Servikal smear örneklerinde HPV pozitifliğinin araştırılması, virusun moleküler karakterizasyonu ve filogenetik analizi
Investigation of HPV positivity in cervical smear samples, molecular characteristics and phylogenetic analysis of the virus
- Tez No: 517778
- Danışmanlar: PROF. DR. OSMAN AKTAŞ
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: İnsan Papilloma Virusu, servikal sürüntü, PCR, Erzurum, Human Papilloma Virus, Cervical samples, PCR, Erzurum
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 64
Özet
Başlık (Tezin adı): Servikal Smear Örneklerinde HPV Pozitifliğinin Araştırılması, Virusun Moleküler Karakterizasyonu ve Filogenetik Analizi Amaç: İnsan papilloma virüsleri dünya çapında yaygın virüslerdir. Bu virüsler insanda cilt ve mukoz membranların enfeksiyon ve kanserlerinden sorumlu ajanlardandır. Ancak, insan sağlığını tehdit eden bu virüsün yöremizdeki prevalansı ve genotiplerini bildiren bir epidemiyolojik veriye rastlanmamıştır. Bu çalışmanın amacı hastaneye çeşitli jinekolojik şikâyetlerle başvuran kadınlarda HPV sıklığını ve genotiplerini araştırmaktır. Yöntem: Bu çalışmada, pap smear ile alınan 263 servikal sürüntü örneği HPV pozitifliği yönünden araştırıldı. Örnekler 2016 Nisan-Aralık aylarında toplanıp HPV'nin L1 gen bölgesi moleküler yöntemlerle araştırıldı. Bu amaçla PCR testi ve pozitif örneklerin sekans analizleri yapıldı. Sekanslama sonrası bioinformatik testler kullanılarak filogenetik analizleri gerçekleştirildi. Bulgular: Çalışmaya dâhil edilen örneklerin 17(%6.5)'sinde HPV DNA tespit edildi. Çalışma popülasyonu oluşturan kadınların yaş ortalamaları 39 (18-80yaş) idi. Yaş gruplarına göre dağılımlarına bakıldığında HPV DNA pozitifliği en yüksek % 9.2 ile 35-44 yaş grubundaydı. Bunu % 7.7 ile 60 yaş üstü grup takip etti. Pozitif örneklerin sekans analizi sonrası üç örneğin sekansı gerçekleşmediğinden, 14 örneğin sekansı filogenetik analize dâhil edildi. Buna göre 6'sının HPV-70, 4'ünün HPV-16, geri kalanlarında HPV-54, 72, 81 ve 114 olduğu görüldü. Genotip verileri risk grubuna göre değerlendirildiğinde, 14 örneğin % 28.6'sının HR-HPV % 71.4'ünün LR-HPV olduğu tespit edildi. Sonuç: Papillomavirus enfeksiyonları insanlarda özellikle yüksek riskli tiplerin varlığında çeşitli sağlık sorunlarına yol açarak hayat kalitesini düşürmekte ve hatta hayati risk oluşturabilmektedir. Erzurum'daki kadınlarda düşük ve yüksek riskli HPV prevalansı belirlenmiştir. Bu sonuçlar, Erzurum için HPV prevalansına ilişkin epidemiyolojik verilere katkıda bulunmaktadır. Doğu illerine yönelik kapsamlı çalışmaların olmadığı göz önüne alınırsa, epidemiyolojik veriler açısından daha çok çalışmanın yapılması gerekmektedir.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT Investigation of HPV Positivity in Cervical Smear Samples, Molecular Characteristics and Phylogenetic Analysis of the Virus Aim: Human papilloma viruses are a group of viruses that are widespread worldwide. These viruses are among the agents that are responsible for the infection and cancer of the skin and mucous membranes in the human body. But, there was no epidemiological data reporting from our region on the prevalence and genotypes of this virus that threatened human health. The aim of this study was to investigate the frequency and type distribution of Human papilloma viruses in the woman patients with gynaecological complaints who applied to the hospital. Methods: In this study, 263 cervical swab samples taken with pap-smear were investigated for HPV positivity. Samples were collected from April-December 2016 and the L1 gene region of HPV was investigated by molecular methods. For this purpose, PCR assays and sequence analysis of positive samples were performed. Phylogenetic analyses were performed using bioinformatics tests after sequencing. Results: It was seen that the average age of women taken to work was 39 (18-80years). HPV DNA positivity was highest in the age group of 35-44 years with 9.2%. This was followed by a group over 60 with 7.7%. HPV DNA was detected in 17 (6.5%) of the samples. Since the sequence of three samples did not occur after sequence analysis of positive samples, the sequence of 14 samples was included in the phylogenetic analysis. It was seen that 6 samples were HPV-70, 4 were HPV-16, and the rest were HPV-54, 72, 81 and 114. When genotype data were evaluated according to the risk group, it was determined that 28.6% of 14 samples were LR-HPV with 71.4% of HR-HPV. Conclusions: Papillomavirus infections can lead to various health problems in humans, especially in the presence of high-risk types, reducing their quality of life and even creating a life-threatening risk. The prevalence of low and high risk HPV was determined in women in Erzurum. These results contribute to epidemiological data on HPV prevalence for Erzurum. Given that there are no comprehensive studies of the eastern providences, more work needs to be done in terms of epidemiological data.
Benzer Tezler
- Aile sağlığı merkezine başvuran kadınlarda human papilloma virüs (HPV) sıklığının ve etkileyen faktörlerin araştırılması
Investigation of prevalence and affecting factors of human papilloma virus (HPV) in women admitted to family health center
MERVE KARTAL DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Kadın Hastalıkları ve DoğumKarabük ÜniversitesiEbelik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MERYEM ÇOLAK
- Sivas yöresinde human papillomavirüs infeksiyonlarının araştırılması
Research of human papillomavirus infections in Sivas region
DİLARA YILDIRIM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
MikrobiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA ZAHİR BAKICI
- Eş zamanlı HPV yapılan smear örneklerinde hpv pozitifliğinin sitomorfolojik yansımaları
The cytomorphologic reflections of HPV positivity in smear samples in which syncronous hpv testing is applied
BERAT SOYLU
- Servikal örneklerde human papilloma virüs genotiplendirme ve sitopatoloji sonuçlarının değerlendirilmesi
Evaluation of human papilloma virus genotyping and cytopatology results in cervical samples
HACER YERLİKAYA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ FİLİZ ORAK
- Serviks kanseri taramasında normal ve riskli populasyonda hpv testi kullanımı
Hpv cervical cancer screening test using in normal and risk population
CEMİLE KURTTAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
Kadın Hastalıkları ve DoğumAfyon Kocatepe ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DAĞISTAN TOLGA ARIÖZ