Lactobacillus plantarum suşunun sekonder metabolitleri ve biyoaktivitelerinin moleküler düzeyde araştırılması
Investigation of secondary metabolites and bioactivities of Lactobacillus plantarum strain at molecular level
- Tez No: 526093
- Danışmanlar: DOÇ. DR. FAHRİYE ERCAN, DOÇ. DR. SERAP YALÇIN AZARKAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilim ve Teknoloji, Genetik, Science and Technology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kırşehir Ahi Evran Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 78
Özet
Bu çalışmada, probiyotik özellikteki Lactobacillus plantarum sekonder metabolitinin insan meme kanseri MCF-7 hücre hattı ve insandaki genlerin bir kısmının korunduğu, model organizma olarak bilinen meyve sineği, Drosophila melanogaster üzerindeki sitotoksik etkileri araştırılmıştır. MCF-7 hücre hattında sekonder metabolitin IC50 değeri 0,0013 gr/ml belirlenmiştir. Drosophila melanogaster'de dozlar çalışma sırasında saptanmış olup probit analizi sonucu LC50 ve LC99 değerleri sırasıyla 0,24 mg/ml ve 0,56 mg/ml olarak saptanmıştır. Uygulama sonrası MCF-7 hücre hattında; RRAS-2, TP53, BCL-2, APAF-1, CASP-3, FADD, CASP-7, BOK genleri ve Drosophila melanogaster'de RAS64B P53, BUFFY, DARK, DECAY, FADD, DRICE, DEBCL genlerinin ekspresyon seviyeleri RT-PCR ile belirlenmiştir. Metabolit uygulaması sonucu insan meme kanseri hücre hattında ve meyve sineğinde antiapoptotik olarak karşımıza çıkan BCL-2 ve BUFFY genlerinin ekspresyonlarında azalma görülmüştür. Aynı zamanda Drosophila melanogaster'de DECAY, FADD, RAS64B apoptotik genlerinde ekspresyon artışı saptanmıştır. Bununla birlikte Lactobacillus plantarum sekonder metabolitinin analizi GC-MS yöntemi ile belirlenmiştir. Belirlenen maddelerin ilgili genlere bağlanması moleküler docking yöntemi ile gerçekleştirilmiştir. Sekonder metabolit içeriğinde tespit edilen ve L13 olarak kodlanan maddenin çalışılan genlerde yüksek bağlanma afinitesine sahip olduğu gözlenmiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, the cytotoxic effects of the probiotic Lactobacillus plantarum secondary metabolite on the human breast cancer cell line were identified as MCF-7 cell line and the Drosophila melanogaster fruit fly, investigated. The IC50 value of the secondary metabolite in the MCF-7 cell line was 0.0013 gr/ml. Drosophila melanogaster doses were determined during the study and the probit analysis resultant LC50 and LC99 values were 0.24 mg/ml and 0.56 mg/ml, respectively. After application, MCF-7 cell line; RRAS-2, TP53, BCL-2, APAF-1, CASP-3, FADD, CASP-7, BOK genes and expression levels of RAS64B P53, BUFFY, DARK, DECAY, FADD, DRICE and DEBCL genes in Drosophila melanogaster were determined by RT-PCR expression of the BCL-2 and BUFFY anti-apoptotic pathway genes, in the human and the fruit fly, has been reduced. At the same time, expression increase of DECAY, FADD, RAS64B apoptotic genes was detected in Drosophila melanogaster. However, analysis of Lactobacillus plantarum secondary metabolite was performed by GC-MS method. Molecular docking was used to link the matter to the related genes. The substance detected in the secondary metabolite content and encoded as L13 has been observed to have high binding affinity in the studied genes.
Benzer Tezler
- Yerel Lactobacillus plantarum suşlarının konjuge linoleik asit üretim kapasitesitelerinin belirlenmesi
Determination of conjugated linoleic acid production capacities of autochthonous Lactobacillus plantarum strains
ZEYNEP ESRA NUHOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Gıda MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜZİN KABAN
- Tanımlanmış Lactobacillus plantarum suşlarının plazmit profilleri ve bunların bazı özelliklerinin belirlenmesi
Plasmid profiles of the identified strains of Lactobacillus plantarum and determination of their some properties
HİDAYET SAĞLAM
Doktora
Türkçe
2013
Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYNUR GÜL KARAHAN
DOÇ. DR. GÜLGÜN TINAZ
- Lactobacillus plantarum suşlarının inaktive edilmiş ve edilmemiş formlarının antioksidan, antimikrobiyal ve antibiyofilm etkilerinin karşılaştırılması
Comparison of the antioxidant, antimicrobial and antibiofilm effects of inactivated and non-inactivated forms of lactobacillus plantarum strains
ECEM ÖZDURAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyokimyaMarmara ÜniversitesiBiyokimya (Ecz) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZLEM BİNGÖL ÖZAKPINAR
DR. ÖĞR. ÜYESİ PERVİN RAYAMAN
- Yerel Lactobacillus plantarum suşlarının antagonistik aktiviteleri ile teknolojik özelliklerinin belirlenmesi ve fermente sucuk üretiminde Listeria monocytogenes'in gelişimine etkilerinin araştırılması
Determination of antagonistic activities and technological properties of autochthonous Lactobacillus plantarum strains and investigation of their effects on Listeria monocytogenes growth in fermented sucuk production
AYBİKE KAMİLOĞLU
Doktora
Türkçe
2016
Gıda MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MÜKERREM KAYA
- Probiyotik Lactobacillus plantarum BHC03 suşunun sideroforlarının saflaştırılması, tanılanması ve bazı probiyotik özellikleri ile ilişkilerinin incelenmesi
Purification, diagnosis of the siderophorus of the probiotic Lactobacillus plantarum BHC03 strain and investigation of their relationship with some probiotic properties
NAZLICAN COŞGUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyomühendislikTokat Gaziosmanpaşa ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BİLGE HİLAL ÇADIRCI EFELİ