Enhancing direct conversion of mouse fibroblasts to induced hepatocytes
Fare fibroblastlarının uyarılmış hepatositlere dönüşümünün geliştirilmesi
- Tez No: 397211
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. TEVFİK TAMER ÖNDER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Koç Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 104
Özet
Transdiferansiyasyon farklılaşmış bir hücrenin, başka bir hücre tipine ait transkripsiyon faktörlerinin ifadesi ile başka bir hücreye dönüşmesi olarak tanımlanır. İndüklenmiş pluripotent kök hücrelerin farklılaştırılmasına göre bu sürecin daha hızlı ve potansiyel olarak daha güvenli olduğu düşünülmektedir. Ancak birçok açıdan bu dönüşümün verimi düşük kalmaktadır. Bu da soy dönüşümünün henüz tam olarak karakterize edilememiş engelleri olduğunu düşündürmektedir. Biz bu çalışmada bu engellerden birinin kromatinin yeniden modellemesi olabileceği hipotezini kurduk. Bu hipotezi test etmek için fare fibroblastlarının indüklenmiş hepatositlere dönüşümünü ele aldık. Fare fibroblastlarının indüklenmiş hepatositlere dönüştürülmesi için gerekli olan Hnf4α ve Foxa1 transkripsiyon faktörlerini fibroblastlarda ifade ettik ve hücreleri kromatin modifikatörlerinin küçük molekül inhibitörlerine maruz bıraktık. Sonrasında oluşan indüklenmiş hepatositlerin oluşma verimliliğini ve kalitesini gen ifadesi seviyesinde test ettik. Çalışmalarımız sonucunda H3K79 metiltransferaz DOT1L'in ve H3K27 metiltransferaz EZH2'nin inhibisyonunun indüklenmiş hepatosit oluşumunu desteklediğini gözlemledik. Bu iki modifikasyonun inhibisyonu indüklenmiş hepatositlerin normal fare hepatositlerine daha çok benzediğini bulduk. Ayrıca, hücrelerin transkripsiyon faktörlerinin ifadesinden önce yerine sonra küçük moleküllere maruz kalmasının daha etkili olduğunu gözlemledik. Ancak denediğimiz hiçbir küçük molekül bu iki transkripsiyon faktörünün yerine tamamen geçemedi. Bu çalışma ile fibroblasttan programlanmış fare hepatositlerinin kimliklerinin oluşturulmasında önemli olan kromatin modifikasyonlarını inceledik.
Özet (Çeviri)
Transdifferentiation is the conversion of a differentiated cell to another differentiated cell type by the expression of lineage-specific transcription factors. Compared to directed differentiation of pluripotent stem cells, it is deemed to happen faster and be potentially safer for future clinical applications. However, in many contexts, the fidelity and efficiency of lineage conversion remains low, which suggest that there are a number of uncharacterized barriers to lineage conversion. We hypothesized that remodeling of the chromatin landscape during transdifferentiation may constitute one such barrier and modulating the activity of chromatin modifier complexes may increase the efficiency of lineage conversion. We have utilized the conversion of mouse fibroblasts to induced hepatocytes (iHeps) as a model system to test this hypothesis and to understand how chromatin modifications change during this process. Specifically, we expressed the two transcription factors Hnf4α and Foxa1 necessary for the conversion of fibroblasts, and treated the cells with small molecule inhibitors of various chromatin modifiers. We then tested both the efficiency and the quality of conversion at the gene expression level. We observed that removal of the activating H3K79 methylation mark through inhibition of DOT1L, and suppression of the repressive H3K27me3 mark through the inhibition of EZH2 are facilitators of this conversion. Inhibition of these two modifications led to the generation of induced hepatocytes that are more similar to mouse hepatocytes than untreated controls are in terms of hepatocyte marker expression. These findings provide insight into the chromatin modifications that are important in establishing the identity of engineered hepatocytes.
Benzer Tezler
- Remote sensing, tracking and imaging inside MRI systems
MRI sistemlerinde uzaktan algılama, izleme ve görüntüleme
MEHMET BERK BİLGİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
BiyomühendislikKoç ÜniversitesiElektrik ve Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN SİTTİ
PROF. DR. HAVVA YAĞCI ACAR
- Elevating the photocatalytic activity of BiVO4 based photoanodes for solar water splitting
Güneş enerjili su ayrımı için BiVO4 bazlı fotoanotların fotokatalitik aktivitesinin arttırılması
MAHSA BARZGARVISHLAGHI
Doktora
İngilizce
2019
EnerjiKoç ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SARP KAYA
- Design and implementation of double stage starter/generator for hybrid propulsion systems
Hibrit itki sistemleri için çift kademe starter/generator tasarımı ve uygulaması
SAMİ ARSLAN
Doktora
İngilizce
2023
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiGazi ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TUĞBA SELCEN NAVRUZ
PROF. DR. İRES İSKENDER
- Katkılı SIO2 filmlerin CHF3-O2 plazması içerisinde reaktifiyon aşındırılması
Başlık çevirisi yok
SUAT ALİ ERTUĞRUL
- Kolza sap-samanının pirolizi
Pyrolysis of the straw and stalk of the rape plant
ERKAN TETİK
Yüksek Lisans
Türkçe
1997
Kimya Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FİLİZ KARAOSMANOĞLU