Geri Dön

Ege bölgesinde virus nedenli arı hastalıklarının multipleks polimeraz zincir reaksiyonu ile araştırılması

Investigation of virus-induced bee diseases in aegean region with multiplex polymerase chain reaction

PDF İndir

  1. Tez No: 532789
  2. Yazar: ABDURRAHMAN ANIL ÇAĞIRGAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ZAFER YAZICI
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: mRT-PCR, Bal arısı virusları, Prevalans, Filogenetik, mRT-PCR, Honey bee viruses, Prevalence, Phylogeny
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Viroloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 110

Özet

Amaç: Bu çalışmanın amacı yedi önemli arı virusuna karşı rutin teşhis laboratuvarlarında daha hızlı sonuç elde etmek için multipleks RT-PCR (mRT-PCR) testinin geliştirilmesi ve bu testi kullanarak Ege Bölgesinde bu yedi virus kaynaklı arı viral hastalıklarının tespit edilmesidir. Materyal ve Metot: Bu çalışmanın ilk aşamasında İsrail akut arı felci virusu (IAPV), Deforme kanat virusu (DWV), Sacbrood virusu (SBV), Akut arı felci virusu (ABPV), Siyah kraliçe hücre virusu (BQCV), Kaşmir arı virusu (KBV) ve Kronik arı felci virusu (CBPV) teşhisinde kullanılacak mRT-PCR metodu modifiye edilerek optimizasyonu gerçekleştirildi. İkinci aşamada Ege Bölgesi' nin yedi ilindeki arı işletmelerinden çok aşamalı metot kullanılarak toplanan örnekler yedi virusa karşı geliştirilen mRT-PCR ile test edildi ve pozitif bulunan numunelerin dizi ve filogenetik ağaç analizleri yapıldı. Bulgular: Optimize edilen mRT-PCR metodu için log10 tabanlı seri dilüsyonlarda virus kopya sayısı 2500 kopya/µL olarak tespit edildi. Ege Bölgesinde örnekleme yapılan işletmelerde viral etkenlerin prevalansları DWV % 25.2, BQCV % 20.7, ABPV % 3.6, SBV % 2.7 ve CBPV % 1.8 olarak belirlendi. KBV ve IAPV ise tespit edilmedi. Filogenetik analiz sonucunda bazı genetik benzerlikler ve farklıların oluştuğu gözlemlendi. Sonuç: Multipleks RT-PCR' ın yedi etkeni eş zamanlı olarak tespit etmesi ile ekonomik kazanç ve zaman kazandırdığı, aynı zamanda testin duyarlılığının yüksek olduğu ve rutin analizlerde de bu testin kullanılabileceği sonucuna varıldı. Geliştirilen bu test metodu ile Ege Bölgesi'nde 7 viral etkenin prevalansı belirlendi ve tespit edilen izolatların filogenetik analizi yapılarak akrabalık dereceleri incelendi.

Özet (Çeviri)

Objective: The aim of this study was to develop a multiplex RT-PCR (mRT-PCR) test to obtain faster results in routine diagnostic laboratories for seven important bee viruses and to determine these seven viral virus diseases in Aegean Region using this test. Material and Method: In the first stage of this study, the multiplex RT-PCR method was modified and optimised to develop a fast diagnosis method for IAPV, DWV, SBV, ABPV, BQCV, KBV and CBPV. In second stage, the samples collected from apiaries in the seven provinces of the Aegean Region by choosing the Multi-Step Sampling Method were tested by using multiplex RT-PCR and sequencing and phylogenetic tree analysis of the positive samples were performed. Results: Virus copy numbers were detected to be 2500 copy/ µl when log10 serial dilutions were performed for the optimized mRT- PCR method. The prevalence rates of viral agents were found to be DWV (25.2%), BQCV (20.7%), ABPV (3.6%), SBV (2.7%) and CBPV (1.8%) in the Aegean Region. KBV and IAPV were not detected. Some genetic similarities and differences were observed at the end of phylogenetic analysis. Conclusion: It is concluded that multiplex RT-PCR test can be used in routine analysis because this method has a high level of sensitivity and achieves economic gain and time due to detecting seven agents simultaneously. The prevalence of 7 viral agents was determined with this test method in Aegean Region and phylogenetic analysis was performed to determine the origin and relatedness of obtained isolates.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    411899

    Ege Üniversitesi Etnografya Müzesinde bulunan takıların teknik ve tasarım özelliklerinin incelenmesi

    Ethnographic museum of the University of the Aegean jewellery found properties of technical and design

    MÜJGAN EMRE EROĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Güzel SanatlarDokuz Eylül Üniversitesi

    Tekstil ve Moda Tasarımı Ana Sanat Dalı

    YRD. DOÇ. DR. FÜSUN ÖZPULAT

  2. Tez No

    412039

    S-kapalı uzaylar ve S-kapalı altuzaylar

    S-closed spaces and s-closed subspaces

    AYŞEGÜL ÇAKSU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    MatematikEge Üniversitesi

    Matematik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLHAN ASLIM

  3. Tez No

    412043

    Refleksoloji'nin infantil koliğin giderilmesi üzerine etkisinin incelenmesi

    Study the effect of reflexology on the removal of infantile colic

    SİBEL İÇKE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge Üniversitesi

    Ebelik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. RABİA GENÇ

  4. Tez No

    412117

    Kamu kurumu niteliğinde meslek kuruluşlarında süreç yönetimi: Denizli Ticaret Odası'nda uygulanması

    Process management in professional organisations with public institution status: Application in Denizli Chamber of Commerce

    BİLGE TEKİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    İşletmePamukkale Üniversitesi

    İşletme Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İRFAN ERTUĞRUL

  5. Tez No

    412129

    Aktörler arası ilişkiler, sorunlar ve sonuçlar bakımından Türkiye'de kalkınma ajansları: Güney Ege Kalkınma Ajansı (GEKA) örneği

    Relations between actors, issues and results in terms of development agencies in Turkey: South Aegean Development Agency (GEKA) example

    İSMET AKBAŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    EkonomiPamukkale Üniversitesi

    Siyaset Bilimi ve Kamu Yönetimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN ÖZGÜR

Geri Dön