Revealing the role of MED 14 in Pol II transcription regulation
Pol II transkripsiyon regulasyonunda MED14 fonksiyonunun belirlenmesi
- Tez No: 470055
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MURAT ALPER CEVHER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Protein kodlayan genlerin RNA polimeraz II (Pol II) aracığıyla transkripsiyonu, koaktivatörleri de kapsayan bir çok faktörün katılımını gerektiren, çok aşamalı bir süreçtir.30 alt-birimlik , 2mDa insan Mediator kompleksi, Pol II aktivitesini transkripsiyonun tüm aşamalarında kontrol edebilen ve gene-özgü aktivatörlerle transkripsiyon başlama öncesi kompleks arasında bir köprü görevi gören, en önemli koaktivatördür. Bu çalışma, insan Mediator kompleksinin bir alt birimi olan MED14 proteininin Pol II ile direkt olarak etkileştiğini ve MED14'ün transkripsiyondaki rolunu açığa çıkarmıştır. Multibac Baculovirus Ekspresyon sistemi ve in vitro protein sentezine dayalı insan Mediator compleksi çalışmasıyla, Med14 'ün amino ucunun Pol II ile etkileştği gösterilmiş ve Pol II 'nun bu şekilde promotör DNA 'ya gelebildiği kanıtlanmıştır. İlk olarak bu çalışmayla Mediator 'ın Pol II ile nasıl etkileştiği and Pol II 'nun uygun bir transkripsiyon başlama öncesi kompleksi ile birlikte promotör DNA ya nasıl getirildiği çözülmüştür. Bu şekilde, Mediator kompleksinin universal olarak transkripsiyonu nasıl düzenlediğini aydınlatmış olmakla kalmayıp ilerki çalışmalarda tüm Mediator kompleksini in vitro sentezleyerek aktivatör- Mediator- Pol II etkileşim mekanizmasını çözmeyi hedeflemekteyiz.
Özet (Çeviri)
Transcription of protein coding genes by RNA polymerase II (Pol II) is a multi-step process each of which requires a series of factors including coactivators. 30 subunit, 2mDa human Mediator complex is the key coactivator in transcription not only for facilitating the establishment of pre initiation complex (PIC) by acting as a bridge between gene-specific activators and Pol II but also and more importantly for regulating the Pol II activity at all transcription steps. This study identifies human Mediator complex subunit of MED14 is the critical factor in transcription by directly interacting with Pol II. By using Multibac Baculovirus expression system and reconstitution based approach of study human Mediator, Pol II was shown to be directly interacted with N terminus of MED14 and MED14 was responsible for the recruitment of Pol II to the promoter DNA. Immobilized template recruitment assay as well as viability assays showed that, MED14 is indispensable for transcription start through direct interaction with Pol II. It is the first time that the mechanism of how Pol II binds to Mediator and how it is being recruited to target gene promoters for proper PIC assembly and transcription have been unraveled. This way, we shed light into how protein coding genes are universally regulated via the Mediator complex and in the future, we will be in a better position to specifically target selected genes by reconstituting the entire Mediator complex and characterizing activator- Mediator-Pol II crosstalk.
Benzer Tezler
- أثر الإعراب في توجيه المعنى بين كتابي النهر الماد لأبي حيان، والتحرير والتنوير لابن عاشور-دراسة تطبيقية على الزهراوين
Nehrü'l-med ve Et-Tahrîr Ve't-Tenvîr tefsirleri arasında anlamı belirlemede İ'rabın etkisi: Zehrâveyn (Bakara ve Al-i İmrân sureleri) üzerine uygulamalı bir çalışma"
TAHA HÜSEYİNOĞLU
Yüksek Lisans
Arapça
2025
DinKarabük ÜniversitesiTemel İslam Bilimleri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ RABİE M. MOHAMED HEFNY
- The role of analytical procedures in revealing creative accounting practices: An empirical study in audit companies in Istanbul
Yaratıcı muhasebe uygulamalarının ortaya çıkarılmasında analitik prosedürlerin rolü: İstanbul'daki denetim şirketlerinde ampirik bir çalışma
HAYA S. A. ABOKWAIK
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
İşletmeAnadolu Üniversitesiİşletme Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARMAN AZİZ KARAGÜL
- Nöroblastoma Hücrelerinde MAPK ve AKT Sinyal Yolaklarındaki Bozulmanın ve Aralarındaki Etkileşimin Speedy/RINGO Proteini ile İlişkisinin siRNA Yöntemi ile Aydınlatılması
Revealing the role of Speedy/RINGO protein on deregulation of MAPK and AKT signaling pathways and crosstalk between these pathways using siRNA silencing method in neuroblastoma cells
SEREN KÜÇÜKVARDAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Moleküler TıpMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞEGÜL YILDIZ
- Muhasebede hata ve hilelerin ortaya çıkartılması ve engellenmesinde iç kontrolün rolü: Kayseri OSB'de bir uygulama
The role of internal control in revealing and preventing errors and frauds in accounting records
MELTEM KESKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
İşletmeYozgat Bozok Üniversitesiİşletme Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MURAT KOÇSOY
- Teknoloji destekli matematiksel etkinliklerin öğrencilerin bilişsel istemlerini ortaya çıkarmadaki rolü
The role of technology based mathematical tasks in revealing students' cognitive demands
HAKAN DURCUK
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Eğitim ve ÖğretimDokuz Eylül ÜniversitesiOrtaöğretim Fen ve Matematik Alanlar Eğitimi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. AYTEN ERDURAN