Geri Dön

Klinik örneklerden izole edilen çoklu ilaç dirençli Acinetobacter baumannii suşlarında bazı karbapenemazların genotipik yöntemlerle araştırılması

Investigation of some carbapenemases by genotypic methods in multi-drug resistant Acinetobacter baumannii strains isolated from clinical specimens

PDF İndir

  1. Tez No: 359122
  2. Yazar: NİDA ÖZCAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KADRİ GÜL
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dicle Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Tıp Bilimleri Bölümü
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 95

Özet

Son yıllarda karbapenemlerin de dahil olduğu çoklu ilaç direnci, Acinetobacter baumannii'ye bağlı enfeksiyonların tedavisini oldukça zorlaştırmıştır. Çalışmamızın amacı, A. baumannii'nin antimikrobiyal duyarlılık paternini belirlemek ve karbapenem direncinin en önemli nedeni olan OXA tipi beta laktamaz genlerinin varlığını araştırmaktır. Ekim 2012- Şubat 2013 tarihleri arasında Dicle Üniversitesi Hastaneleri yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalardan izole edilen 80 A. baumannii izolatı konvansiyonel metodlar ve otomatize sistemle -BD Phoenix (Becton Dickinson, A.B.D)- tanımlandı; izolatların antimikrobiyal duyarlılıkları otomatize sistem ve Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemiyle çalışıldı. Moleküler yöntem olarak hyplex® CarbOxa ID (Amplex, Almanya) test sistemi kullanıldı. Bu sistem ile blaOXA-51-like, blaOXA-23-like , blaOXA-58-like ve blaOXA-58-like gen kümelerinin polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile amplifikasyonu ve elde edilen PZR ürünlerinin enzim bağımlı immünosorbent testi (ELISA) temelli bir sitemde spesifik oligonükleotid problarla hibridizasyonunu sağlandı. İzolatların tamamı kolistine duyarlıydı. Tigesiklin, netilmisin, amikasin, trimetoprim-sulfametoksazol, gentamisin ve sefaperazon sulbaktam duyarlılıkları sırasıyla %27.5, %22.5 %16.25, %12.5, %8.75 ve %5 olarak saptandı. İki izolatın levofloksasine orta duyarlı olduğu, izolatların tamamının ise test edilen diğer antibiyotiklere (ampisilin-sulbaktam, piperasilin-tazobaktam, seftazidim, sefepim, seftriakson, sefotaksim, imipenem, meropenem, siprofloksasin) dirençli oldukları belirlendi. A. baumannii'ye özgü olduğu kabul edilen blaOXA-51-like genleri 77 (%96) izolatta, bla-OXA-23-like, blaOXA-58-like ve blaOXA-40 like gen grupları sırasıyla 48 (%60), 12 (%15) ve 8 (%10) izolatta gösterildi. Kırk yedi (%21.25) izolatın blaOXA-51-like ile blaOXA-23-like genlerini, 10 (%12.5) izolatın ise blaOXA-51-like ile blaOXA-58-like gen gruplarını bir arada taşıdığı saptandı.

Özet (Çeviri)

In the last decades, mutiple drug resistance, including carbapenems, made it difficult to treat infections due to Acinetobacter baumannii. We aimed to determine the antimicrobial susceptibility of A. baumannii and investigate the presence of OXA type beta lactamase genes admitted as the most important reasons of carbapenem resistance in A. baumannii. Eighty A. baumannii strains isolated from intensive care units of Dicle University Hospitals between December 2012 and February 2013 were identified with conventional methods and automated microbiology system BD Phoenix (Becton Dickinson, USA). The antibiotics susceptibility tests of the isolates were performed with both automated system and disc diffusion method. The hyplex® CarbOxa ID test system was used for amplification of blaOXA-51-like, blaOXA-23-like ,blaOXA-58-like and blaOXA-40-like gene clusters by multiplex PCR and hybridisation of the polimerase chain reaction (PCR) products to specific oligonucleotide probes in an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA)-based system. All isolates (100%) were found to be susceptible to colistin while the susceptibility rates of tygecycline, netilmicin, amikacin, trimethoprim-sulfamethoxazole, gentamicin and cefoperazone-sulbactam were 27.5%, 22.5%, 16.25%, 12.5%, 8.75% and 5% respectively. Two strains showed intermediate susceptibility for levofloxacin while all of the isolates were resistant against any remaining tested antibiotics (ampicillin-sulbactam, piperacillin-tazobactam, ceftazidime, cefepime, cefotaxime, ceftriaxone, imipenem, meropenem, ciprofloxacin). Among 80 isolates, 77 (%96.25) of them were positive for blaOXA-51-like genes which were consistantly found and unique to A. baumannii. BlaOXA-23-like, blaOXA-58-like and blaOXA-40-like genes were demonstrated in 48 (%60), 12 (%15) and 8 (%10) isolates respectively. Fortyseven isolates (%58.75) were positive for both blaOXA-51-like and blaOXA-23-like genes, while 10 (%12.5) isolates for both blaOXA-51-like and blaOXA-58-like genes.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    374925

    Çoklu antibiyotik dirençli asinetobakter izolatlarında kolistin ile tigesiklin kombinasyonunda sinerji varlığı

    Presence of synergistic effect of colistin and tigecycline on multidrug resistant acinetobacter isolates

    İLKEM ACAR KAYA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıUfuk Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA TUNÇBİLEK

  2. Tez No

    552612

    Hastane enfeksiyonu etkeni olan çoğul ilaca dirençli Acinetobacter baumannii suşlarında sulbaktam ile kolistin, meropenem, tigesiklin, amikasin ve siprofloksasin'in in-vitro sinerjistik etkisinin araştırılması

    Research of sulbactam combinations with colistin, meropenem, tigecycline, amicasin and ciprofloxacin in-vitro synergstic activity in nosocomial multidrug resistant Acinetobacter baumannii strains

    FATİH TEMOÇİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bakanlığı

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATMA ŞEBNEM ERDİNÇ

  3. Tez No

    347721

    Acinetobacter baumannii suşlarında OXA-23 ve OXA-58 tipi genişlemiş spektrumlu Beta laktamaz varlığının araştırılması ve PFGE yöntemi ile klonal yakınlığının incelenmesi

    Detection of extended spectrum Beta lactamase type OXA-23 ve OXA-58 from the acinetobacter baumannii species and investigation of clonal relationship by PFGE

    ŞERAFETTİN KEYİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. UĞUR ARSLAN

  4. Tez No

    561761

    İnvaziv enfeksiyonlardan izole edilen çoklu ilaç dirençli asinetobakter suşlarında, direncin moleküler karakterizasyonu, suşlar arası klonal ilişkinin PFGE (Pulse field gel elektrophoresis) ve MLST (Multi locus sequencing typing ) ile karşılaştırılması

    Molecular characterization resistance in MDR (Multi drug resistance) acinetobacter strains isolated from invasive infections, comparison of the relationship between strains with karakterizasyonu, suşlar arası klonal ilişkinin PFGE (Pulse field gel elektrophoresis) and MLST (Multi locus sequencing typing )

    FERİDE AKIŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FATİH KÖKSAL

  5. Tez No

    340925

    Çeşitli antibiyotik kombinasyonlarının acinetobacter suşları üzerine ın vitro etkinliğinin araştırılması

    Investigation of in-vitro effects of various antibiotic combinations against acinetobacter species

    DURSUN MURAT ALADA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÜLKÜ ALTOPARLAK

Geri Dön