Klinik örneklerden izole edilen acinetobacter spp. suşlarında antibiyotik direnç profili ve yeni nesil antibiyotiklerin in-vitro etkinliklerinin araştırılması
Investigation of the antibiotic resistance profile and in-vitro effects of new generation antibiotics acinetobacter spp. strains i̇solated from clinical samples
- Tez No: 907020
- Danışmanlar: PROF. DR. BETİGÜL ÖNGEN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 118
Özet
Acinetobacter spp. ve özellikle A. baumanni yaşamı tehdit eden hastane kaynaklı enfeksiyonlardan sorumlu bakterilerdir. Son yıllarda, çoklu ve yaygın ilaca dirençli suşlardaki artış, mortalite ve morbidite açısından endişe kaynağı olmuş ve yeterli tedavi sağlayan yeni antibiyotiklerin acilen tedavi protokollerine dâhil edilmesi gündeme gelmiştir. Hastanemizin farklı kliniklerinden gönderilen çeşitli klinik örneklerden izole edilen çoklu ilaca dirençli Acinetobacter suşları çalışma kapsamına alınmış ve suşların tanımlama ve antibiyotiklere duyarlılığı VITEK-2 sistemi ile gerçekleştirilmiştir. Yeni antibiyotiklerden eravasiklin, sefiderokol ve imipenem relebaktam duyarlılıkları hem disk difüzyon (DD) hem de gradiyent strip yöntemleriyle, kolistin duyarlılığı standart sıvı mikrodilüsyon (SMD), sefiderokol duyarlılığı ise demiri azaltılmış ortamda SMD yöntemiyle test edilmiştir. Duyarlılık testleri EUCAST önerileri doğrultusunda gerçekleştirilip, yorumlanmıştır. Sefiderokol için ayrıca CLSI kriterleri ile karşılaştırılmıştır. Fenotipik olarak karbapenem direnci belirlenen tüm suşlarda A. baumannii'ye özgü kromozomal blaOXA51 ayrıca karbapenem direncinden sorumlu blaOXA23, blaOXA58 ve optimize edilmiş PCR ile blaOXA24 varlığı araştırılmıştır. Ayrıca dışa atım pompasını kodlayan ve tetrasiklinlere dirençte rol alan tetA ve karbapenem direncinde rol oynayan blaIMP araştırılmıştır. A. baumannii olarak tanımlanan 80 izolatın tamamı karbapeneme dirençli bulunmuştur. SMD yöntemiyle kolistin direnci %7,5 (n:6) olarak saptanmıştır. Sefiderokol direnci DD ve SMD yöntemiyle sırasıyla %18,75 (n:15) ve %22,5 (n:18) belirlenmiştir. Sefiderokol için MİK50 ve MİK90 değerleri sırasıyla 0,25 mg/l, 128 mg/l ve MİK aralığı
Özet (Çeviri)
Multidrug-resistant Acinetobacter strains isolated from various clinical samples sent from different clinics of our hospital were included in the study and identification and antibiotic susceptibility of the strains were performed by VITEK-2 system. Among the new antibiotics, eravacycline, cefiderocol and imipenem relebactam susceptibilities were tested by both disc diffusion (DD) and gradient strip methods, colistin susceptibility was tested by broth microdilution (BMD) and cefiderocol susceptibility was tested by BMD method in iron reduced medium. The susceptibility tests were performed and interpreted according to EUCAST recommendations and also compared with CLSI criteria for cefiderocol. The presence of A. baumannii-specific chromosomal blaOXA51 and blaOXA23, blaOXA58 and blaOXA24 responsible for carbapenem resistance by optimised PCR were investigated in all strains phenotypically determined to be carbapenem resistant. In addition, tetA, which encodes the efflux pump and is involved in resistance to tetracyclines, and blaIMP, which is involved in carbapenem resistance, were investigated. All 80 isolates identified as A. baumannii were carbapenem resistant. Colistin resistance was found 7.5% (n:6) by BMD method. Cefiderocol resistance was determined as 18.75% (n:15) and 22.5% (n:18) by DD and BMD methods, respectively. MIC50 and MIC90 values for cefiderocol were 0.25 mg/l, 128 mg/l and MIC range
Benzer Tezler
- 2018-2021 yılları arasında hastanemiz yoğun bakım ünitelerinden gönderilen kan kültürü ve alt solunum yolu örneklerinden izole edilen gram negatif bakterilerin antibiyotik duyarlılık verileri ve direnç profiline COVİD-19 pandemisinin etkisi
The effect of the COVİD-19 pandemic on the antibiotic susceptibility data and resistance profile of gram-negative bacteria isolated from blood cultures and lower respiratory tract samples sent from the intensive care units of OUR hospital between 2018-2021
DİDEM ÖZKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYFER BAKIR
- Çeşitli klinik örneklerden izole edilen acınetobacter spp. suşlarında antibiyotik direnç, ESBL ve biyofilm özelliklerinin araştırılması
Investigation of antibiotic resistance, ESBL, biofilm properties of acinetobacter spp. strains isolated from various clinical specimens
AHMET DEMİRDELEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiSelçuk ÜniversitesiTıbbi Laboratuvar Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA ONUR ALADAĞ
- Klinik örneklerden izole edilen A. baumannii suşlarında antibiyotik direncinde rol oynayan integronların varlığı ve tiplendirilmesi
The presence and identification of integrons which plays role in antibiotic resistance for acinetobacter baumannii strains isolated from clinical specimens
NEVİN ERTEKİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FİKRET ŞAHİN
- Çeşitli klinik örneklerden izole edilen acinetobacter spp. suşlarında quorum sensing ve antibiyotik direnç genleri̇ni̇n araştırılması
Investigation of quorum sensing and antibiotic resistance genes in acinetobacter spp. strains isolated from various clinical samples
SAİT RAMAZAN GÜLBAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
MikrobiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN DOĞAN
- Necmettin Erbakan Üniversitesi Meram Tıp Fakültesi enfeksiyon hastalıkları kliniğince izlenen yoğun bakım ünitelerinde 2010-2013 yılları arasında gelişen hastane enfeksiyonlarının değerlendirilmesi
Evaluation of the nosocomial infections seen between 2010-2013 in the intensive care units which controlled by infectious disease clinic of the Necmettin Erbakan University Meram Medical Faculty
ARZU ARIBAŞ TARAKÇI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıNecmettin Erbakan ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. İBRAHİM ERAYMAN