktadır. Bu altbirimlere geçmişte çeşitli taksonomik statüler verilerek değerlendirmeler yapılmıştır. Son yapılan değerlendirmeler neticesinde kompleksin diploit üyelerinin statüsü moleküler bilgiler ışığında aydınlatılmış ve alttür statüsünde olduklarına karar verilmiştir ancak tetraploit üyeler henüz kapsamlı bir değerlendirmeye tabi tutulmamışlardır. Bu çalışma kapsamında, Medicago sativa tür kompleksi içerisinde yer alan, tetraploit birimlerin taksonomik ilişkilerini belirlemek amacıyla, populasyon yapısı, genetik çeşitliliği değerlendirilmiştir. Çalışmanın sonunda, tetraploit üyelerden alttür sativa ve alttür falcata'nın birbirinden ayrılan iki alttürü temsil ettiği, bu iki alttürün melezi kabul edilen varia alttürünün de yüksek düzeyde hibritleşme özelliği gösterdiği saptanmıştır. Bu sonuçlar populasyon analizleri ve moleküler filogenetik analizlerle de desteklenmiştir. Ayrıca populasyondaki alttürler arasında yüksek allelik zenginlikten dolayı önemli sayılabilecek bir genetik farklılaşmanın olduğu da belirlenmiştir. Çalışmanın yonca genetik kaynaklarının değerlendirilmesi ve kullanılması açısından önemli bir referans olacağı düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
The legume forage alfalfa is very valuable both economicaly and based on nutrition composition and is grown worldwide. Presence of interploidi variations made alfalfa attractive for genomic studies. The taxonomic group Medicago sativa species complex or Medicago sativa-falcata complex has two different ploidy levels; diploit (2n=2X=16) and tetraploit (2n=4X=32). There was an ambiguity in the taxonomix status of the members of complex until recently. Extensive efforts have been devoted to untacle the status of diploit members using molecular markers and the members were considered as subspecies. The status of tetraploid members remained unclear. The aim of this study was to investigate the structure of tetraploid members of the Medicago sativa species complex using genomewide SSR markers. We used a number of broad based wild tetraploid accessions from USDA collections originally collected from the entire natural distribution range. Based on the molecular marker patterns, it was observed that the tetraploid alfalfa has two different main groups corresponding to known subspecies (Medicago sativa ssp. sativa and Medicago sativa ssp. falcata). Moreover, the Medicago sativa ssp. varia found to be hybrid between Medicago sativa ssp. sativa and Medicago sativa ssp. falcata. These results were supported with two other independent analyses (Principle Component Analyses and Molecular Phylogenetic Analyses). Basic population genetics analyses were also conducted to determine the patterns of demarcation among accessions and germplasm groups. Our results have implications for collection and utilization of alfalfa germplasm resources.
Benzer Tezler
- Medicago sativa L. çekirdek koleksiyonundaki populasyonların ploidi düzeylerinin flov sitometri yöntemi kullanılarak belirlenmesi
Determination of ploidy levels of the accessions using the flov cytometry method considered in the perennial Medicago sativa L. core collection
ORKUN DEMİRÖZOĞUL
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyolojiKafkas ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MUHAMMET ŞAKİROĞLU
- Tuz stresi ve CaO nanopartiküllerinin etkisi altındaki diploit ve tetraploit yonca (Medicago sativa L.) hatlarının farklı dokularında miRNAgen ifadelerinin belirlenmesi
Determination of miRNA gene expressions in different tissuesof diploid and tetraploid alfalfa (Medicago sativa L.) lines underthe effect of salt stress and CaO nanoparticles
ÜMMÜ GÜLSÜM KOÇ
- Yabani tetraploit buğday Triticum turgidum var. dicoccoides (Körn. Schwein) popülasyonlarında genetik çeşitliliğin moleküler markörler (AFLP, RFLP) ile tespit edilmesi
Assessment of genetic diversity among the wild tetraploid wheat Triticum turgidum var. dicoccoides (Körn. Schwein) populations by molecular markers (AFLP, RFLP)
ÖZLEM ÖZBEK
- Yabani ve kültür buğday türlerinin olumsuz çevre şartlarına dayanıklılığı ve genomda oluşan değişmeler
The Resistances of wild and cultured wheat species to negative environment conditions and formations of differences in genome
ŞADİYE ÖZTÜRK YILDIRIM
- Kolşisin uygulaması ile poliploit Vicia pannonica Crantz. (Macar fiği) ve Vicia villosa Roth. (tüylü fiğ) bitkilerinin elde edilmesi
Obtaining of polyploid Vicia pannonica Crantz. (Hungary vetch) and Vicia villosa Roth. (hairy vetch) plants by colchicine treatment
TÜLAY ELRADİ