Geri Dön

Transcriptome analysis of morphine biosynthesis in Opium poppy (Papaver somniferum L.)

Haşhaş (Papaver somnıferum L.)'ta transkriptom analizi ile morfin sentez mekanizmasının araştırılması

PDF İndir

  1. Tez No: 441746
  2. Yazar: KUAYBE YÜCEBİLGİLİ KURTOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. İBRAHİM İLKER ÖZYİĞİT, YRD. DOÇ. DR. TUĞBA GÜRKÖK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 199

Özet

Haşhaş (Papaver somniferum L.) dünyanın en eski tıbbi bitkilerinden biridir. Tıbbi ve dolayısıyla ekonomik değeri haşhaşın benzilizokuinolin (BIA) üretimine dayanmaktadır. Morfin, haşhaşta yoğun olarak bulunan önemli bir BIA alkaloidi olup tıpta narkotik ağrı kesici ve uyuşturucu olarak kullanılmaktadır. Bu tezde Illumina HiSeq plantformu kullanılarak toplam 36,16 Gb dizi verisi elde edilmiş ve MeJA elisitörü ile indüklenen morfince zengin (MR) ve fakir (MP) haşhaş varyetelerinin kapsül ve gövde dokularındaki metabolit profilleriyle birlikte bütüncül bir yaklaşımla kıyaslanarak değerlendirilmiştir. Alkaloid analizleri her iki varyetede de kapsül dokularında morfin düzeylerinin indüklendiğini göstermiştir. GO ve KEGG analizlerinde, stres yanıtı, sinyal iletimi ve sekondar metabolit biyosentezi ile ilgili biyolojik işlemlerin öne çıktığı tesbit edilmiştir. Aquaporin TIP, 2ODD, bHLH113, calmodulin, (+)-neomenthol dehydrogenase, (S)-tetrahydroprotoberberine N-methyltransferase, major latex protein 146, NRT1/PTR Family proteins, F-box/LRR-repeat proteinlerini kodlayan transkriptlerin MeJA uygulamasıyla ifade düzeyleri en çok değişen genler olduğu belirlenmiştir. Ayrıca, BIA biyosentezine özgün SalSyn, SalAT, SalR, T6ODM, COR ve CODM enzimlerine ait transkriptlerde dokuya ve varyeteye göre değişim olduğu saptanmıştır. Bu tezde bugüne kadar elde edilmiş en kapsamlı transkriptom verisi üretilmiş olup bu bilgiler haşhaşta BIA biyosentez mekanizmasının araştırılacağı ileri işlevsel genomik çalışmalar için kaynak oluşturacak niteliktedir.

Özet (Çeviri)

Opium poppy (Papaver somniferum L.) is one of the most ancient medicinal plants of the world. Its medicinal and economic importance is highly dependent on the benzylisoquinoline alkaloid (BIA) production. Morphine is one of the most important and abundant BIA commercially obtained opium poppy. It is mainly used as narcotic analgesic in medicine. In this thesis, a total of 36,16 Gb sequence data was generated by Illumina HiSeq platform and transcriptome profiles of elicitor (MeJA) induced capsule and stem tissue from morphine rich (MR) and morphine poor (MP) cultivars are compared with an integrative metabolite and transcriptome approach. Alkaloid analysis confirmed the induction of morphine levels in both MR and MP capsule tissues. Based on GO and KEGG pathway analysis, biologic processes related to stress response, signal transduction and seconder metabolite biosynthesis are found to be prominent. Aquaporin TIP, 2ODD, bHLH113, Calmodulin, (+)-neomenthol dehydrogenase, (S)-tetrahydroprotoberberine N-methyltransferase, major latex protein 146, NRT1/PTR family, F-box/LRR-repeat protein coding transcripts are found to be the most differentially expressed transcripts. Besides, morphine biosynthesis route-specific transcripts corresponding to SalSyn, SalAT, SalR, T6ODM, COR and CODM enzymes were found to be differentially expressed in different tissues and cultivars. This thesis produced the largest transcriptome data obtained so far and is an important source for further functional genomic studies to investigate BIA biosynthesis mechanism in opium poppy.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    343539

    Morfin içeriği indüklenmiş haşhaş (Papaver somniferum L.) bitkisinde genom düzeyinde transkriptom analizi

    Genome wide transcriptome analysis in morphine content induced opium poppy (Papaver somniferum L.)

    TUĞBA GÜRKÖK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiGaziosmanpaşa Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İSKENDER PARMAKSIZ

    DOÇ. DR. TURGAY ÜNVER

  2. Tez No

    352463

    Haşhaş (Papaver somniferum L.) mikro-RNA larının (miRNA) tanımlanması ve miRNA hedef gen ekspresyon analizlerinin belirlenmesi

    Identification of opium poppy micro-RNAs (miRNA) and expression analyses of their target gene transcripts

    HATİCE BÖKE

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TURGAY ÜNVER

  3. Tez No

    606811

    Hacıhaliloğlu kayısı (Prunus armeniaca) çeşidinde transkriptom analizi

    Transcriptome analysis of apricot (Prunus armeniaca) varriety 'Hacıhaliloğlu'

    ONUR CANBULAT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatErciyes Üniversitesi

    Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. KAHRAMAN GÜRCAN

  4. Tez No

    541966

    Glioblastoma multiformeli hastalarda transkriptom analizi

    Transcriptome analysis of glioblastoma multiforma patients

    DİDEM SEVEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Biyolojiİstanbul Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE NUR BUYRU

  5. Tez No

    383077

    Transcriptome analysis of Thermoplasma volcanium GSS11 under extreme stress

    Thermoplasma volcanium GSS11'ın ekstrem stres altında transcriptom analizi

    SEMA ZABCI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK

Geri Dön