Mikrosatellit belirteçleri ile doğal kum zambağı (Pancratium maritimum L.) populasyonlarında genetik çeşitliliğin belirlenmesi
Determination of genetic diversity in natural populations of sea daffodil (Pancratium maritimum L.) with microsatellite markers
- Tez No: 449173
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. BEHİYE BANU BİLGEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Botanik, Genetik, Biotechnology, Botany, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Namık Kemal Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
Soğanlı bitkiler çeşitli sanayi alanlarında büyük bir kullanım potansiyeline sahip olmalarından dolayı Türkiye biyoçeşitliliğinde önemli bir yere sahiptir. Ülkemizde özellikle Akdeniz kıyılarında ve yalnızca bazı sahillerde görülen, genel olarak kumullarda yayılım gösteren kum zambağı (Pancratium maritimum L.), önemli soğanlı bitkilerimizden biridir. Bu çalışmada İğneada Longoz Ormanları Milli Parkı (Kırklareli), Çamlıkoy Tabiat Parkı (Tekirdağ), Pamucak Sahili (İzmir) ve Belek Sahili'nden (Antalya) toplanan 4 kum zambağı populasyonunun 4 nSSR primeri kullanılarak genetik yapısı ve populasyonların genetik çeşitliliği belirlendi. Çalışmada kullanılan 4 nSSR lokusundan (SSR-15, SSR-20, SSR-27, SSR-38) 3 tanesi (SSR-20 hariç) polimorfik (%75) olarak saptandı. Analiz edilen 81 örnekte dört lokus için toplam 20 allel bulundu. Genetik çeşitlilik parametrelerinden; lokus başına düşen ortalama allel sayısı (Na=3,313), etkili allel sayısı (Ne=2,190), Shannon sabiti (I=0,728), gözlenen heterozigotluk (Ho=0,449) ve beklenen heterozigotluk (He=0,396) değerleri hesaplandı. Populasyonların genetik çeşitliliğinin büyük oranda (%81) populasyon içerisinde olduğu, populasyonlar arası çeşitliliğin düşük olduğu (%19) gözlendi. Çalışma sonucunda elde edilen UPGMA dendrogramına göre, coğrafik olarak birbirine yakın bulunan İğneada ve Çamlıkoy populasyonlarının bir grup, Antalya ve Pamucak populasyonlarının diğer grubu oluşturduğu gözlendi. Elde edilen sonuçlar, çalışılan populasyonların genetik yapısı hakkında önemli bilgiler içermektedir. Ayrıca kum zambağı ve yakın akraba türlerle yapılacak olan çeşitli genetik çalışmalara ve gen kaynaklarını korunma stratejilerinin belirlenmesine yönelik çalışmalara yardımcı olacak niteliktedir.
Özet (Çeviri)
Bulbous plants have important role in Turkey's biodiversity due to their great potential use in various industries. Sea daffodils (Pancratium maritimum L.) are one of the important bulbous plants which are generally spreading in sand dunes and seen only in Mediterranean coast and certain beaches in our country. In this study, the genetic structure and genetic diversity of four natural sea daffodil populations from İğneada Longoz Forests National Park (Kırklareli), Çamlıkoy National Park (Tekirdağ), Pamucak Coast (İzmir) and Belek Coast (Antalya) was determined by 4 nuclear microsatellite (nSSR) primers. Four 4 nSSR (SSR-15, SSR-20, SSR-27 and SSR-38) loci were analyzed. All, except SSR-20, were found to be polymorphic (75%). A total of 20 alleles were determined for the analyzed four loci in 81 samples. Genetic diversity parameters; mean number of alleles for each loci (Na=3.313), effective allele number (Ne=2.190), Shannon's information index (I=0.728), observed heterozygosity (Ho=0.449) and expected heterozygosity (He=0.396) were calculated. Rather high proportion of the genetic diversity (81%) was due to within population variation and the remaining part (19%) was due to variation between populations. According to acquired UPGMA dendrogram, İğneada and Çamlıkoy populations, which are geographically close, takes place in one group, Antalya and Pamucak populations occurs in other group. The results of this study include important informations about the genetic structure of the studied populations. Also, the data obtained from this study is valuable to provide important contributions to the national and international studies with sea daffodil and other related species, and the determination of genetic resources conservation strategies.
Benzer Tezler
- Assessment of genetic diversity in Picea orientalis (L.) Link. in genetic resources by microsatellites
Mikrosatellit belirteçler yardımıyla Picea orientalis (L.) Link. gen kaynaklarında genetik çeşitliliğin belirlenmesi
ASLI ÖZDİLEK
Doktora
İngilizce
2015
GenetikOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEKİ KAYA
YRD. DOÇ. DR. FATİH TEMEL
- Antalya -Düzlerçamı ortak bahçe deneme alanındaki altı farklı Kızılçam (Pinus brutia Ten.) populasyonunda cpSSR belirteçleri ile genetik çeşitliliğin belirlenmesi
Determination of genetic variation with cpSSR markers in six different populations of Turkish Red pine (Pinus brutia Ten.) in Duzlercami common-garden test site at Antalya
YUSUF KURT
- Gökçeada keçilerinin mikrosatellit belirteçler yardımıyla genetik yapılarının incelenmesi
Genetic research on the Gökceada goat breed using microsatellite markers
RABİA ISAKSSON
Doktora
Türkçe
2011
Veteriner Hekimliğiİstanbul ÜniversitesiZootekni (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HARUN CERİT
- Türkiye'de dağılım gösteren kerevit (pontastacus leptodactylus eschscholtz, 1823) populasyonlarında genetik çeşitliliğin mikrosatellit belirteçler kullanılarak belirlenmesi
Determination of genetic diversity in Turkish crayfish (pontastacus leptodactylus eschscholtz, 1823) populations using microsatellite markers
TUBA DALAR
Doktora
Türkçe
2021
Su ÜrünleriAkdeniz ÜniversitesiSu Ürünleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜLEYMAN AKHAN
- Ege Bölgesinden örneklenen anopheles sacharovi populasyonlarındaki genetik çeşitliliğinin mikrosatellit belirteçleri yardımıyla belirlenmesi
Determination of genetic diversity in anopheles sacharovi populati̇ons sampled from the Aegean Region wi̇th the help of mi̇crosatellite markers
EVİN GÜNENÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
GenetikMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERSİN DOĞAÇ