Geri Dön

Zeytin aldolaz ve ökaryotik translasyon başlatma faktörü 4e geninin moleküler karakterizasyonu

Molecular characterization of olive aldolase and eukaryotic translation initiation factor 4e gene

PDF İndir

  1. Tez No: 432818
  2. Yazar: SÜMEYYE ALTUNOK
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. EKREM DÜNDAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Balıkesir Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 116

Özet

Zeytin (Olea europaea L.); Oleaceae familyasına ait, Akdeniz iklimine özgü, her dem yeşil ve uzun ömürlü, ekonomik değeri yüksek bir ağaç türüdür. Zeytin genlerinin ve bu genlerin işlevlerinin bilinmesini amaçlayan bir hedef doğrultusunda başlatılan bu çalışmada fruktoz 1,6-bifosfat aldolaz geninin ve ökaryotik translasyon başlatma faktörünün moleküler karakterizasyonu amaçlanmıştır. Genden protein elde edilirken Real-time PCR, klonlama, transformasyon, SDS-PAGE, Western Blot, Ni-NTA saflaştırma yöntemleri kullanılmıştır. Biyoinformatik analizler için ise; nükleotid ve protein BLAST (NCBI), BioEdit, ExPASy, FinchTV, CLC Genomics Workbench, Primer3, SOSUI, SignalP$ ve TMHMM programları kullanılmıştır. Biyoinformatik analizler sonucunda OeFBPA'nın; 314 aminoasitten oluştuğu ve en çok glisin aminoasitini içerdiği, 34 kDa moleküler ağırlığa sahip olduğu, hidrofobik bir protein olduğu, optimum pH değeri 7.94 olan ve OeEIF'ın 245 aminoasitten oluştuğu ve en çok glutamik asit ve lizin aminoasitlerini içerdiği, 27 kDa moleküler ağırlığa sahip olduğu, hidrofobik bir protein olduğu, optimum pH değeri 5 olduğu tespit edilmiştir. Dokusal ifade analizlerine göre OeFBPA'nın GAPDH'e göre en fazla çiçekte ifade olduğu ve“var yılı”yaprak ve pediselde de fazla oranda sentezlendiği görüldü. OeEIF'ın ubiqutine göre en fazla“var yılı”yaprakta ifade olduğu görüldü.

Özet (Çeviri)

Olive (Olea europaea L.) is a fruit tree which belongs to the Oleaceae family. It's specific to the Mediterranean climate, evergreen, long-lasting and it has high a economic value. In this study, molecular characterizations of fructose 1,6-bisphosphate aldolase and eukaryotic translation initiation factor were aimed. To produce protein from the genes the following purification methods were used: Real-time PCR, cloning, transformation, SDS-PAGE, Western Blot, Ni-NTA. And for bioinformatics analysis; nucleotide and protein BLAST (NCBI), BioEdit, ExPASy, FinchTV, CLC Genomics Workbench, Primer3, SOSUI, SignalP and TMHMM. Bioinformatic analyses for OeFBPA revealed the following results: it's 314 amino acids long (it contains 314 aminoacids) and contains mostly glycine (rich in glycine). Its molecular mass is 34 kDa, it's an hydrophilic protein and it's optimum pH value is 7.94 pH. Bioinformatics analysis for OeEIF revealed it had 245 amino acids (it contains 245 aminoacids) and it was rich in glutamic acid and lysine. OeEIF's molecular mass was calculated as 27 kDa. It was predicted as an hydrophilic protein and its optimum pH value appeared 5. The spatial expression results revealed OeIF4E expressed about 30 fold more than the housekeeping gene (ubiquitin) in leaves. Comparing the“on year”and“off year”leaves, the gene appeared to express more in“on year”leaves suggesting a role in nutrition supply for fruit formation and / or fruit development.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    413390

    Trakya bölgesindeki zeytin ağaçlarında görülen abiyotik hastalıkların belirlenmesi ve bazı virüs hastalıklarının DAS-ELISA ile tanılanması

    Determinations of abiotic diseases on olive trees and identification of some virus diseases by DAS-ELISA in the Trakya region of Turkey

    ZEHRA VURANKAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    ZiraatNamık Kemal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET ÇITIR

  2. Tez No

    415361

    Zeytin posası (Pirina) üzerine metil viyoletin sulu çözeltiden adsorpsiyonu

    Adsorption of methl violet from aqueous solution onto olive cake (Pirina)

    MEHMET ÖNCEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    KimyaKilis 7 Aralık Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BİLAL ACEMİOĞLU

  3. Tez No

    415389

    Treatment of olive mill effluent by immobilized nano-ZnO-Magnetite

    İmmobilize edilmiş nano-ZnO-Magnetit ile karasuyunun arıtılması

    MERVE BALABAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Çevre MühendisliğiDokuz Eylül Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DELİA TERESA SPONZA

  4. Tez No

    417118

    Zeytin yaprağı (Olea europaea L.) ekstraktı'nın deneysel diyabette antidiyabetik, antioksidan, 8-OHdG ve koruyucu etkilerinin araştırılması

    An investigation of antidiabetic, antioxidant, 8-OHdG and protective effects of olive leaf (Olea europaea L.) extract on the experimental diabetes

    MEHMET ALİ TEMİZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyokimyaYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ATİLLA TEMUR

  5. Tez No

    419669

    Çocuklarda zeytin poleni duyarlılığı sıklığı ve zeytin poleni alerjisi saptanan hastaların alerjik hastalık kliniği ile duyarlılık ilişkisinin değerlendirilmesi

    Olea europaea pollen sensitization in childhood and its association with the allergic diseases

    OSMAN ŞİMŞEK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Aile HekimliğiSağlık Bakanlığı

    Aile Hekimliği Ana Bilim Dalı

    UZMAN FATİH ÇELMELİ

Geri Dön