Geri Dön

Metabolom ve transkriptom profillemesi ile insan kemik iliğinde hematopoetik niş karakterizasyonu

Characterization of hematopoietic niches in human bone marrow with metabolome and transcriptome profiling

PDF İndir

  1. Tez No: 396436
  2. Yazar: SELDA AYHAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. RIZA KÖKSAL ÖZGÜL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoistatistik, Genetik, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları, Biostatistics, Genetics, Child Health and Diseases
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kök Hücre Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 141

Özet

Model organizmalar ve hayvan deneylerinde, kemik iliğinde hematopoetik kök hücrelerin (HKH)/projenitörlerin özel organizasyonlarının olduğu ve bu organizasyonu niş adı verilen özel mikroçevreleri aracılığıyla sağladıkları gösterilmiştir. Bu çalışmalara göre HKH nişinde endosteal niş ve vasküler niş olmak üzere iki farklı niş olduğu bilinmektedir. Bu çalışma sağlıklı insan kemik iliğinde farklı nişlerin varlığının araştırılması ve karakterizasyonu amacıyla yapılmış olup, bu alanda ilk olma özelliği taşımaktadır. Çalışmamızda sağlıklı insan kemik iliğinde nişlerin varlığı omiks teknolojileri kullanılarak araştırılmıştır: transkriptomiks profillemede RNA-Seq, metabolomiks profillemede GC-MS tekniği kullanılmıştır. Bu amaçla çalışmamızda sağlıklı donörlerinin iki farklı kemik iliği bölgesinden (endosteal bölge=Niş1 ve vasküler bölge=Niş2) alınan kemik iliği örneklerinden plazma ve mezenkimal kök hücreler izole edililerek, karşılaştırmalı analizler ile nişlerin karakterizasyonu yapılmıştır. Niş1 ve Niş2 karşılaştırmalı RNA-Seq analizi sonucunda farklı eksprese olan 54 gen tanımlanmıştır (p

Özet (Çeviri)

In model organisms and animal experiments, it has been shown that hematopoietic stem cells (HSC) in bone marrow have special organizations and they provide this organization through special microenvironment called niche. According to these studies, it is known that in HSC niche there are two different niches including endosteal and vascular niche. This study is conducted to investigate and characterization of presence of different niches in the bone marrow of healthy people, it carries the first of its kind in this area. In this study, the presence of niches in healthy human bone marrow was investigated using omics technologies: transcriptomics using the RNA-Seq technique and metabolomics using GC-MS technique. For this purpose, in this study it has been made comparative analysis with niche characterization, isolating plasma and mesenchymal stem cells from bone marrow samples taken from two different bone marrow areas (endosteal area=Niche1 and vascular niche=Niche2) of healthy donors. 54 differentially expressed genes were identified as a result of Niche1 and Niche2 comparative RNA-Seq analysis (p

Benzer Tezler

  1. Tez No

    775412

    Makrofajların mekanoimmünitesi ile meme kanseri arasındaki karşılıklı etkilerin multi-omik teknikler kullanılarak karşılaştırmalı incelenmesi

    A comparative investigation on the reciprocal influence between mechanoimmunity of macrophages and breast cancer by utilizing multi-omics techniques

    BUSE SARI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyokimyaAnkara Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BURAK DERKUŞ

  2. Tez No

    473206

    Metabolic and genetic profiling for primary and secondary metabolites in tomato

    Domateste birincil ve ikincil metabolitleriçin metabolik ve genetik profilleme

    NERGİZ GÜRBÜZ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Biyokimyaİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SAMİ DOĞANLAR

  3. Tez No

    425958

    Buğdayda kök ve kök boğazı çürüklüğü hastalığına yanıttaki genlerin ifade düzeylerinin mikroarray analizi ile belirlenmesi

    Determining the level of gene expression by microarray analysis of the response of with root and crown rot diseases

    EMRE İSHAKOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiMustafa Kemal Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA ERAYMAN

  4. Tez No

    792655

    Transcriptome based molecular subtyping of AML and elucidation of molecular responses under different therapeutic agents

    Akut miyeloid löseminin transkriptom bazlı moleküler alt tiplemesi ve farklı terapötik ajanlar altında moleküler cevapların aydınlatılması

    NURDAN KELEŞOĞLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyomühendislikMarmara Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KAZIM YALÇIN ARĞA

    PROF. DR. BETÜL YILMAZ

  5. Tez No

    790952

    Comparative metabolome and transcriptome analysis of anthocyanin biosynthesis in fig (Ficus carica L.)

    İncir (Ficus carica L.)'de antosiyanin biyosentezinin karşılaştırmalı metabolom ve transkriptom analizi

    GHASSAN ZAHID

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyoteknolojiÇukurova Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YILDIZ KAÇAR

Geri Dön