Deksametazon ilacının antibakteriyel etkilerinin araştırılması, DNA'ya bağlanmasının in vitro ve in siliko analizi
Study of antibacterial effects of dexamethasone drug, in vitro and in silico analysis of its binding to DNA
- Tez No: 549399
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. EBRAHİM VALİPOUR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Genetik, Moleküler Tıp, Pharmacy and Pharmacology, Genetics, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Bağırsak florası, Serum bakır, İn vitro, Intestinal flora, Serum copper, In vitro
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Zonguldak Bülent Ecevit Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Anti-inflamatuar etki gösteren bir ilaç olan deksametazon (Dex) dünya çapında yaygın olarak kullanılmaktadır. Bu nedenle bu çalışmada ilacın DNA ve bazı flora bakteriyel suşları üzerindeki etkisi araştırıldı. Dex'in DNA kırılmalarına etkisi, süpersarmal plazmid DNA'sının Dex ile muamele edilmesi ve ardından agaroz jel elektroforezi ile analiz edildi. Analiz demir, hidrojen peroksit, askorbik asit, demir artı hidrojen peroksit, bakır ve bakır artı askorbik asit varlığında tekrar edilmiştir. Ek olarak, ilaç-DNA etkileşimleri UV-Vis spektrofotometresi ve in siliko yöntemleri kullanılarak çalışılmıştır. İlacın bazı flora bakteri suşları üzerindeki etkisi, disk difüzyonu ve sıvı besiyeri seyreltme yöntemleri ile araştırılmıştır. Bu in vitro çalışmada, ilaç, süpersarmal DNA'yı insan plazmasında bulunanlardan daha yüksek konsantrasyonlarda (1700, 170, 17, 1,7 ve 0,42 µM) bile kırmamıştır. Dex'in DNA üzerindeki etkisi, Asc, H2O2, demir ve bakır varlığında değişmedi. İlacın DNA ile bağlanma sabiti, 7256 1/M olarak elde edildi. İn siliko analizi, ilacın, -5.84'lük bir bağlanma enerjisi ile çift sarmal DNA'nın minör oluğuna bağlandığını, 3 hidrojen bağı ve hidrofobik bağlar yaptığını gösterdi. İlacın 2264 µM'si, E. cloacae, E. coli, E. faecalis ve P. mirabilis koloni oluşturan birimlerini (CFU) sırasıyla % 10, % 23, % 42 ve % 10 arttırmıştır. Aynı zamanda, ilacın 1132 µM'si, E. coli ve E. faecalis'in CFU' sunu sırasıyla % 30 ve % 19 arttırmaktadır. Sonuç olarak, deksametazon, bazı flora bakterilerinde bir artışa neden olurken, in vitro durumda DNA üzerinde herhangi bir etki göstermemektedir.
Özet (Çeviri)
Dexamethasone (Dex), a drug with anti-inflammatory effects, is widely used worldwide. Therefore this study aimed to investigate the effect of the drug on DNA and some flora bacterial strains. Effect of Dex on DNA breakages was analyzed by treating of supercoiled plasmid DNA with Dex and then analysis on agarose gel electrophoresis. The analysis was repeated at the presence of iron, hydrogen peroxide, ascorbic acid, iron plus hydrogen peroxide, copper and copper plus ascorbic acid. In addition, the drug-DNA interactions were studied using UV-Vis spectrophotometer and in-silico methods. Effect of the drug on some flora bacterial strains was investigated by disc diffusion and broth dilution methods. In this in-vitro study, the drug did not break the supercoiled DNA at any concentrations even at higher concentrations (1700, 170, 17, 1,7 and 0,42 µM) than those found in human plasma. The effect of Dex on DNA did not change in the presence of Asc, H2O2, iron and copper. Binding constant of the drug with DNA was obtained as 7256 1/M. In-silico analysis showed bonding of the drug on a minor groove of double helix DNA by the binding energy of almost -5.84, making 3 hydrogen bonds and hydrophobic bonds. 2264 µM of the drug increased colony forming units (CFU) of E. cloacae, E. coli, E. faecalis and P. mirabilis by 10 %, 23 %, 42 % and 10 % respectively. Also, 1132 µM of the drug cause to increase CFU of E. coli and E. faecalis by 30 % and 19 % respectively. In conclusion, dexamethasone causes an increase in some of the flora bacteria while it does not show any effect on DNA in in-vitro condition
Benzer Tezler
- Deksametazon'un model organizma Galleria mellonella L. (mum güvesi)' da bazı enzim aktiviteleri üzerine etkileri
Dexamethasone in the model organism Galleria mellonella L.(candle moth) effects on some enzyme activities
FERHAT ATEŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
FizyolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SAADET PINAR ÖZALP
- Akut bakteriyel menenjit tedavisinde deksametazon'un yeri
Başlık çevirisi yok
PINAR İŞGÜVEN(ORALTAY)
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1990
Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IŞIK YALÇIN
- Deksametazon sodyum fosfat lipozomlarının formülasyonu in vitro salıverilmesi ve in vivo dağılımı üzerinde çalışmalar
Başlık çevirisi yok
JAMİL AL-MUHAMMAD
Yüksek Lisans
Türkçe
1992
Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe ÜniversitesiFarmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. A. ATİLLA HINCAL
- Duygulanım bozukluklarında psikonöroendokrinolojik testler (TRH testi, deksametazon süpresyon testi ve diğer testler)
Başlık çevirisi yok
MUSTAFA BİLİCİ
- Değişik depresyon tiplerinde ve sağlıklı deneklerde karşılaştırmalı olarak deksametazon supresyon testi
Başlık çevirisi yok
İBRAHİM AFİF KARAKILIÇ