Geri Dön

Türkiye iç sularındaki Phoxinus strandjae (Drensky, 1926) populasyonunun genetik analizi

Genetic analysis of Phoxinus strandjae (Drensky, 1926) population in Turkish inland water

  1. Tez No: 484454
  2. Yazar: DUYGU ŞİRİN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. YUSUF BEKTAŞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Su Ürünleri, Genetics, Aquatic Products
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Su Ürünleri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 76

Özet

Phoxinus (Cyprinidae: Teleostei) populasyonlarının genetik teşhisi, demografik hikayesi ve populasyon genetik yapısı, Türkiye'nin Güney Marmara, Karadeniz ve Trakya havzasındaki altı populasyonundan 67 bireyin mitokondri 16S rRNA (167 bp), sitokrom c oksidaz alt ünite I (652 bp) ve sitokrom b (1140 bp) genleri dizilimindeki varyasyon kullanılarak belirlendi. Düşük haplotip sayısı, haplotip ve nükleotit çeşitlilik değerleri, eksik haplotiplerin varlığı işaret eden haplotip ağı ve uzun kollu filogenetik ağaç topolojileri (NJ, MP ve ML) birbirleriyle uyumludur ve kuzey-batı Türkiye'nin Phoxinus populasyonlarında yakın tarihli veya devam eden bir darboğazı olayını işaret etmektedir. Diğer taraftan, multimodal uyuşmazlık dağılımı, negatif fakat anlamlı olmayan Tajima'nın D ve Fu'nun Fs değerleri ve uzun kollu filogenetik ağaç topolojileri birbirleriyle uyumlu olup alt populasyonların uzun süredir Hardy-Weinberg dengesinde olduğunu göstermektedir. Populasyon çiftleri arasındaki genetik mesafeler, haplotip ağı ve filogenetik ağaçlar dört haplogruptan (KLK-HDK/ABT/RZV/SGK-PYL) oluşan bir populasyon genetik yapılanması sergilemiştir. Benzer şekilde, FST ve AMOVA istatistikleri, önemli genetik farklılaşmanın bu dört grup arasında gözlendiğini göstermiştir. Dört coğrafik populasyon grubu arasında önemli genetik farklılaşma ve düşük genetik değişimi gösteren yüksek FST değerleri ve düşük gen akışı (FST > 0.44, Nm 0.44, p-değeri> 0.05). Balıklar için yaygın olarak kullanılan sitokrom b kalibrasyon oranı (% 1.05) dikkate alındığında, Trakya ve Anadolu populasyonları arasındaki farklılaşma seviyeleri, İstanbul ve Çanakkale boğazlarının açılmasından sonra Pliyosen (yaklaşık 2 myö) boyunca birbirlerinden izole olduklarını göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Genetic identification, historical demographics and population genetic structure of Phoxinus (Cyprinidae: Teleostei) populations was characterized using the sequence variation in the mitochondrial 16S rRNA (167 bp), cytochrome c oxidase subunit I (652 bp), cytochrome b (1140 bp) gene sequences of 67 individuals from six populations in Thrace, South Marmara and Black Sea River basin, Turkey. Low haplotype number, haplotype and nucleotide diversity values, the haplotype network and phylogenetic tree topologies (NJ, MP and ML) pointing to the existence of the disappearing haplotypes are compatible and suggest to a recent or ongoing bottleneck event in the Phoxinus populations of North-western Turkey. However, the multimodal mismatch distribution, the negative and non significant Tajima's D values and Fu's Fs values and long branch lengths on a phylogenetic trees are consistent with each other, indicating that subpopulations are in the long-term Hardy-Weinberg equilibrium. Pairwise genetic distances between populations, the median joining network and the phylogenetic trees exhibited a population genetic structure consisting of four haplogroups (KLK-HDK/ABT/RZV/SGK-PYL). Similarly, FST and AMOVA statistics have shown that significant genetic variation is observed among these four groups. We observed a high FST values and low gene flow (FST > 0.44, Nm 0.44, p-value >0.05). Considering the widely used Cytb calibration rate for fish (1.05%), levels of divergence for population of Thrace and Anatolia suggest that they are isolated from each other during Pliocene (about 2 Mya), after the opening of İstanbul and Dardanalles straits.

Benzer Tezler

  1. Sudak (sander lucioperca ) ve kerevitte (pontastacus leptodactylus) viral nervöz nekrozis virusunun varlığının araştırılması

    Investigation of the presence of viral nervous necrosis virus in pike perch (sander lucioperca) and crayfish (pontastacus leptodactylus)

    HAKAN EREN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Veteriner HekimliğiSelçuk Üniversitesi

    Veterinerlik Viroloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SİBEL YAVRU

  2. Türkiye tuzlaları ve iç sularındaki Artemia popülasyonlarının biyolojik özelliklerinin saptanması ve yetiştiricilikte kullanımı üzerine bir araştırma

    An investigation on determination of biological characteristics of Artemia populations in Turkey's solar salt works and inland waters and their potancial usage in aquaculture

    EDİS KORU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    Su ÜrünleriEge Üniversitesi

    Su Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA CİRİK

  3. İstilacı Gümüşi havuz balığı (Carassius gibelio Bloch,1782) nın Ankara iç sularındaki durumu ve av potansiyeli

    Status and catch potentional of prussian carp (Carassius gibelio Bloch,1782) in Ankara inland waters

    DUYGU VURAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Su ÜrünleriEge Üniversitesi

    Su Ürünleri Avlama ve İşleme Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İLKER AYDIN

  4. Türkiye denizlerindeki seyir emniyet durumunun belirlenmesi

    Determining navigational safety status at Turkey seas

    ALPEREN ERDOĞAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Denizcilikİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Deniz Ulaştırma İşletme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÖKHAN KARA

  5. Yozgat ili ve çevresine ait çeşitli su örneklerindeki doğal radyoaktivite ve radyasyon dozlarının tahmin edilmesi

    Natural radioactivity in various water samples and radiation dose estimations in Yozgat province, Turkey

    DİLEK KOYUNCU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Fizik ve Fizik MühendisliğiNevşehir Hacı Bektaş Veli Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MELTEM DEĞERLİER