Mitokondri kontrollü apoptozda sitokrom C salınmasının matematiksel modellemesi
Mathematical modeling of cytochrome C release in mitochondria controlled apoptosis
- Tez No: 457198
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ELİFE ZERRİN BAĞCI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Namık Kemal Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 44
Özet
Apoptoz çok hücreli bir organizmadaki hücrelerin programlı ölüm sürecidir. Mitokondri kontrollü apoptozun gerçekleşmesinde rol oynayan önemli olaylardan biri sitokrom c ve kardiyolipinin etkileşimidir. Sitokrom c mitokondri iç zarında ve zarlar arası bölgede bulunur ve kardiyolipin ile etkileşime girmesi durumunda sitoplazmaya salınarak hücrenin apoptozunda rol alır. Bu çalışmada, mitokondri kontrollü apoptozda sitokrom c salınması modeli elde edilmiştir ve bulgular bu matematiksel modelin diferansiyel denklemlerinden ve bu denklemlerin nümerik çözümlerinden oluşmaktadır. Modeldeki tepkimelerin XPPAUT programı ile simülasyonları, mitokondriden sitokrom c salınma mekanizmasındaki kilit tepkimenin perokside olmuş kardiyolipinin hidrojen peroksit yokluğunda peroksidasyon döngüsüne katılması olduğunu kuramsal olarak desteklemiştir.
Özet (Çeviri)
Apoptosis is the programmed cell death of cells in a multicellular organism. Cytochrome c and cardiolipin (CL) interaction is a crucial step in mitochondria-dependent apoptosis. Cytochrome c resides on mitochondrial inner membrane and in intermembrane space and it is involved in the apoptosis of the cell through its interaction by CL and subsequent release to the cytoplasm. Cytochrome c release model in mitochondria-dependent apoptosis is obtained in this study and the results are the ordinary differential equations of this mathematical model and the numerical solutions of the differential equations. The simulations of the reactions in the model by the XPPAUT software supports the hypothesis that the key reaction in the cytochrome c release mechanism is the continuation of peroxidation cycle by peroxidized CL when hydrogen peroxide is depleted.
Benzer Tezler
- Ratlarda isoproterenol ile oluşturulan kalp krizi modelinde kronik alkol kullanımının miyokardiyal apoptoz üzerine etkisi ve kalpain inhibitörü 1'in (N-asetil-lösin-lösin-norlösinal) kardiyoprotektif rolünün araştırılması
Effect of chronic alcohol consumption on myocardial apoptosis in the rat model of isoproterenol induced heart attack and investigation on the cardioprotective role of calpain inhibitor 1 (N-acetyl-leucine-leucine-norlösi̇nal)
AYŞEGÜL OĞLAKÇI İLHAN
Doktora
Türkçe
2016
BiyokimyaEskişehir Osmangazi ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜNGÖR KANBAK
- HepG2 hücrelerinde selenyum ve vitamin C'nin apoptozis üzerine etkileri
The effects of vitamin C and selenium on apoptosis in HepG2 cells
BURCU MENEKŞE BALKAN
- Cyc1 geni transkripsiyonuna etki eden apoptotik faktörlerin araştırılması
Investigation of the effects of apototic factors on the transkription of Cyc1 gene
CANAN KESKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
GenetikUludağ ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEZAİ TÜRKEL
- Investigation of the autophagy and apoptosis relation through BAG-1, BcL-2 and Beclin 1
Otofajı̇ ve apoptoz ı̇lı̇şkı̇sı̇nı̇n BAG-1, BcL-2 ve Beclin 1 üzerı̇nden ı̇ncelenmesı̇
GİZEM ALKURT
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Primer ve metastatik insan kolon kanseri hücre hatlarındaα-laktalbumin ve sulindac'ın mitokondriyal apoptotik yolaküzerinden etkisinin immünohistokimya ve elektronmikroskobik yöntemlerle değerlendirilmesi
Evaluation of effects of α-lactalbumin and sulindac on primaryand metastatic human colon cancer cell lines via mitochondrialapoptotic pathway by immunohistochemistry and electronmicroscopy assays
IŞIL AYDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
Histoloji ve EmbriyolojiManisa Celal Bayar ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAFİZE SEDA VATANSEVER