Geri Dön

Denizel süngerlerden fungusların izolasyonu ve elde edilen metabolitlerinin biyoaktivitelerinin taranması

Isolation of sponge associated fungi and screening of bioactivies of their metabolites

PDF İndir

  1. Tez No: 469035
  2. Yazar: FERHAT CAN ÖZKAYA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. TEVFİK TANSEL TANRIKUL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Kimya, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Chemistry, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İzmir Katip Çelebi Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Su Ürünleri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 135

Özet

Tez kapsamında sünger ilişkili fungusların izolasyonu, biyoaktif metabolitlerinin saflaştırılması, metabolit profillerinin OSMAC ve ko-kültür yöntemleri ile çeşitlendirilmesi, saflaştırılan moleküllerin yapılarının aydınlatılması ve biyoaktivite potansiyellerinin taranması hedeflenmiştir Proje kapsamında, sünger ilişkili Penicillium chrysogenum ve Aspergillus carneus suşlarından 19 bileşik izole edilmiş ve kimyasal yapıları spektral yöntemlerle (1D-2D NMR, MS) tayin edilmiştir. İlk olarak P. chrysogenum suşu metabolit izolasyonu için seçilmiştir. Yapılan ayırma-saflaştırma işlemlerinden sonra 4 bilinen molekül izole edilmiştir; conidiogenone B (1), conidiogenone C (2), cyclopenol (3) and viridicatin (4). A. carneus suşunun yapay deniz tuzu ile hazırlanmış pirinç ortamından bir yeni doğal ürün – aniquinazoline E –(5) ve 8 bilinen bileşik (6 – 13) izole edilmiştir. Ardından laboratuvar koşullarında sessiz kalan gen bölgelerini aktive etmek için A. carneus suşu ile OSMAC (Bir Suş Pek Çok Molekül) ve ko-kültür denemeleri gerçekleştirilmiştir. OSMAC denemesinde, A. carneus 3 farklı besiyerinde (deniz tuzlu pirinç, modifiye Czapek besiyeri ve pirinç besiyeri) kültüre edilmiştir. Modifiye Czapek besiyerinden elde edilen özüt ile yapılan kimyasal işlemler sonucunda bir yeni bileşik – terrelumamide C – (14) ve yapay deniz tuzu ile hazırlanmış pirinç ortamında farklı bir bileşik (15) ile 7 (5 - 7, 9 – 11, 13) benzer bileşik izole edilmiştir. Bu sonuç farklı besiyerlerinin metabolit profiline etkisini kanıtlamıştır. Ko-kültür denemesi için A. carneus ve B. subtilis pirinç ortamında birlikte kültüre edilmiş ve metabolitlerin biyosentezinin indüklendiği HPLC analizleri ile gözlenmiştir. Biyosentezdeki artış 4 bileşiğin (6, 7, 9, 10) kantitatif artışının analizi ile de kanıtlanmıştır. Ayrıca, diğer iki ortamdan farklı ksanton ve antrakinon türevleri (16 – 19) izole edilmiştir. Proje sonunda, 2 yeni 17 bilinen molekül elde edilmiş ve biyoaktivite potansiyelleri taranmıştır. 3 bileşik (5, 6, 13) fare lenfoma hücre hattı L5178Y'ye karşı kahalalide F'den (IC50; 4.3 µM) daha güçlü sitotoksik etki göstermiştir (IC50; 0.19 – 0.43 µM). 2 bileşik (9 – 10) de S. aureus ATCC 700699, E. faecium ATCC 35667 ve E. faecium ATCC 700221'e karşı güçlü antimikrobiyal ekti göstermiştir.

Özet (Çeviri)

The aim of this thesis is to isolate sponge associated fungi, purification of their bioactive compounds, diversify of metabolite profiles by OSMAC and co-cultivation, eluciditaion of chemical structures of pure compounds and screening of their bioactivity potential. In this dissertation, two sponge-associated fungi Penicillium chrysogenum and Aspergillus carneus, led to isolation of 19 compounds. The chemical structures of pure compounds were eluciated by spectral experiments (1D-2D NMR, MS). P. chrysogenum was the first fungus to selected for chemical investigation. Four known compounds were isolated from this strain; conidiogenone B (1), conidiogenone C (2), cyclopenol (3) and viridicatin (4). Aniquinazoline E – new natural product (5) and 8 known (6-13) compounds (terpen, anthraquinone, xanthone and quinazolinone types) were isolated from sea salt rice medium of A. carneus. Then to activate the cryptic gene in laboratory conditions, OSMAC (One Strain MAny Compounds) and co-cultivation were carried out with A. carneus. In OSMAC experiment three types of medium (sea salt rice medium, modified Czapek medium and rice medium) were used to improve the metabolite profile. As a result of chemical investigation of modified Czapek medium, terrelumamide C – one new (14) and one different compound (15) which was different from sea salt rice medium and 7 same compounds (5 - 7, 9 – 11, 13) with sea salt rice medium were yielded. These results proved that the impression of different medium effects on metabolite profiles. For co-culture experiment, A. carneus and B. subtilis were cultivated in rice medium. Inducing of metabolite biosynthesis was observed and it was proved by quantitative analysis of 4 induced compounds (6, 7, 9, 10). Besides, different xanthone and anthraquinone derivates (16 – 19) were isolated from co-culture medium. As a result of thesis, 2 new and 17 known compound were yielded and their bioactivity potential was screened. 3 compounds (5, 6, 13) showed strong cyctotoxic activity againts to Murine lymphoma cell line L5178Y (IC50; 0.19 – 0.43 µM) than positive control kahalalide F (IC50; 4.3 µM) and 2 compound (9 – 10) showed strong antimicrobial activty againt to S. aureus ATCC 700699, E.faecium ATCC 35667 and E.faecium ATCC 700221.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    459003

    Gökkuşağı alabalığında (Oncorhynchus mykiss) antimikrobiyal etkili fungal metabolitlerin TNF-α ve IL-1β gen ekspresyonları üzerine etkisi

    Effects of fungal metabolites with antimicrobial activity on TNF-α and IL-1β gene expression in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

    BETÜL MELİKE OĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Su Ürünleriİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MUHAMMET ALTUNOK

  2. Tez No

    320603

    Sünger ilişkili bakterilerin izolasyonu, antimikrobiyal aktivitlerinin belirlenmesi ve seçilen suşun metabolitlerinin araştırılması

    Isolation of sponge associated bacteria, determination of their antimicrobial activies and an investigation on the metabolities of the selected strain

    FERHAT CAN ÖZKAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyoteknolojiEge Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. E. ESİN HAMEŞ KOCABAŞ

    PROF. DR. ERDAL BEDİR

  3. Tez No

    488283

    Sünger mikrobiyomunun metagenomik yöntemlerle belirlenmesi

    Determination of sponge microbiome by metagenomic approaches

    EBRU EMİRİYE KAVRUK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ELİF ESİN HAMEŞ

  4. Tez No

    233811

    Doğu Akdeniz-Ege süngerlerinden (Porifera) seçilen türlerin incelenmesi, bu canlılardaki kollajen tip II, IV ve Integrin proteinlerin varlığının immünhistokimyasal ve moleküler genetik düzeyde araştırılması

    Investigation of Eastern Mediterranean-Aegean selected sponge (Porifera) species and study of the existance of collajen type II, IV and integrin proteins in these animals with immunohistochemical and molecular genetic methods

    MERT GÖKALP

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    DOÇ.DR. HASAN HÜSEYİN ATAR

  5. Tez No

    85404

    Akdeniz ülkelerinde ve Türkiye'de kıyı kullanımı, yönetimi, irdeleme ve öneriler

    Başlık çevirisi yok

    MURAT AYKAÇ ERGİNÖZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    Su Ürünleriİstanbul Üniversitesi

    Denizel Çevre Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ERTUĞRUL DOĞAN

Geri Dön