Regulatory networks studied by ellipsoidal calculus
Düzenleyici ağlarının elipsoitsel analiz ile araştırması
- Tez No: 409129
- Danışmanlar: PROF. DR. GERHARD WİEHELM WEBER, DOÇ. DR. VİLDA PURUTÇUOĞLU GAZİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Matematik, Mathematics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Uygulamalı Matematik Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilimsel Hesaplama Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 77
Özet
Yöneylem araştırmasındaki; veri belirsizliği ve kirliliğinden etkilenen düzenleyici ağların tanımlanması önemli bir sorundur. Düzenleyici-ağları; çevrebilim, eğitim ve maliye alanlarında genel bir yapı sağlamaktadır. Kümeleme ve sınıflama yöntemlerinden sonra işlevsel olarak ilgili hedef ve çevre çarpan grupları belirlenebilir. Belirsizlik içeren karmaşık düzenleyeci ağların çözümlenmesi; sağlam regresyondaki elipsoitler ile temsil edilen değişkenler arasındaki bilinmeyen etkileşimler yüzünden aşamalı olarak karmaşıklaşmaktadır. Çok değişkenli belirsiz durumların açık gösterimini elde etmek için sistemlere elipsoitsel analiz uygulanabilir. MATLAB Ellipsoidal Toolbox (ET), elipsoitler, hiperdüzlemler ve hedef kümelerin grafiğini çizmek için verimli fonksiyonlar sunar. Bu tezde düzenleyici-ağları, elipsoitsel belirsizlik altında tahminlemek için birçok regresyon modeli ve bir parametre tahminleme ve ters problemi imgelemek için Ellipsoidal Toolbox daki araçlar çalışılmıştır.
Özet (Çeviri)
The identification of regulatory networks affected by noise and data uncertainty is a serious problem in many Operational Research applications. The fundamental structure of underlying systems can be established by regulatory networks in many sector like ecology, education and finance. After clustering and classification methods gene/target and environmental states can be grouped into functional behaviour. The analysis of complex regulatory systems under uncertainty is a compounded complex by the unknown interactions between the variables which are represented by ellipsoids. Ellipsoidal calculus is used in determination of the explicit representations of the uncertain multivariate states of the system. MATLAB Ellipsoidal Toolbox (ET) provides efficient plotting routines of ellipsoids, hyperplanes and reach sets. In this thesis, several regression models are studied in order to approximate regulatory networks under ellipsoidal uncertainty and Ellipsoidal Toolbox routines are explained for representing a parameter estimation and inverse problem.
Benzer Tezler
- Evolving boolean graphs to model the topological and dynamical behavior of biological regulatory networks and their metanetworks
Boolcu ağların evrimleştirilmesi ile biyolojik regulasyon ağlarının ve meta-ağlarının topolojik ve dinamik özelliklerinin modellenmesi
BURÇİN DANACI
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiFizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE ERZAN
- Camponotus floridanus'ta BMP sinyalizasyonu ve zorunlu endosimbiyont varliğinda değişimi
BMP signaling in camponotus floridanus and its alteration in the presence of obligate endosymbionts
NİHAN SULTAN MİLAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MURAT PEKMEZ
DR. ÖĞR. ÜYESİ ABDUL MATTEEN RAFIQI
- Modern mathematical methods in modeling and dynamics of regulatory systems of gene-environment networks
Gen-ortam ağlarının düzenleyici sistemlerinin dinamikleri ve modellemesinde modern matematiksel yöntemler
ÖZLEM DEFTERLİ
Doktora
İngilizce
2011
MatematikOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMatematik Bölümü
DOÇ. DR. SONGÜL KAYA MERDAN
PROF. DR. GERHARD WİLHELM WEBER
- Exploring microRNA interaction networks to explain the relationship between caloric restriction and breast cancer in mice
Farelerde kalorik kısıtlama ile meme kanseri arasındaki ilişkiyi açıklamak için mikroRNA etkileşim ağlarının araştırılması
ATAKAN AYDEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyoteknolojiYeditepe ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SONER DOĞAN
DR. ÖĞR. ÜYESİ ANDRES OCTAVIO ARAVENA DUARTE
- Essays on gene regulatory network models and their stability analysis
Gen düzenleyici ağ modelleri ve onların kararlılık analizi üzerine denemeler
DİLAN ÖZTÜRK ŞENER
Doktora
İngilizce
2023
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiElektrik ve Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİTAY ÖZBAY