Comparison of optical measurements for better ni tracking in bacteria
Bakterilerde daha verimli nikel takibi için optik ölçüm yöntemlerinin karşılaştırılması
- Tez No: 416528
- Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE GÜL GÖZEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Biyoloji, Microbiology, Biology
- Anahtar Kelimeler: nikel, tatlısu bakterileri, UV-Vis Spektroskopisi, ATR-FTIR Spektroskopisi, nickel, freshwater bacteria, UV-Vis Spectroscopy, ATR-FTIR Spectroscopy
- Yıl: 2015
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Metal kirliliği, sanayi bölgelerinde sık görülen bir problemdir. Metal kirliliğinden, diğer canlılar kadar mikroorganizmalar da etkilenir. Bu nedenle, mikroorganizmalar direnç mekanizmaları geliştirmiştir. Geleneksel mikrobiyolojik uygulamalar, metal dirençliliği çalışmalarında tek başına yeterli olmamaktadır. Başka ölçüm teknikleri ve cihazların kullanımı yoluyla elde edilebilecek ek veriler gereklidir. Ancak, ölçüm yapan cihazların hassasiyetleri farklılık göstermektedir. Bir cihaz, belli koşullarda ve konsantrasyonlarda çalışabilir; fakat bu koşullar ve konsantrasyonlar değiştiğinde hassasiyeti düşük olabilir. Bu nedenle, uygun verileri sağlayabilecek olan ölçüm yöntemlerinin verimliliğinin belirlenmesi gereklidir. Bu çalışmada, bakteri kültürlerinin besiyerlerindeki nikel miktarının ölçümünde kullanılan spektroskopi temelli yöntemlerin uygunluğu ve verimliliği denenmiştir. Çalışmada karşılaştırılan iki optik cihaz, UV-Vis spektroskobu ve ATR-FTIR spektroskobudur. İki Microbacterium oxydans suşu, türü tanımlanmamış başka bir Microbacterium izolatı ve E. coli suşu, üreyebildikleri en yüksek nikel konsantrasyonunda üretilmiş ve bakterilerin ayrıştırılmasından sonra kültür sıvılarında kalan nikel konsantrasyonu, UV-Vis ve ATR-FTIR spektroskoplarıyla ölçülmüştür. Ölçümlerin ardından, iki farklı cihazdan elde edilen veriler karşılaştırılmıştır. Bulunan sonuçlar, ATR-FTIR cihazının ölçüm hassasiyetinin daha yüksek olduğunu ve nikelin yaklaşık konsantrasyonunun hesaplanmasında bant yoğunluğu değerlerinin kullanılmasının kabul edilebilir bir yöntem olduğunu göstermektedir. Bakterilerin metal emilim kapasiteleri kültür sıvılarında kalan metal miktarı üzerinden değerlendirilmiştir.
Özet (Çeviri)
Metal pollution is a common problem in industrial areas. Microorganisms, as well as macroorganisms are affected from metal pollution. In order to cope with this problem, microorganisms develop resistance mechanisms. Traditional microbiological techniques alone are not sufficient in resistance studies. Additional data acquisition by using other measurement techniques and devices are also required. However, there are differences in sentitivities of the measurement devices. A given device may work under a set of conditions and concentrations but may not be suitable when the conditions and concentrations change. Therefore, testing the efficiency of measurement device that is suitable to produce meaningful data is essential. In this study, the possibility and feasibility of using spectroscopy based measurements to quantitate Ni in the spent media of bacterial cultures were explored. The UV-Vis Spectroscope and ATR-FTIR spectroscope were the two optical devices that were compared in this study. Two strains of Microbacterium oxydans, another undefined Microbacterium freshwater isolate, and E. coli were grown at their corresponding minimum inhibitory concentrations of Ni. Then the Ni concentrations left in the culture supernatants following the removal of bacteria were measured by UV-Vis and ATR-FTIR spectroscopes. The data obtained from the two devices were compared. The results indicated that ATR-FTIR spectroscopy had a higher sensitivity and the band intensities provided reasonable approximation for better estimations of Ni concentrations. The data were discussed in terms of detection of metals while the metal sorption capacities of bacteria being evaluated.
Benzer Tezler
- Hedef kimyasala duyarlı floresan malzemelerin sentezi ve kimyasal sensörlerde kullanımı
Synthesis of fluorescent materials sensitive to target chemicals and usage in chemical sensors
FEHMİ KARAGÖZ
- Gemilerin manevra denklemlerinin bilgisayarla çözümü
The Solutions of equations of ship manoeuvres by the computer
EMİN KORKUT
- Sıvı kristallerin optik ve kalorimetrik özelliklerinin incelenmesi
Optical and calorimetric study of liquid crystals
MEHMET CAN ÇETİNKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiFizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEVTAP YILDIZ ÖZBEK
- AlGa(In)N/GaN yüksek elektron mobiliteli transistörlerde iki boyutlu elektron gazına ait sıcak elektron dinamiğinin incelenmesi
Investigation of hot electron dynamics of two dimensional electron gas in AlGa(In)N/GaN high electron mobility transistors
AYKUT ILGAZ
Doktora
Türkçe
2011
Fizik ve Fizik MühendisliğiBalıkesir ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SİBEL GÖKDEN
PROF. DR. ALİ TEKE
- Pediatrik hidrosefali olgularında, şant yerleştirilmesi öncesi ve sonrası serebral oksijenasyona anestezinin etkilerinin karşılaştırılması
In cases of pediatric hydrocephalus, comparison of the effects of anesthesia on cerebral oxygenation before and after shunt placement
AHMET KANTER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
ÜrolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiAnesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. MUHAMMED BİLAL ÇEĞİN